RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP10-10P60014 251 aa6.6□□□□□ -1.35
CTIF-202ENST00000382998 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.57□□□□□ -1.36
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CTIF-202ENST00000382998 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.55□□□□□ -1.36
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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CTIF-202ENST00000382998 LYSTQ99698 3801 aa6.48□□□□□ -1.37
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CTIF-202ENST00000382998 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.4□□□□□ -1.39
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CTIF-202ENST00000382998 PKD1P98161 4303 aa5.75□□□□□ -1.49
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CTIF-202ENST00000382998 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.12□□□□□ -1.59
CTIF-202ENST00000382998 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.09□□□□□ -1.59
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CTIF-202ENST00000382998 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.85□□□□□ -1.63
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CTIF-202ENST00000382998 SPRR2AP35326 72 aa4.84□□□□□ -1.63
CTIF-202ENST00000382998 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.79□□□□□ -1.64
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.79□□□□□ -1.64
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.76□□□□□ -1.65
CTIF-202ENST00000382998 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CTIF-202ENST00000382998 SPRR2DP22532 72 aa4.66□□□□□ -1.66
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.61□□□□□ -1.67
CTIF-202ENST00000382998 MT3P25713 68 aa4.56□□□□□ -1.68
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