RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.69□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC00483Q53H64 154 aa3.69□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A8MUU9 505 aa3.69□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDE6GP18545 87 aa3.69□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A087WSZ3 146 aa3.68□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A1W2PNM2 257 aa3.68□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.68□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DSCR10P59022 87 aa3.68□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.68□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.67□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.67□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 K7ERS5 55 aa3.67□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A1B0GW54 56 aa3.65□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ROMO1P60602 79 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.65□□□□□ -1.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.63□□□□□ -1.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TNXBP22105 4242 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q8N9L7 120 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NDUFB1O75438 58 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGKV4-1P06312 121 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CSAG1Q6PB30 78 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC00208Q96KT6 92 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.59□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPINK1P00995 79 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF213Q63HN8 5207 aa3.57□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.57□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPINK7P58062 85 aa3.57□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.57□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.56□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP10-8P60410 259 aa3.56□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LPAP08519 4548 aa3.56□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRP2P98164 4655 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 K7EQZ3 153 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 P0C880 135 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LCE1FQ5T754 118 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.53□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q96NJ1 140 aa3.53□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MT1HL1P0DM35 61 aa3.53□□□□□ -1.84
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C9orf92A6NGG3 77 aa3.52□□□□□ -1.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COA5Q86WW8 74 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H3BPC8 53 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H0Y9P7 68 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MUC2Q02817 5179 aa3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.46□□□□□ -1.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MT3P25713 68 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A1B0GU33 70 aa3.4□□□□□ -1.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 R4GN34 69 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UQCR11O14957 56 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TPRXLQ17RH7 258 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DMAC1Q96GE9 116 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCOTHQ58A44 107 aa3.33□□□□□ -1.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.32□□□□□ -1.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HRES1P13985 223 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A1B0GU69 56 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ACYP2P14621 99 aa3.2□□□□□ -1.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.2□□□□□ -1.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.19□□□□□ -1.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP10-12P60413 245 aa3.19□□□□□ -1.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MUC17Q685J3 4493 aa3.18□□□□□ -1.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.15□□□□□ -1.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CRIPTQ9P021 101 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 S4R3F8 94 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 M0R2T5 61 aa3.09□□□□□ -1.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H0YAA0 97 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.02□□□□□ -1.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MT1HP80294 61 aa2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USH2AO75445 5202 aa2.96□□□□□ -1.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP10-10P60014 251 aa2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLAC4Q8WY50 150 aa2.9□□□□□ -1.94
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A0D9SG42 100 aa2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC3L-201ENST00000356128 M0QZ58 72 aa2.88□□□□□ -1.95
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SSPOA2VEC9 5147 aa2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP10-5P60370 271 aa2.87□□□□□ -1.95
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MT2AP02795 61 aa2.85□□□□□ -1.95
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MT1FP04733 61 aa2.84□□□□□ -1.95
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