RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.54□□□□□ -1.2
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A0A0MQY5 61 aa7.5□□□□□ -1.21
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP10-8P60410 259 aa7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.46□□□□□ -1.21
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.46□□□□□ -1.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 LUZP6Q538Z0 58 aa7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP12-1P59990 96 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 M0QZ58 72 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 PKD1P98161 4303 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.33□□□□□ -1.24
CCNDBP1-201ENST00000300213 R4GN34 69 aa7.31□□□□□ -1.24
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLAC4Q8WY50 150 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-201ENST00000300213 XP32Q5T750 250 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q5VSD8 79 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CCNDBP1-201ENST00000300213 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.19□□□□□ -1.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 HSPG2P98160 4391 aa7.19□□□□□ -1.26
CCNDBP1-201ENST00000300213 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.14□□□□□ -1.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 LPAP08519 4548 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 J3QL48 77 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRP2P98164 4655 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-201ENST00000300213 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.96□□□□□ -1.29
CCNDBP1-201ENST00000300213 RYR1P21817 5038 aa6.94□□□□□ -1.3
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1B0GVY2 172 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-201ENST00000300213 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-201ENST00000300213 RYR3Q15413 4870 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.82□□□□□ -1.32
CCNDBP1-201ENST00000300213 MUC2Q02817 5179 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-201ENST00000300213 RYR2Q92736 4967 aa6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-201ENST00000300213 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNXBP22105 4242 aa6.75□□□□□ -1.33
CCNDBP1-201ENST00000300213 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-201ENST00000300213 PP632Q6XCG6 107 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNP1P09430 55 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-201ENST00000300213 MT1HL1P0DM35 61 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-201ENST00000300213 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CCNDBP1-201ENST00000300213 M0R2T5 61 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-201ENST00000300213 HERC2O95714 4834 aa6.44□□□□□ -1.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.42□□□□□ -1.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.4□□□□□ -1.39
CCNDBP1-201ENST00000300213 HERC1Q15751 4861 aa6.29□□□□□ -1.4
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNF213Q63HN8 5207 aa6.29□□□□□ -1.4
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.22□□□□□ -1.41
CCNDBP1-201ENST00000300213 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.22□□□□□ -1.41
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE3AQ5TA76 89 aa6.19□□□□□ -1.42
CCNDBP1-201ENST00000300213 MUC17Q685J3 4493 aa6.15□□□□□ -1.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.14□□□□□ -1.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.09□□□□□ -1.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.04□□□□□ -1.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.03□□□□□ -1.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP10-10P60014 251 aa6.01□□□□□ -1.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 INE1O15225 51 aa6□□□□□ -1.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.98□□□□□ -1.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.96□□□□□ -1.46
CCNDBP1-201ENST00000300213 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.96□□□□□ -1.46
CCNDBP1-201ENST00000300213 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP12-3P60328 96 aa5.87□□□□□ -1.47
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.83□□□□□ -1.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP10-12P60413 245 aa5.78□□□□□ -1.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 USH2AO75445 5202 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.73□□□□□ -1.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 KMT2DO14686 5537 aa5.73□□□□□ -1.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 MT1FP04733 61 aa5.67□□□□□ -1.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE2CQ5TA81 110 aa5.61□□□□□ -1.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 MT2AP02795 61 aa5.6□□□□□ -1.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 MT1HP80294 61 aa5.56□□□□□ -1.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP10-5P60370 271 aa5.55□□□□□ -1.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 MT1XP80297 61 aa5.54□□□□□ -1.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.47□□□□□ -1.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 MT1BP07438 61 aa5.45□□□□□ -1.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.42□□□□□ -1.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.39□□□□□ -1.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.36□□□□□ -1.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.34□□□□□ -1.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.32□□□□□ -1.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.32□□□□□ -1.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.28□□□□□ -1.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.26□□□□□ -1.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.22□□□□□ -1.57
CCNDBP1-201ENST00000300213 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.12□□□□□ -1.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE2BO14633 110 aa5.05□□□□□ -1.6
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5□□□□□ -1.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5□□□□□ -1.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5□□□□□ -1.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.98□□□□□ -1.61
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP12-4P60329 112 aa4.98□□□□□ -1.61
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