RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP10-10P60014 251 aa2.15□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PPM0 123 aa2.14□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 NREPQ16612 68 aa2.14□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.14□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 H3BT86 120 aa2.13□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAX1BP3O14907 124 aa2.13□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 C5orf47Q569G3 176 aa2.13□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRR15Q8IV56 129 aa2.13□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa2.12□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 hDV103S1A0JD37 113 aa2.12□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 BPY2O14599 106 aa2.12□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDE6GP18545 87 aa2.12□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.12□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPCS1Q9Y6A9 102 aa2.12□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 HCG22E2RYF7 251 aa2.1□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.1□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.09□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GW54 56 aa2.09□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 CASC2Q6XLA1 102 aa2.09□□□□□ -2.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 C4orf26Q17RF5 130 aa2.08□□□□□ -2.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 K7EP34 96 aa2.07□□□□□ -2.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00846Q9NV44 126 aa2.07□□□□□ -2.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.06□□□□□ -2.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa2.06□□□□□ -2.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBL5Q9BZL1 73 aa2.06□□□□□ -2.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.05□□□□□ -2.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.05□□□□□ -2.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.05□□□□□ -2.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 ETDBQ3ZM63 59 aa2.03□□□□□ -2.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 S4R3F8 94 aa2.03□□□□□ -2.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.02□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa2.02□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCA10Q71F78 164 aa2.02□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.01□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAV22A0A0B4J277 110 aa1.99□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 PP632Q6XCG6 107 aa1.99□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 MUC12Q9UKN1 5478 aa1.98□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A087WVE0 104 aa1.98□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 F8W1H4 67 aa1.98□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 H0Y9P7 68 aa1.97□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q5VV11 94 aa1.97□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSAG1Q6PB30 78 aa1.97□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa1.97□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa1.97□□□□□ -2.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 A6NN06 94 aa1.96□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 MT1BP07438 61 aa1.96□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa1.96□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa1.95□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 KMT2DO14686 5537 aa1.95□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLKP1Q107X0 134 aa1.95□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa1.95□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa1.94□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPRR2GQ9BYE4 73 aa1.94□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 IMUPQ9GZP8 106 aa1.94□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEBP20929 6669 aa1.93□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GV90 55 aa1.93□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 MDN1Q9NU22 5596 aa1.92□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATOX1O00244 68 aa1.92□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 UQCRQO14949 82 aa1.92□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSPHP1O15172 72 aa1.92□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACYP1P07311 99 aa1.92□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa1.92□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa1.92□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 LUZP6Q538Z0 58 aa1.92□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00208Q96KT6 92 aa1.92□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFC1O43677 76 aa1.91□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADM2Q7Z4H4 148 aa1.91□□□□□ -2.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00643Q86TS7 51 aa1.9□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 A8MUN3 132 aa1.89□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCGB1A1P11684 91 aa1.89□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPINT4Q6UDR6 99 aa1.89□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 MP68P56378 58 aa1.88□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCE1CQ5T751 118 aa1.88□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.88□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 P0C880 135 aa1.87□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRIPTQ9P021 101 aa1.87□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 M0QZ58 72 aa1.86□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC01554Q52M75 96 aa1.86□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 H0YAA0 97 aa1.85□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 K7ERU9 68 aa1.85□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 DMAC1Q96GE9 116 aa1.85□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 R4GN34 69 aa1.85□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 J3QR89 54 aa1.84□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 MT1XP80297 61 aa1.84□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPRR2FQ96RM1 72 aa1.84□□□□□ -2.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 MT-ATP8P03928 68 aa1.83□□□□□ -2.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.83□□□□□ -2.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 C20orf197Q8N268 126 aa1.82□□□□□ -2.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLAC4Q8WY50 150 aa1.82□□□□□ -2.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRO2289Q9P1D8 64 aa1.82□□□□□ -2.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 H3BPC8 53 aa1.81□□□□□ -2.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPRR2EP22531 72 aa1.81□□□□□ -2.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPRR2BP35325 72 aa1.81□□□□□ -2.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPRR2AP35326 72 aa1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 372.3 ms