RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-201ENST00000351328 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-201ENST00000351328 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 A0A0G2JQZ4 141 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 SPRR1BP22528 89 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 MYCBP2O75592 4640 aa4□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 FAT3Q8TDW7 4589 aa4□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 KRTAP10-8P60410 259 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 Q96NJ1 140 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 MT1HL1P0DM35 61 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 TNXBP22105 4242 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.97□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 IGFL1Q6UW32 110 aa3.96□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.96□□□□□ -1.77
CS-201ENST00000351328 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-201ENST00000351328 A0A1B0GU33 70 aa3.91□□□□□ -1.78
CS-201ENST00000351328 SPINK1P00995 79 aa3.9□□□□□ -1.78
CS-201ENST00000351328 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
CS-201ENST00000351328 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
CS-201ENST00000351328 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
CS-201ENST00000351328 H0YAA0 97 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-201ENST00000351328 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-201ENST00000351328 HERC1Q15751 4861 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-201ENST00000351328 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.82□□□□□ -1.8
CS-201ENST00000351328 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-201ENST00000351328 TPRXLQ17RH7 258 aa3.79□□□□□ -1.8
CS-201ENST00000351328 CRIPTQ9P021 101 aa3.78□□□□□ -1.81
CS-201ENST00000351328 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.78□□□□□ -1.81
CS-201ENST00000351328 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-201ENST00000351328 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-201ENST00000351328 IGKV2-30P06310 120 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-201ENST00000351328 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.73□□□□□ -1.81
CS-201ENST00000351328 LPAP08519 4548 aa3.71□□□□□ -1.82
CS-201ENST00000351328 C9orf92A6NGG3 77 aa3.7□□□□□ -1.82
CS-201ENST00000351328 LRP2P98164 4655 aa3.7□□□□□ -1.82
CS-201ENST00000351328 PLAC4Q8WY50 150 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-201ENST00000351328 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CS-201ENST00000351328 XP32Q5T750 250 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-201ENST00000351328 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.61□□□□□ -1.83
CS-201ENST00000351328 MUC17Q685J3 4493 aa3.61□□□□□ -1.83
CS-201ENST00000351328 R4GN34 69 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-201ENST00000351328 INE1O15225 51 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-201ENST00000351328 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.59□□□□□ -1.84
CS-201ENST00000351328 RNF213Q63HN8 5207 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-201ENST00000351328 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-201ENST00000351328 MUC2Q02817 5179 aa3.53□□□□□ -1.84
CS-201ENST00000351328 S4R3F8 94 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-201ENST00000351328 KRTAP12-2P59991 146 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-201ENST00000351328 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.44□□□□□ -1.86
CS-201ENST00000351328 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.42□□□□□ -1.86
CS-201ENST00000351328 A0A0D9SG42 100 aa3.41□□□□□ -1.86
CS-201ENST00000351328 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
CS-201ENST00000351328 PP632Q6XCG6 107 aa3.38□□□□□ -1.87
CS-201ENST00000351328 MT1HP80294 61 aa3.36□□□□□ -1.87
CS-201ENST00000351328 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.33□□□□□ -1.88
CS-201ENST00000351328 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CS-201ENST00000351328 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.32□□□□□ -1.88
CS-201ENST00000351328 M0R2T5 61 aa3.32□□□□□ -1.88
CS-201ENST00000351328 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-201ENST00000351328 KRTAP12-1P59990 96 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-201ENST00000351328 M0QZ58 72 aa3.23□□□□□ -1.89
CS-201ENST00000351328 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.22□□□□□ -1.89
CS-201ENST00000351328 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.22□□□□□ -1.89
CS-201ENST00000351328 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.22□□□□□ -1.89
CS-201ENST00000351328 MT2AP02795 61 aa3.18□□□□□ -1.9
CS-201ENST00000351328 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.17□□□□□ -1.9
CS-201ENST00000351328 MT1FP04733 61 aa3.16□□□□□ -1.9
CS-201ENST00000351328 KRTAP10-10P60014 251 aa3.16□□□□□ -1.9
CS-201ENST00000351328 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.11□□□□□ -1.91
CS-201ENST00000351328 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-201ENST00000351328 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.05□□□□□ -1.92
CS-201ENST00000351328 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.04□□□□□ -1.92
CS-201ENST00000351328 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-201ENST00000351328 USH2AO75445 5202 aa3□□□□□ -1.93
CS-201ENST00000351328 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.99□□□□□ -1.93
CS-201ENST00000351328 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.96□□□□□ -1.94
CS-201ENST00000351328 MT1BP07438 61 aa2.96□□□□□ -1.94
CS-201ENST00000351328 SSPOA2VEC9 5147 aa2.92□□□□□ -1.94
CS-201ENST00000351328 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.92□□□□□ -1.94
CS-201ENST00000351328 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.91□□□□□ -1.94
CS-201ENST00000351328 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.88□□□□□ -1.95
CS-201ENST00000351328 TNP1P09430 55 aa2.88□□□□□ -1.95
CS-201ENST00000351328 LCE4AQ5TA78 99 aa2.86□□□□□ -1.95
CS-201ENST00000351328 KRTAP10-5P60370 271 aa2.85□□□□□ -1.95
CS-201ENST00000351328 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
CS-201ENST00000351328 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.84□□□□□ -1.96
CS-201ENST00000351328 MT1XP80297 61 aa2.82□□□□□ -1.96
CS-201ENST00000351328 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.78□□□□□ -1.96
CS-201ENST00000351328 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CS-201ENST00000351328 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.75□□□□□ -1.97
CS-201ENST00000351328 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.74□□□□□ -1.97
CS-201ENST00000351328 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CS-201ENST00000351328 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.7□□□□□ -1.98
CS-201ENST00000351328 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CS-201ENST00000351328 KRTAP10-12P60413 245 aa2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms