RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4A-201ENST00000293683 CRIPTQ9P021 101 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP10-8P60410 259 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.9□□□□□ -0.99
PDE4A-201ENST00000293683 K7ERS5 55 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4A-201ENST00000293683 A0A0D9SG42 100 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4A-201ENST00000293683 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.83□□□□□ -1
PDE4A-201ENST00000293683 RYR3Q15413 4870 aa8.83□□□□□ -1
PDE4A-201ENST00000293683 XP32Q5T750 250 aa8.81□□□□□ -1
PDE4A-201ENST00000293683 LPAP08519 4548 aa8.8□□□□□ -1
PDE4A-201ENST00000293683 S4R3F8 94 aa8.77□□□□□ -1
PDE4A-201ENST00000293683 P0C880 135 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4A-201ENST00000293683 ROMO1P60602 79 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4A-201ENST00000293683 Q5VSD8 79 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4A-201ENST00000293683 RYR1P21817 5038 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4A-201ENST00000293683 H3BS24 57 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4A-201ENST00000293683 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4A-201ENST00000293683 LRP2P98164 4655 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4A-201ENST00000293683 TPRXLQ17RH7 258 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4A-201ENST00000293683 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP12-2P59991 146 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4A-201ENST00000293683 MT1HL1P0DM35 61 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4A-201ENST00000293683 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4A-201ENST00000293683 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP12-1P59990 96 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4A-201ENST00000293683 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4A-201ENST00000293683 M0QZ58 72 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4A-201ENST00000293683 MUC17Q685J3 4493 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4A-201ENST00000293683 R4GN34 69 aa8.17□□□□□ -1.1
PDE4A-201ENST00000293683 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PDE4A-201ENST00000293683 NDUFAF8A1L188 74 aa8.14□□□□□ -1.11
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.08□□□□□ -1.12
PDE4A-201ENST00000293683 HERC2O95714 4834 aa8.02□□□□□ -1.13
PDE4A-201ENST00000293683 MUC2Q02817 5179 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4A-201ENST00000293683 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PDE4A-201ENST00000293683 J3QL48 77 aa7.95□□□□□ -1.14
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.9□□□□□ -1.14
PDE4A-201ENST00000293683 PLAC4Q8WY50 150 aa7.8□□□□□ -1.16
PDE4A-201ENST00000293683 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.78□□□□□ -1.16
PDE4A-201ENST00000293683 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
PDE4A-201ENST00000293683 HERC1Q15751 4861 aa7.72□□□□□ -1.17
PDE4A-201ENST00000293683 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.72□□□□□ -1.17
PDE4A-201ENST00000293683 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.72□□□□□ -1.17
PDE4A-201ENST00000293683 PP632Q6XCG6 107 aa7.61□□□□□ -1.19
PDE4A-201ENST00000293683 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.6□□□□□ -1.19
PDE4A-201ENST00000293683 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4A-201ENST00000293683 TNP1P09430 55 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4A-201ENST00000293683 LUZP6Q538Z0 58 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4A-201ENST00000293683 RNF213Q63HN8 5207 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4A-201ENST00000293683 LCE2CQ5TA81 110 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4A-201ENST00000293683 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4A-201ENST00000293683 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4A-201ENST00000293683 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4A-201ENST00000293683 M0R2T5 61 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4A-201ENST00000293683 A0A0A0MQY5 61 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4A-201ENST00000293683 LCE3AQ5TA76 89 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4A-201ENST00000293683 MT1HP80294 61 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4A-201ENST00000293683 MT1FP04733 61 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4A-201ENST00000293683 MT2AP02795 61 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP10-10P60014 251 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP10-5P60370 271 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4A-201ENST00000293683 MT1BP07438 61 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4A-201ENST00000293683 MT1XP80297 61 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP10-12P60413 245 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP12-3P60328 96 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4A-201ENST00000293683 USH2AO75445 5202 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4A-201ENST00000293683 KMT2DO14686 5537 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4A-201ENST00000293683 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4A-201ENST00000293683 LCE2BO14633 110 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4A-201ENST00000293683 INE1O15225 51 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4A-201ENST00000293683 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4A-201ENST00000293683 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4A-201ENST00000293683 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.08□□□□□ -1.44
PDE4A-201ENST00000293683 SSPOA2VEC9 5147 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4A-201ENST00000293683 MT1LQ93083 61 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4A-201ENST00000293683 MT1EP04732 61 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4A-201ENST00000293683 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PDE4A-201ENST00000293683 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.74□□□□□ -1.49
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