RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-203ENST00000439720 KMT2AQ03164 3969 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-203ENST00000439720 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP10-2P60368 255 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-203ENST00000439720 PKHD1P08F94 4074 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP10-1P60331 282 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-203ENST00000439720 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-203ENST00000439720 TPRXLQ17RH7 258 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-203ENST00000439720 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-203ENST00000439720 RYR1P21817 5038 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-203ENST00000439720 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-203ENST00000439720 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.53□□□□□ -1.69
RABGEF1-203ENST00000439720 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPG2P98160 4391 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-203ENST00000439720 Q5VSD8 79 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0D9SG42 100 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf92A6NGG3 77 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1-203ENST00000439720 FAT1Q14517 4588 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1-203ENST00000439720 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1-203ENST00000439720 R4GN34 69 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP10-8P60410 259 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1-203ENST00000439720 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.72
RABGEF1-203ENST00000439720 S4R3F8 94 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1-203ENST00000439720 MT1HL1P0DM35 61 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP12-2P59991 146 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1-203ENST00000439720 TNXBP22105 4242 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1-203ENST00000439720 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1-203ENST00000439720 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1-203ENST00000439720 MYCBP2O75592 4640 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1-203ENST00000439720 XP32Q5T750 250 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP12-1P59990 96 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-203ENST00000439720 PLAC4Q8WY50 150 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC17Q685J3 4493 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1-203ENST00000439720 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1-203ENST00000439720 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1-203ENST00000439720 M0QZ58 72 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1-203ENST00000439720 HERC1Q15751 4861 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1-203ENST00000439720 LPAP08519 4548 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGEF1-203ENST00000439720 PP632Q6XCG6 107 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGEF1-203ENST00000439720 INE1O15225 51 aa3.81□□□□□ -1.8
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RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.79□□□□□ -1.8
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RABGEF1-203ENST00000439720 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGEF1-203ENST00000439720 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGEF1-203ENST00000439720 TNP1P09430 55 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGEF1-203ENST00000439720 MT1HP80294 61 aa3.64□□□□□ -1.83
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RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1-203ENST00000439720 LCE3AQ5TA76 89 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGEF1-203ENST00000439720 MT2AP02795 61 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGEF1-203ENST00000439720 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGEF1-203ENST00000439720 M0R2T5 61 aa3.4□□□□□ -1.86
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC2Q02817 5179 aa3.4□□□□□ -1.86
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.37□□□□□ -1.87
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RABGEF1-203ENST00000439720 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.34□□□□□ -1.87
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RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.34□□□□□ -1.87
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RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.33□□□□□ -1.88
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RABGEF1-203ENST00000439720 LCE1FQ5T754 118 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP10-12P60413 245 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP12-3P60328 96 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGEF1-203ENST00000439720 MT1BP07438 61 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGEF1-203ENST00000439720 LCE1EQ5T753 118 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP10-5P60370 271 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGEF1-203ENST00000439720 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1-203ENST00000439720 MT1XP80297 61 aa3.13□□□□□ -1.91
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