RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 LCE3AQ5TA76 89 aa2.9□□□□□ -1.95
ALMS1-201ENST00000423048 FREM2Q5SZK8 3169 aa2.9□□□□□ -1.95
ALMS1-201ENST00000423048 VPS13AQ96RL7 3174 aa2.89□□□□□ -1.95
ALMS1-201ENST00000423048 SPEGQ15772 3267 aa2.88□□□□□ -1.95
ALMS1-201ENST00000423048 ZANQ9Y493 2812 aa2.87□□□□□ -1.95
ALMS1-201ENST00000423048 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
ALMS1-201ENST00000423048 FAT2Q9NYQ8 4349 aa2.86□□□□□ -1.95
ALMS1-201ENST00000423048 HERC2O95714 4834 aa2.86□□□□□ -1.95
ALMS1-201ENST00000423048 LRP1BQ9NZR2 4599 aa2.85□□□□□ -1.95
ALMS1-201ENST00000423048 DNAH11Q96DT5 4516 aa2.84□□□□□ -1.95
ALMS1-201ENST00000423048 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.84□□□□□ -1.95
ALMS1-201ENST00000423048 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.84□□□□□ -1.96
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ALMS1-201ENST00000423048 MT1HP80294 61 aa2.82□□□□□ -1.96
ALMS1-201ENST00000423048 COL7A1Q02388 2944 aa2.81□□□□□ -1.96
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ALMS1-201ENST00000423048 DNAH8Q96JB1 4490 aa2.78□□□□□ -1.97
ALMS1-201ENST00000423048 VPS13DQ5THJ4 4388 aa2.77□□□□□ -1.97
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ALMS1-201ENST00000423048 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.77□□□□□ -1.97
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ALMS1-201ENST00000423048 DNAH9Q9NYC9 4486 aa2.75□□□□□ -1.97
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ALMS1-201ENST00000423048 CMYA5Q8N3K9 4069 aa2.74□□□□□ -1.97
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ALMS1-201ENST00000423048 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa2.73□□□□□ -1.97
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.7□□□□□ -1.98
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ALMS1-201ENST00000423048 RYR2Q92736 4967 aa2.67□□□□□ -1.98
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ALMS1-201ENST00000423048 LCE2CQ5TA81 110 aa2.66□□□□□ -1.98
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ALMS1-201ENST00000423048 ABCA13Q86UQ4 5058 aa2.59□□□□□ -1.99
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ALMS1-201ENST00000423048 CSMD1Q96PZ7 3565 aa2.57□□□□□ -2
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ALMS1-201ENST00000423048 MT1LQ93083 61 aa2.53□□□□□ -2.01
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.52□□□□□ -2.01
ALMS1-201ENST00000423048 MT1EP04732 61 aa2.52□□□□□ -2.01
ALMS1-201ENST00000423048 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
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ALMS1-201ENST00000423048 ANK2Q01484 3957 aa2.51□□□□□ -2.01
ALMS1-201ENST00000423048 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
ALMS1-201ENST00000423048 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.48□□□□□ -2.01
ALMS1-201ENST00000423048 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa2.48□□□□□ -2.01
ALMS1-201ENST00000423048 CUBNO60494 3623 aa2.47□□□□□ -2.01
ALMS1-201ENST00000423048 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa2.47□□□□□ -2.01
ALMS1-201ENST00000423048 SPRR2EP22531 72 aa2.47□□□□□ -2.01
ALMS1-201ENST00000423048 SPRR2BP35325 72 aa2.47□□□□□ -2.01
ALMS1-201ENST00000423048 SPRR2AP35326 72 aa2.47□□□□□ -2.01
ALMS1-201ENST00000423048 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.47□□□□□ -2.01
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
ALMS1-201ENST00000423048 MUC17Q685J3 4493 aa2.45□□□□□ -2.02
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ALMS1-201ENST00000423048 SPRR2DP22532 72 aa2.42□□□□□ -2.02
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.42□□□□□ -2.02
ALMS1-201ENST00000423048 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa2.42□□□□□ -2.02
ALMS1-201ENST00000423048 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa2.42□□□□□ -2.02
ALMS1-201ENST00000423048 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.41□□□□□ -2.02
ALMS1-201ENST00000423048 LCE2BO14633 110 aa2.41□□□□□ -2.02
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP12-4P60329 112 aa2.41□□□□□ -2.02
ALMS1-201ENST00000423048 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.41□□□□□ -2.02
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.4□□□□□ -2.02
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.4□□□□□ -2.02
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.4□□□□□ -2.02
ALMS1-201ENST00000423048 LRP2P98164 4655 aa2.39□□□□□ -2.03
ALMS1-201ENST00000423048 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.36□□□□□ -2.03
ALMS1-201ENST00000423048 VPS13CQ709C8 3753 aa2.36□□□□□ -2.03
ALMS1-201ENST00000423048 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
ALMS1-201ENST00000423048 PKHD1P08F94 4074 aa2.34□□□□□ -2.04
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