RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.38□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.37□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 H3BPC8 53 aa3.37□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 NDUFC1O43677 76 aa3.37□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.36□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 PSPHP1O15172 72 aa3.36□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 MP68P56378 58 aa3.36□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 LINC00313P59037 77 aa3.36□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM258P61165 79 aa3.36□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.36□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.36□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 SNURFQ9Y675 71 aa3.36□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 BRK1Q8WUW1 75 aa3.35□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 HERC1Q15751 4861 aa3.34□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.34□□□□□ -1.87
C6orf48-208ENST00000395788 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 H0Y9P7 68 aa3.33□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 MT1HL1P0DM35 61 aa3.33□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 MUC2Q02817 5179 aa3.32□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 A8MUN3 132 aa3.32□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP10-12P60413 245 aa3.31□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 Q5W150 140 aa3.31□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 LINC00208Q96KT6 92 aa3.31□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.31□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 LCA10Q71F78 164 aa3.3□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.3□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 A8MUU9 505 aa3.29□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.29□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.29□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.28□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.28□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 MYCBP2O75592 4640 aa3.28□□□□□ -1.88
C6orf48-208ENST00000395788 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.27□□□□□ -1.89
C6orf48-208ENST00000395788 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.26□□□□□ -1.89
C6orf48-208ENST00000395788 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.26□□□□□ -1.89
C6orf48-208ENST00000395788 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
C6orf48-208ENST00000395788 C9orf92A6NGG3 77 aa3.23□□□□□ -1.89
C6orf48-208ENST00000395788 PCOTHQ58A44 107 aa3.22□□□□□ -1.89
C6orf48-208ENST00000395788 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.21□□□□□ -1.9
C6orf48-208ENST00000395788 HRES1P13985 223 aa3.2□□□□□ -1.9
C6orf48-208ENST00000395788 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
C6orf48-208ENST00000395788 LINC01554Q52M75 96 aa3.2□□□□□ -1.9
C6orf48-208ENST00000395788 PRR4Q16378 134 aa3.19□□□□□ -1.9
C6orf48-208ENST00000395788 TPRXLQ17RH7 258 aa3.19□□□□□ -1.9
C6orf48-208ENST00000395788 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.19□□□□□ -1.9
C6orf48-208ENST00000395788 DMAC1Q96GE9 116 aa3.18□□□□□ -1.9
C6orf48-208ENST00000395788 PRAC1Q96KF2 57 aa3.18□□□□□ -1.9
C6orf48-208ENST00000395788 COA5Q86WW8 74 aa3.16□□□□□ -1.9
C6orf48-208ENST00000395788 SPINK7P58062 85 aa3.15□□□□□ -1.91
C6orf48-208ENST00000395788 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.15□□□□□ -1.91
C6orf48-208ENST00000395788 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.15□□□□□ -1.91
C6orf48-208ENST00000395788 ACYP2P14621 99 aa3.14□□□□□ -1.91
C6orf48-208ENST00000395788 MUC17Q685J3 4493 aa3.13□□□□□ -1.91
C6orf48-208ENST00000395788 Q1T7F1 81 aa3.12□□□□□ -1.91
C6orf48-208ENST00000395788 LRP2P98164 4655 aa3.11□□□□□ -1.91
C6orf48-208ENST00000395788 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.1□□□□□ -1.91
C6orf48-208ENST00000395788 LPAP08519 4548 aa3.1□□□□□ -1.91
C6orf48-208ENST00000395788 RNF213Q63HN8 5207 aa3.09□□□□□ -1.91
C6orf48-208ENST00000395788 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.08□□□□□ -1.92
C6orf48-208ENST00000395788 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.08□□□□□ -1.92
C6orf48-208ENST00000395788 A6NN06 94 aa3.07□□□□□ -1.92
C6orf48-208ENST00000395788 K7ERS5 55 aa3.06□□□□□ -1.92
C6orf48-208ENST00000395788 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.05□□□□□ -1.92
C6orf48-208ENST00000395788 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.05□□□□□ -1.92
C6orf48-208ENST00000395788 LUZP6Q538Z0 58 aa3.05□□□□□ -1.92
C6orf48-208ENST00000395788 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.04□□□□□ -1.92
C6orf48-208ENST00000395788 Q5VV11 94 aa3.03□□□□□ -1.92
C6orf48-208ENST00000395788 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.03□□□□□ -1.92
C6orf48-208ENST00000395788 A6NED7 52 aa3.01□□□□□ -1.93
C6orf48-208ENST00000395788 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.01□□□□□ -1.93
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.01□□□□□ -1.93
C6orf48-208ENST00000395788 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3□□□□□ -1.93
C6orf48-208ENST00000395788 LCE3AQ5TA76 89 aa3□□□□□ -1.93
C6orf48-208ENST00000395788 ADM2Q7Z4H4 148 aa3□□□□□ -1.93
C6orf48-208ENST00000395788 PRR15LQ9BU68 103 aa3□□□□□ -1.93
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.99□□□□□ -1.93
C6orf48-208ENST00000395788 LCE1FQ5T754 118 aa2.98□□□□□ -1.93
C6orf48-208ENST00000395788 S4R3F8 94 aa2.97□□□□□ -1.93
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1B0GU69 56 aa2.96□□□□□ -1.94
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP5-8O75690 187 aa2.93□□□□□ -1.94
C6orf48-208ENST00000395788 ROMO1P60602 79 aa2.93□□□□□ -1.94
C6orf48-208ENST00000395788 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
C6orf48-208ENST00000395788 CSAG1Q6PB30 78 aa2.91□□□□□ -1.94
C6orf48-208ENST00000395788 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.91□□□□□ -1.94
C6orf48-208ENST00000395788 H0YAA0 97 aa2.9□□□□□ -1.95
C6orf48-208ENST00000395788 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.9□□□□□ -1.95
C6orf48-208ENST00000395788 UQCR11O14957 56 aa2.89□□□□□ -1.95
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1B0GU33 70 aa2.88□□□□□ -1.95
C6orf48-208ENST00000395788 A8MU10 97 aa2.88□□□□□ -1.95
C6orf48-208ENST00000395788 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.86□□□□□ -1.95
C6orf48-208ENST00000395788 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.86□□□□□ -1.95
C6orf48-208ENST00000395788 P0C880 135 aa2.85□□□□□ -1.95
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.82□□□□□ -1.96
C6orf48-208ENST00000395788 M0QZ58 72 aa2.8□□□□□ -1.96
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
C6orf48-208ENST00000395788 MT1HP80294 61 aa2.79□□□□□ -1.96
C6orf48-208ENST00000395788 NDUFAF8A1L188 74 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms