RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421202.5

CCDC18-AS1-205, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC18-AS1, Length 2,973 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.49□□□□□ -1.85
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.49□□□□□ -1.85
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MYCBP2O75592 4640 aa3.49□□□□□ -1.85
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HRES1P13985 223 aa3.48□□□□□ -1.85
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.47□□□□□ -1.85
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MT1HL1P0DM35 61 aa3.43□□□□□ -1.86
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CRIPTQ9P021 101 aa3.43□□□□□ -1.86
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.4□□□□□ -1.87
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ACYP2P14621 99 aa3.39□□□□□ -1.87
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 A0A0G2JQZ4 141 aa3.38□□□□□ -1.87
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.37□□□□□ -1.87
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.35□□□□□ -1.87
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TNXBP22105 4242 aa3.33□□□□□ -1.88
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.29□□□□□ -1.88
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LCE3BQ5TA77 95 aa3.27□□□□□ -1.89
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.18□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.17□□□□□ -1.9
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MUC2Q02817 5179 aa3.06□□□□□ -1.92
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LCE1DQ5T752 114 aa3.01□□□□□ -1.93
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.94□□□□□ -1.94
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CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KRTAP10-12P60413 245 aa2.88□□□□□ -1.95
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PP632Q6XCG6 107 aa2.88□□□□□ -1.95
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.88□□□□□ -1.95
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.87□□□□□ -1.95
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.84□□□□□ -1.96
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.82□□□□□ -1.96
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 M0R2T5 61 aa2.82□□□□□ -1.96
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 S4R3F8 94 aa2.79□□□□□ -1.96
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 A0A0D9SG42 100 aa2.76□□□□□ -1.97
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.76□□□□□ -1.97
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.75□□□□□ -1.97
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.72□□□□□ -1.97
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.71□□□□□ -1.98
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MT2AP02795 61 aa2.7□□□□□ -1.98
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.7□□□□□ -1.98
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KRTAP12-1P59990 96 aa2.67□□□□□ -1.98
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