RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637671.1

SYNGAP1-223, Transcript of synaptic Ras GTPase activating protein 1, human

TSL 5

Gene SYNGAP1, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYNGAP1-223	ENST00000637671	VPS25	Q9BRG1	176 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KMT2D	O14686	5537 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYNGAP1-223	ENST00000637671	NDUFB1	O75438	58 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYNGAP1-223	ENST00000637671	COX8A	P10176	69 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYNGAP1-223	ENST00000637671	S100A2	P29034	98 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TRIAP1	O43715	76 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SYNGAP1-223	ENST00000637671	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SYNGAP1-223	ENST00000637671	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYNGAP1-223	ENST00000637671	DLEU1	O43261	78 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP5-9	P26371	169 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYNGAP1-223	ENST00000637671		A6NJY4	79 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYNGAP1-223	ENST00000637671		Q5VV11	94 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYNGAP1-223	ENST00000637671	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYNGAP1-223	ENST00000637671	UBE2V1	Q13404	147 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYNGAP1-223	ENST00000637671	HIGD1B	Q9P298	99 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYNGAP1-223	ENST00000637671	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYNGAP1-223	ENST00000637671	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MT1B	P07438	61 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PSMB2	P49721	201 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
SYNGAP1-223	ENST00000637671		Q6ZVQ6	151 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CEND1	Q8N111	149 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C14orf144	Q96I85	54 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SYNGAP1-223	ENST00000637671	COX6C	P09669	75 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP10-5	P60370	271 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SYNGAP1-223	ENST00000637671		Q6ZQT0	140 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SYNGAP1-223	ENST00000637671		C9JAW5	83 aa		5.29	□□□□□ -1.56
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		5.29	□□□□□ -1.56
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYNGAP1-223	ENST00000637671	S100A6	P06703	90 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671	FXYD2	P54710	66 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671	IGKV2-30	P06310	120 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SPATA45	Q537H7	98 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671	NDUFS5	O43920	106 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C5orf47	Q569G3	176 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PRR15	Q8IV56	129 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671		K7ERJ3	54 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671	VAMP8	Q9BV40	100 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671	IMUP	Q9GZP8	106 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYNGAP1-223	ENST00000637671		A0A1B0GW54	56 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNGAP1-223	ENST00000637671	hDV103S1	A0JD37	113 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNGAP1-223	ENST00000637671	S100A1	P23297	94 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C4orf26	Q17RF5	130 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNGAP1-223	ENST00000637671	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SPRR2E	P22531	72 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SPRR2B	P35325	72 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SPRR2A	P35326	72 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CSAG1	Q6PB30	78 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYNGAP1-223	ENST00000637671	HSD52	Q0P140	79 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYNGAP1-223	ENST00000637671		S4R3F8	94 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYNGAP1-223	ENST00000637671	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PDE6G	P18545	87 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYNGAP1-223	ENST00000637671	NREP	Q16612	68 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KLKP1	Q107X0	134 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYNGAP1-223	ENST00000637671		Q5W150	140 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SYNGAP1-223	ENST00000637671		K7EQZ3	153 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LCA10	Q71F78	164 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ATXN8	Q156A1	80 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CRIPT	Q9P021	101 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SYNGAP1-223	ENST00000637671	HCG22	E2RYF7	251 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CXCL6	P80162	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYNGAP1-223	ENST00000637671	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CASC2	Q6XLA1	102 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYNGAP1-223	ENST00000637671	BPY2	O14599	106 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SPRR2D	P22532	72 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYNGAP1-223	ENST00000637671	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SYNGAP1-223	ENST00000637671		Q8N9L7	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-223	ENST00000637671	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MT1X	P80297	61 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYNGAP1-223	ENST00000637671		A8MUN3	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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