RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264244.7

TIMMDC1-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMMDC1, Length 1,271 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-201ENST00000264244 OCR1Q9BZK8 76 aa6.27□□□□□ -1.41
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q6ZQY7 126 aa6.26□□□□□ -1.41
TIMMDC1-201ENST00000264244 NDUFS5O43920 106 aa6.22□□□□□ -1.41
TIMMDC1-201ENST00000264244 IGKV4-1P06312 121 aa6.22□□□□□ -1.41
TIMMDC1-201ENST00000264244 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.22□□□□□ -1.41
TIMMDC1-201ENST00000264244 NEBP20929 6669 aa6.22□□□□□ -1.41
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A1B0GW54 56 aa6.21□□□□□ -1.42
TIMMDC1-201ENST00000264244 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.2□□□□□ -1.42
TIMMDC1-201ENST00000264244 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.18□□□□□ -1.42
TIMMDC1-201ENST00000264244 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.17□□□□□ -1.42
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1-201ENST00000264244 NDUFB1O75438 58 aa6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q96NJ1 140 aa6.16□□□□□ -1.42
TIMMDC1-201ENST00000264244 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.15□□□□□ -1.42
TIMMDC1-201ENST00000264244 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.13□□□□□ -1.43
TIMMDC1-201ENST00000264244 A8MUU9 505 aa6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1-201ENST00000264244 IGFL1Q6UW32 110 aa6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1-201ENST00000264244 PSPHP1O15172 72 aa6.1□□□□□ -1.43
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q5VV11 94 aa6.09□□□□□ -1.43
TIMMDC1-201ENST00000264244 A8MUN3 132 aa6.08□□□□□ -1.44
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.07□□□□□ -1.44
TIMMDC1-201ENST00000264244 H3BPC8 53 aa6.07□□□□□ -1.44
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.07□□□□□ -1.44
TIMMDC1-201ENST00000264244 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q8N9L7 120 aa6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1-201ENST00000264244 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.04□□□□□ -1.44
TIMMDC1-201ENST00000264244 HRES1P13985 223 aa6.04□□□□□ -1.44
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.04□□□□□ -1.44
TIMMDC1-201ENST00000264244 A6NN06 94 aa6.03□□□□□ -1.44
TIMMDC1-201ENST00000264244 MP68P56378 58 aa6.03□□□□□ -1.44
TIMMDC1-201ENST00000264244 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.03□□□□□ -1.44
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TIMMDC1-201ENST00000264244 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.02□□□□□ -1.45
TIMMDC1-201ENST00000264244 HCG22E2RYF7 251 aa6.02□□□□□ -1.45
TIMMDC1-201ENST00000264244 LCA10Q71F78 164 aa6.02□□□□□ -1.45
TIMMDC1-201ENST00000264244 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.01□□□□□ -1.45
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC00208Q96KT6 92 aa6□□□□□ -1.45
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A1W2PNM2 257 aa5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1-201ENST00000264244 PRR15LQ9BU68 103 aa5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1-201ENST00000264244 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1-201ENST00000264244 DSCR10P59022 87 aa5.97□□□□□ -1.45
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1-201ENST00000264244 A6NED7 52 aa5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.93□□□□□ -1.46
TIMMDC1-201ENST00000264244 C8orf87E5RJ46 101 aa5.92□□□□□ -1.46
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A087WSZ3 146 aa5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1-201ENST00000264244 A8MU10 97 aa5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1-201ENST00000264244 A8MWP4 228 aa5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1-201ENST00000264244 K7EQZ3 153 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1-201ENST00000264244 H0Y9P7 68 aa5.89□□□□□ -1.47
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC00313P59037 77 aa5.88□□□□□ -1.47
TIMMDC1-201ENST00000264244 COA5Q86WW8 74 aa5.87□□□□□ -1.47
TIMMDC1-201ENST00000264244 CASC2Q6XLA1 102 aa5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1-201ENST00000264244 MDN1Q9NU22 5596 aa5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1-201ENST00000264244 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1-201ENST00000264244 KMT2DO14686 5537 aa5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP5-9P26371 169 aa5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPINK7P58062 85 aa5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1-201ENST00000264244 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC01554Q52M75 96 aa5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1-201ENST00000264244 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.75□□□□□ -1.49
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.75□□□□□ -1.49
TIMMDC1-201ENST00000264244 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.73□□□□□ -1.49
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A1B0GVX0 72 aa5.73□□□□□ -1.49
TIMMDC1-201ENST00000264244 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1-201ENST00000264244 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1-201ENST00000264244 MT1BP07438 61 aa5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.65□□□□□ -1.5
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP10-5P60370 271 aa5.64□□□□□ -1.51
TIMMDC1-201ENST00000264244 PRAC1Q96KF2 57 aa5.64□□□□□ -1.51
TIMMDC1-201ENST00000264244 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
TIMMDC1-201ENST00000264244 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.62□□□□□ -1.51
TIMMDC1-201ENST00000264244 ACYP2P14621 99 aa5.61□□□□□ -1.51
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A1B0GU69 56 aa5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1-201ENST00000264244 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1-201ENST00000264244 UQCR11O14957 56 aa5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1-201ENST00000264244 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPRR2EP22531 72 aa5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPRR2BP35325 72 aa5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPRR2AP35326 72 aa5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1-201ENST00000264244 CSAG1Q6PB30 78 aa5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1-201ENST00000264244 DMAC1Q96GE9 116 aa5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.5□□□□□ -1.53
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q5W150 140 aa5.42□□□□□ -1.54
TIMMDC1-201ENST00000264244 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.41□□□□□ -1.54
TIMMDC1-201ENST00000264244 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1-201ENST00000264244 IGKV2-30P06310 120 aa5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1-201ENST00000264244 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1-201ENST00000264244 ROMO1P60602 79 aa5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPRR2DP22532 72 aa5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.31□□□□□ -1.56
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms