RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 KLKP1Q107X0 134 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-206ENST00000431413 ETDBQ3ZM63 59 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-206ENST00000431413 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-206ENST00000431413 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-206ENST00000431413 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-206ENST00000431413 CRIPTQ9P021 101 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-206ENST00000431413 ACYP1P07311 99 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP10-5P60370 271 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-206ENST00000431413 IMUPQ9GZP8 106 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-206ENST00000431413 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-206ENST00000431413 ATOX1O00244 68 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-206ENST00000431413 NDUFC1O43677 76 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-206ENST00000431413 NEBP20929 6669 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-206ENST00000431413 A0A087WVE0 104 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-206ENST00000431413 UQCRQO14949 82 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-206ENST00000431413 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC3-206ENST00000431413 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-206ENST00000431413 H0Y9P7 68 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-206ENST00000431413 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-206ENST00000431413 H0YAA0 97 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-206ENST00000431413 A8MUN3 132 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-206ENST00000431413 A0A1B0GV90 55 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-206ENST00000431413 LCE1DQ5T752 114 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP5-9P26371 169 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-206ENST00000431413 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-206ENST00000431413 LINC00208Q96KT6 92 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-206ENST00000431413 MP68P56378 58 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-206ENST00000431413 LINC00643Q86TS7 51 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-206ENST00000431413 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC3-206ENST00000431413 KMT2DO14686 5537 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC3-206ENST00000431413 MDN1Q9NU22 5596 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC3-206ENST00000431413 PLAC4Q8WY50 150 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC3-206ENST00000431413 J3QR89 54 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-206ENST00000431413 C20orf197Q8N268 126 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-206ENST00000431413 OCR1Q9BZK8 76 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-206ENST00000431413 R4GN34 69 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC3-206ENST00000431413 H3BPC8 53 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC3-206ENST00000431413 MT1XP80297 61 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC3-206ENST00000431413 M0QZ58 72 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC3-206ENST00000431413 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC3-206ENST00000431413 P0C880 135 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-206ENST00000431413 SCGB1A1P11684 91 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-206ENST00000431413 DMAC1Q96GE9 116 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC3-206ENST00000431413 LCE4AQ5TA78 99 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC3-206ENST00000431413 K7ERU9 68 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC3-206ENST00000431413 SPRR2EP22531 72 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC3-206ENST00000431413 SPRR2BP35325 72 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC3-206ENST00000431413 SPRR2AP35326 72 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP12-2P59991 146 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC3-206ENST00000431413 LINC01554Q52M75 96 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC3-206ENST00000431413 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC3-206ENST00000431413 ACYP2P14621 99 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC3-206ENST00000431413 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.18□□□□□ -1.42
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC3-206ENST00000431413 MT-ATP8P03928 68 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-206ENST00000431413 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-206ENST00000431413 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.11□□□□□ -1.43
HERC3-206ENST00000431413 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-206ENST00000431413 SPRR2DP22532 72 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP10-12P60413 245 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-206ENST00000431413 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.97□□□□□ -1.45
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC3-206ENST00000431413 SNURFQ9Y675 71 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC3-206ENST00000431413 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC3-206ENST00000431413 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-206ENST00000431413 SERP2Q8N6R1 65 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-206ENST00000431413 SEC61GP60059 68 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-206ENST00000431413 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-206ENST00000431413 COA5Q86WW8 74 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-206ENST00000431413 COX7CP15954 63 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-206ENST00000431413 A0A0D9SG42 100 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC3-206ENST00000431413 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC3-206ENST00000431413 H3BS24 57 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC3-206ENST00000431413 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.65□□□□□ -1.5
HERC3-206ENST00000431413 A0A1B0GU33 70 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC3-206ENST00000431413 MT1EP04732 61 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC3-206ENST00000431413 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC3-206ENST00000431413 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP12-1P59990 96 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC3-206ENST00000431413 H7BZZ5 65 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC3-206ENST00000431413 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC3-206ENST00000431413 MT1GP13640 62 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC3-206ENST00000431413 PP632Q6XCG6 107 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC3-206ENST00000431413 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.9 ms