RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa11.61□□□□□ -0.55
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HOXD1-201ENST00000331462 Q5VSD8 79 aa11.58□□□□□ -0.56
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HOXD1-201ENST00000331462 K7ERS5 55 aa11.54□□□□□ -0.56
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HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa11.5□□□□□ -0.57
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HOXD1-201ENST00000331462 BIRC6Q9NR09 4857 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXD1-201ENST00000331462 S4R3F8 94 aa11.47□□□□□ -0.57
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HOXD1-201ENST00000331462 ABCA13Q86UQ4 5058 aa11.05□□□□□ -0.64
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HOXD1-201ENST00000331462 MUC17Q685J3 4493 aa10.59□□□□□ -0.71
HOXD1-201ENST00000331462 HERC1Q15751 4861 aa10.56□□□□□ -0.72
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HOXD1-201ENST00000331462 LORP23490 312 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
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HOXD1-201ENST00000331462 NDUFAF8A1L188 74 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXD1-201ENST00000331462 PP632Q6XCG6 107 aa10.07□□□□□ -0.8
HOXD1-201ENST00000331462 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa10.06□□□□□ -0.8
HOXD1-201ENST00000331462 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
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HOXD1-201ENST00000331462 MUC2Q02817 5179 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP23-1A1A580 65 aa9.79□□□□□ -0.84
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HOXD1-201ENST00000331462 M0R2T5 61 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXD1-201ENST00000331462 MT2AP02795 61 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXD1-201ENST00000331462 MT1FP04733 61 aa9.33□□□□□ -0.92
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa9.28□□□□□ -0.92
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HOXD1-201ENST00000331462 LCE3AQ5TA76 89 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0A0MQY5 61 aa9.1□□□□□ -0.95
HOXD1-201ENST00000331462 MT1BP07438 61 aa9.08□□□□□ -0.96
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa9.08□□□□□ -0.96
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP10-5P60370 271 aa9.03□□□□□ -0.96
HOXD1-201ENST00000331462 MT1XP80297 61 aa9.03□□□□□ -0.96
HOXD1-201ENST00000331462 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.9□□□□□ -0.99
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP10-12P60413 245 aa8.86□□□□□ -0.99
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP12-3P60328 96 aa8.79□□□□□ -1
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HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.38□□□□□ -1.07
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HOXD1-201ENST00000331462 INE1O15225 51 aa8.33□□□□□ -1.08
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.33□□□□□ -1.08
HOXD1-201ENST00000331462 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
HOXD1-201ENST00000331462 LCE3CQ5T5A8 94 aa8.3□□□□□ -1.08
HOXD1-201ENST00000331462 USH2AO75445 5202 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.11□□□□□ -1.11
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.11□□□□□ -1.11
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD1-201ENST00000331462 SSPOA2VEC9 5147 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.01□□□□□ -1.13
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.97□□□□□ -1.13
HOXD1-201ENST00000331462 KMT2DO14686 5537 aa7.94□□□□□ -1.14
HOXD1-201ENST00000331462 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.89□□□□□ -1.15
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.86□□□□□ -1.15
HOXD1-201ENST00000331462 MT1LQ93083 61 aa7.82□□□□□ -1.16
HOXD1-201ENST00000331462 MT1EP04732 61 aa7.82□□□□□ -1.16
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