RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 KMT2AQ03164 3969 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP12-1P59990 96 aa8.44□□□□□ -1.06
TRPC1-201ENST00000273482 PP632Q6XCG6 107 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 TNP1P09430 55 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 LYSTQ99698 3801 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPC1-201ENST00000273482 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPC1-201ENST00000273482 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPC1-201ENST00000273482 DNAH2Q9P225 4427 aa8.28□□□□□ -1.08
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TRPC1-201ENST00000273482 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPC1-201ENST00000273482 RYR1P21817 5038 aa8.22□□□□□ -1.09
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TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.18□□□□□ -1.1
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TRPC1-201ENST00000273482 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
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TRPC1-201ENST00000273482 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.06□□□□□ -1.12
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TRPC1-201ENST00000273482 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPC1-201ENST00000273482 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.03□□□□□ -1.12
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TRPC1-201ENST00000273482 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.93□□□□□ -1.14
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TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPC1-201ENST00000273482 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPC1-201ENST00000273482 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TRPC1-201ENST00000273482 RYR2Q92736 4967 aa7.88□□□□□ -1.15
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TRPC1-201ENST00000273482 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
TRPC1-201ENST00000273482 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.59□□□□□ -1.19
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TRPC1-201ENST00000273482 LPAP08519 4548 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPC1-201ENST00000273482 INE1O15225 51 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPC1-201ENST00000273482 LCE3AQ5TA76 89 aa7.17□□□□□ -1.26
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TRPC1-201ENST00000273482 LCE2CQ5TA81 110 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPC1-201ENST00000273482 MUC2Q02817 5179 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPC1-201ENST00000273482 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.72□□□□□ -1.33
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TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPC1-201ENST00000273482 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPC1-201ENST00000273482 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPC1-201ENST00000273482 MUC17Q685J3 4493 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPC1-201ENST00000273482 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPC1-201ENST00000273482 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.58□□□□□ -1.36
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TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.46□□□□□ -1.37
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TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP10-5P60370 271 aa6.39□□□□□ -1.39
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TRPC1-201ENST00000273482 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.35□□□□□ -1.39
TRPC1-201ENST00000273482 LCE2BO14633 110 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPC1-201ENST00000273482 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
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TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.83□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR2EP22531 72 aa5.78□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR2BP35325 72 aa5.78□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR2AP35326 72 aa5.78□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.78□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.77□□□□□ -1.49
TRPC1-201ENST00000273482 MT1GP13640 62 aa5.77□□□□□ -1.49
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP12-4P60329 112 aa5.76□□□□□ -1.49
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