RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.11□□□□□ -1.59
TTPAL-202ENST00000372904 A6NN06 94 aa5.1□□□□□ -1.59
TTPAL-202ENST00000372904 MT1HL1P0DM35 61 aa5.09□□□□□ -1.59
TTPAL-202ENST00000372904 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.09□□□□□ -1.59
TTPAL-202ENST00000372904 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
TTPAL-202ENST00000372904 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.06□□□□□ -1.6
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.04□□□□□ -1.6
TTPAL-202ENST00000372904 H0YAA0 97 aa5.04□□□□□ -1.6
TTPAL-202ENST00000372904 PLAC4Q8WY50 150 aa5.03□□□□□ -1.6
TTPAL-202ENST00000372904 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.02□□□□□ -1.61
TTPAL-202ENST00000372904 HYDINQ4G0P3 5121 aa5□□□□□ -1.61
TTPAL-202ENST00000372904 P0C880 135 aa5□□□□□ -1.61
TTPAL-202ENST00000372904 FAT1Q14517 4588 aa4.97□□□□□ -1.61
TTPAL-202ENST00000372904 PKD1P98161 4303 aa4.92□□□□□ -1.62
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.91□□□□□ -1.62
TTPAL-202ENST00000372904 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
TTPAL-202ENST00000372904 PKHD1P08F94 4074 aa4.86□□□□□ -1.63
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP10-10P60014 251 aa4.85□□□□□ -1.63
TTPAL-202ENST00000372904 RYR2Q92736 4967 aa4.82□□□□□ -1.64
TTPAL-202ENST00000372904 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.81□□□□□ -1.64
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP12-2P59991 146 aa4.8□□□□□ -1.64
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.79□□□□□ -1.64
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.79□□□□□ -1.64
TTPAL-202ENST00000372904 HSPG2P98160 4391 aa4.78□□□□□ -1.64
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.77□□□□□ -1.65
TTPAL-202ENST00000372904 TNP1P09430 55 aa4.76□□□□□ -1.65
TTPAL-202ENST00000372904 NDUFAF8A1L188 74 aa4.74□□□□□ -1.65
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP12-1P59990 96 aa4.7□□□□□ -1.66
TTPAL-202ENST00000372904 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TTPAL-202ENST00000372904 RYR1P21817 5038 aa4.69□□□□□ -1.66
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.69□□□□□ -1.66
TTPAL-202ENST00000372904 RYR3Q15413 4870 aa4.69□□□□□ -1.66
TTPAL-202ENST00000372904 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.68□□□□□ -1.66
TTPAL-202ENST00000372904 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.67□□□□□ -1.66
TTPAL-202ENST00000372904 TNXBP22105 4242 aa4.64□□□□□ -1.67
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.64□□□□□ -1.67
TTPAL-202ENST00000372904 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TTPAL-202ENST00000372904 PP632Q6XCG6 107 aa4.57□□□□□ -1.68
TTPAL-202ENST00000372904 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.57□□□□□ -1.68
TTPAL-202ENST00000372904 MYCBP2O75592 4640 aa4.56□□□□□ -1.68
TTPAL-202ENST00000372904 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TTPAL-202ENST00000372904 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.54□□□□□ -1.68
TTPAL-202ENST00000372904 LPAP08519 4548 aa4.51□□□□□ -1.69
TTPAL-202ENST00000372904 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
TTPAL-202ENST00000372904 MT1HP80294 61 aa4.4□□□□□ -1.7
TTPAL-202ENST00000372904 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.39□□□□□ -1.71
TTPAL-202ENST00000372904 HERC2O95714 4834 aa4.37□□□□□ -1.71
TTPAL-202ENST00000372904 LRP2P98164 4655 aa4.34□□□□□ -1.71
TTPAL-202ENST00000372904 MUC17Q685J3 4493 aa4.27□□□□□ -1.73
TTPAL-202ENST00000372904 MT2AP02795 61 aa4.26□□□□□ -1.73
TTPAL-202ENST00000372904 MT1FP04733 61 aa4.23□□□□□ -1.73
TTPAL-202ENST00000372904 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.23□□□□□ -1.73
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP10-12P60413 245 aa4.22□□□□□ -1.73
TTPAL-202ENST00000372904 LCE3AQ5TA76 89 aa4.19□□□□□ -1.74
TTPAL-202ENST00000372904 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.18□□□□□ -1.74
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.17□□□□□ -1.74
TTPAL-202ENST00000372904 HERC1Q15751 4861 aa4.17□□□□□ -1.74
TTPAL-202ENST00000372904 LCE2CQ5TA81 110 aa4.13□□□□□ -1.75
TTPAL-202ENST00000372904 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.07□□□□□ -1.76
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP12-3P60328 96 aa4.07□□□□□ -1.76
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.07□□□□□ -1.76
TTPAL-202ENST00000372904 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.05□□□□□ -1.76
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.04□□□□□ -1.76
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.03□□□□□ -1.76
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.94□□□□□ -1.78
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.92□□□□□ -1.78
TTPAL-202ENST00000372904 MT1BP07438 61 aa3.91□□□□□ -1.78
TTPAL-202ENST00000372904 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.91□□□□□ -1.78
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.9□□□□□ -1.78
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
TTPAL-202ENST00000372904 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.89□□□□□ -1.79
TTPAL-202ENST00000372904 MT1XP80297 61 aa3.89□□□□□ -1.79
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP10-5P60370 271 aa3.87□□□□□ -1.79
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.86□□□□□ -1.79
TTPAL-202ENST00000372904 INE1O15225 51 aa3.85□□□□□ -1.79
TTPAL-202ENST00000372904 MUC2Q02817 5179 aa3.84□□□□□ -1.79
TTPAL-202ENST00000372904 RNF213Q63HN8 5207 aa3.83□□□□□ -1.8
TTPAL-202ENST00000372904 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.82□□□□□ -1.8
TTPAL-202ENST00000372904 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.79□□□□□ -1.8
TTPAL-202ENST00000372904 LCE2BO14633 110 aa3.78□□□□□ -1.8
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.72□□□□□ -1.81
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.72□□□□□ -1.81
TTPAL-202ENST00000372904 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.71□□□□□ -1.82
TTPAL-202ENST00000372904 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.69□□□□□ -1.82
TTPAL-202ENST00000372904 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
TTPAL-202ENST00000372904 SPRR2EP22531 72 aa3.5□□□□□ -1.85
TTPAL-202ENST00000372904 SPRR2BP35325 72 aa3.5□□□□□ -1.85
TTPAL-202ENST00000372904 SPRR2AP35326 72 aa3.5□□□□□ -1.85
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.5□□□□□ -1.85
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.47□□□□□ -1.85
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.47□□□□□ -1.85
TTPAL-202ENST00000372904 MT1GP13640 62 aa3.46□□□□□ -1.86
TTPAL-202ENST00000372904 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.45□□□□□ -1.86
TTPAL-202ENST00000372904 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TTPAL-202ENST00000372904 MT1EP04732 61 aa3.43□□□□□ -1.86
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.42□□□□□ -1.86
TTPAL-202ENST00000372904 MT1LQ93083 61 aa3.42□□□□□ -1.86
TTPAL-202ENST00000372904 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms