RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635310.1

NRXN1-241, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene NRXN1, Length 1,246 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-241ENST00000635310 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.62□□□□□ -1.35
NRXN1-241ENST00000635310 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.62□□□□□ -1.35
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NRXN1-241ENST00000635310 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.6□□□□□ -1.35
NRXN1-241ENST00000635310 A8MWP4 228 aa6.6□□□□□ -1.35
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NRXN1-241ENST00000635310 MT1HL1P0DM35 61 aa6.15□□□□□ -1.42
NRXN1-241ENST00000635310 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.15□□□□□ -1.42
NRXN1-241ENST00000635310 A8MUU9 505 aa6.14□□□□□ -1.43
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NRXN1-241ENST00000635310 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
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