RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.47□□□□□ -1.85
CCR6-201ENST00000341935 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.47□□□□□ -1.85
CCR6-201ENST00000341935 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.47□□□□□ -1.85
CCR6-201ENST00000341935 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.47□□□□□ -1.85
CCR6-201ENST00000341935 HERC1Q15751 4861 aa3.47□□□□□ -1.85
CCR6-201ENST00000341935 SPINK1P00995 79 aa3.46□□□□□ -1.86
CCR6-201ENST00000341935 ACYP2P14621 99 aa3.46□□□□□ -1.86
CCR6-201ENST00000341935 DSCR10P59022 87 aa3.46□□□□□ -1.86
CCR6-201ENST00000341935 A0A1B0GVX0 72 aa3.46□□□□□ -1.86
CCR6-201ENST00000341935 HRES1P13985 223 aa3.45□□□□□ -1.86
CCR6-201ENST00000341935 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP10-8P60410 259 aa3.45□□□□□ -1.86
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.45□□□□□ -1.86
CCR6-201ENST00000341935 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CCR6-201ENST00000341935 HERC2O95714 4834 aa3.43□□□□□ -1.86
CCR6-201ENST00000341935 Q5W150 140 aa3.41□□□□□ -1.86
CCR6-201ENST00000341935 MT1HL1P0DM35 61 aa3.41□□□□□ -1.86
CCR6-201ENST00000341935 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.39□□□□□ -1.87
CCR6-201ENST00000341935 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.38□□□□□ -1.87
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CCR6-201ENST00000341935 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CCR6-201ENST00000341935 C9orf92A6NGG3 77 aa3.32□□□□□ -1.88
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.29□□□□□ -1.88
CCR6-201ENST00000341935 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.28□□□□□ -1.88
CCR6-201ENST00000341935 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.27□□□□□ -1.89
CCR6-201ENST00000341935 LRP2P98164 4655 aa3.27□□□□□ -1.89
CCR6-201ENST00000341935 TPRXLQ17RH7 258 aa3.25□□□□□ -1.89
CCR6-201ENST00000341935 XP32Q5T750 250 aa3.25□□□□□ -1.89
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.23□□□□□ -1.89
CCR6-201ENST00000341935 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
CCR6-201ENST00000341935 LPAP08519 4548 aa3.22□□□□□ -1.89
CCR6-201ENST00000341935 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.22□□□□□ -1.89
CCR6-201ENST00000341935 R4GN34 69 aa3.21□□□□□ -1.9
CCR6-201ENST00000341935 IGKV2-30P06310 120 aa3.2□□□□□ -1.9
CCR6-201ENST00000341935 A0A1B0GU33 70 aa3.2□□□□□ -1.9
CCR6-201ENST00000341935 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.19□□□□□ -1.9
CCR6-201ENST00000341935 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.16□□□□□ -1.9
CCR6-201ENST00000341935 H0YAA0 97 aa3.13□□□□□ -1.91
CCR6-201ENST00000341935 LCE2BO14633 110 aa3.13□□□□□ -1.91
CCR6-201ENST00000341935 A0A0D9SG42 100 aa3.1□□□□□ -1.91
CCR6-201ENST00000341935 PLAC4Q8WY50 150 aa3.09□□□□□ -1.92
CCR6-201ENST00000341935 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.09□□□□□ -1.92
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.08□□□□□ -1.92
CCR6-201ENST00000341935 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.07□□□□□ -1.92
CCR6-201ENST00000341935 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.07□□□□□ -1.92
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.07□□□□□ -1.92
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.99□□□□□ -1.93
CCR6-201ENST00000341935 S4R3F8 94 aa2.99□□□□□ -1.93
CCR6-201ENST00000341935 RNF213Q63HN8 5207 aa2.98□□□□□ -1.93
CCR6-201ENST00000341935 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.98□□□□□ -1.93
CCR6-201ENST00000341935 MUC2Q02817 5179 aa2.98□□□□□ -1.93
CCR6-201ENST00000341935 LCE2CQ5TA81 110 aa2.93□□□□□ -1.94
CCR6-201ENST00000341935 MT1HP80294 61 aa2.88□□□□□ -1.95
CCR6-201ENST00000341935 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.87□□□□□ -1.95
CCR6-201ENST00000341935 M0QZ58 72 aa2.85□□□□□ -1.95
CCR6-201ENST00000341935 INE1O15225 51 aa2.85□□□□□ -1.95
CCR6-201ENST00000341935 M0R2T5 61 aa2.84□□□□□ -1.95
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
CCR6-201ENST00000341935 PP632Q6XCG6 107 aa2.83□□□□□ -1.96
CCR6-201ENST00000341935 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
CCR6-201ENST00000341935 LORP23490 312 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa2.77□□□□□ -1.97
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.76□□□□□ -1.97
CCR6-201ENST00000341935 MT2AP02795 61 aa2.76□□□□□ -1.97
CCR6-201ENST00000341935 MT1FP04733 61 aa2.74□□□□□ -1.97
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP12-2P59991 146 aa2.73□□□□□ -1.97
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP10-10P60014 251 aa2.73□□□□□ -1.97
CCR6-201ENST00000341935 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.68□□□□□ -1.98
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa2.68□□□□□ -1.98
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.67□□□□□ -1.98
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP12-1P59990 96 aa2.65□□□□□ -1.98
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.62□□□□□ -1.99
CCR6-201ENST00000341935 MT1BP07438 61 aa2.58□□□□□ -2
CCR6-201ENST00000341935 LOC100996750A0A140TA64 210 aa2.56□□□□□ -2
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.56□□□□□ -2
CCR6-201ENST00000341935 TNP1P09430 55 aa2.53□□□□□ -2
CCR6-201ENST00000341935 LCE3BQ5TA77 95 aa2.52□□□□□ -2.01
CCR6-201ENST00000341935 USH2AO75445 5202 aa2.52□□□□□ -2.01
CCR6-201ENST00000341935 SSPOA2VEC9 5147 aa2.5□□□□□ -2.01
CCR6-201ENST00000341935 MT1XP80297 61 aa2.5□□□□□ -2.01
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP10-5P60370 271 aa2.5□□□□□ -2.01
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.45□□□□□ -2.02
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.45□□□□□ -2.02
CCR6-201ENST00000341935 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.4□□□□□ -2.03
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.39□□□□□ -2.03
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.38□□□□□ -2.03
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP10-12P60413 245 aa2.37□□□□□ -2.03
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
CCR6-201ENST00000341935 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.36□□□□□ -2.03
CCR6-201ENST00000341935 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.36□□□□□ -2.03
CCR6-201ENST00000341935 LCE3AQ5TA76 89 aa2.35□□□□□ -2.03
CCR6-201ENST00000341935 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.31□□□□□ -2.04
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.3□□□□□ -2.04
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.28□□□□□ -2.04
CCR6-201ENST00000341935 KMT2DO14686 5537 aa2.28□□□□□ -2.04
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.26□□□□□ -2.05
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP12-3P60328 96 aa2.25□□□□□ -2.05
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