RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 HSPG2P98160 4391 aa10.18□□□□□ -0.78
SPNS1-201ENST00000311008 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa10.17□□□□□ -0.78
SPNS1-201ENST00000311008 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
SPNS1-201ENST00000311008 H0YAA0 97 aa10.15□□□□□ -0.78
SPNS1-201ENST00000311008 RYR1P21817 5038 aa10.09□□□□□ -0.79
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SPNS1-201ENST00000311008 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
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SPNS1-201ENST00000311008 R4GN34 69 aa9.26□□□□□ -0.93
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SPNS1-201ENST00000311008 TNP1P09430 55 aa8.47□□□□□ -1.05
SPNS1-201ENST00000311008 M0R2T5 61 aa8.45□□□□□ -1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.29□□□□□ -1.08
SPNS1-201ENST00000311008 MT2AP02795 61 aa8.26□□□□□ -1.09
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP10-10P60014 251 aa8.26□□□□□ -1.09
SPNS1-201ENST00000311008 MT1FP04733 61 aa8.23□□□□□ -1.09
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.22□□□□□ -1.09
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.14□□□□□ -1.11
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SPNS1-201ENST00000311008 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.94□□□□□ -1.14
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SPNS1-201ENST00000311008 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.92□□□□□ -1.14
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP10-5P60370 271 aa7.88□□□□□ -1.15
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.88□□□□□ -1.15
SPNS1-201ENST00000311008 MT1XP80297 61 aa7.87□□□□□ -1.15
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.83□□□□□ -1.16
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP10-12P60413 245 aa7.73□□□□□ -1.17
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SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP12-3P60328 96 aa7.62□□□□□ -1.19
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SPNS1-201ENST00000311008 LCE2BO14633 110 aa7.54□□□□□ -1.2
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SPNS1-201ENST00000311008 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SPNS1-201ENST00000311008 USH2AO75445 5202 aa7.14□□□□□ -1.27
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.11□□□□□ -1.27
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.11□□□□□ -1.27
SPNS1-201ENST00000311008 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.08□□□□□ -1.28
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.05□□□□□ -1.28
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.01□□□□□ -1.29
SPNS1-201ENST00000311008 KMT2DO14686 5537 aa6.94□□□□□ -1.3
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.9□□□□□ -1.3
SPNS1-201ENST00000311008 SSPOA2VEC9 5147 aa6.89□□□□□ -1.31
SPNS1-201ENST00000311008 MT1EP04732 61 aa6.84□□□□□ -1.31
SPNS1-201ENST00000311008 MT1LQ93083 61 aa6.82□□□□□ -1.32
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.8□□□□□ -1.32
SPNS1-201ENST00000311008 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.78□□□□□ -1.32
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