RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630804.2

SPTAN1-222, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5 BASIC

Gene SPTAN1, Length 7,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-222	ENST00000630804		A8MU10	97 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPTAN1-222	ENST00000630804	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPTAN1-222	ENST00000630804	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPTAN1-222	ENST00000630804		A6NN06	94 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPTAN1-222	ENST00000630804	LAMA5	O15230	3695 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPTAN1-222	ENST00000630804	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.78	□□□□□ -1.65
SPTAN1-222	ENST00000630804	KALRN	O60229	2985 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPTAN1-222	ENST00000630804	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPTAN1-222	ENST00000630804	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPTAN1-222	ENST00000630804	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPTAN1-222	ENST00000630804	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPTAN1-222	ENST00000630804	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPTAN1-222	ENST00000630804	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPTAN1-222	ENST00000630804	ATM	Q13315	3056 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPTAN1-222	ENST00000630804	RELN	P78509	3460 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SPTAN1-222	ENST00000630804	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804	TACC2	O95359	2948 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZZEF1	O43149	2961 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804		A0A087X002	238 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804	LRBA	P50851	2863 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804	CUBN	O60494	3623 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804		P0C880	135 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.66	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPTAN1-222	ENST00000630804	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPTAN1-222	ENST00000630804	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPTAN1-222	ENST00000630804	DMD	P11532	3685 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPTAN1-222	ENST00000630804	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPTAN1-222	ENST00000630804	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPTAN1-222	ENST00000630804	NF1	P21359	2839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPTAN1-222	ENST00000630804		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SPTAN1-222	ENST00000630804	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPTAN1-222	ENST00000630804	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SPTAN1-222	ENST00000630804	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SPTAN1-222	ENST00000630804	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SPTAN1-222	ENST00000630804	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
SPTAN1-222	ENST00000630804		A0A1B0GVY2	172 aa		4.44	□□□□□ -1.7
SPTAN1-222	ENST00000630804	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.44	□□□□□ -1.7
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.43	□□□□□ -1.7
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZFHX3	Q15911	3703 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SPTAN1-222	ENST00000630804	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SPTAN1-222	ENST00000630804	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SPTAN1-222	ENST00000630804	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SPTAN1-222	ENST00000630804	FBN2	P35556	2912 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SPTAN1-222	ENST00000630804		H0YAA0	97 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SPTAN1-222	ENST00000630804	PDZD2	O15018	2839 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SPTAN1-222	ENST00000630804	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.34	□□□□□ -1.72
SPTAN1-222	ENST00000630804	TENM2	Q9NT68	2774 aa		4.34	□□□□□ -1.72
SPTAN1-222	ENST00000630804	VWF	P04275	2813 aa		4.32	□□□□□ -1.72
SPTAN1-222	ENST00000630804	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.32	□□□□□ -1.72
SPTAN1-222	ENST00000630804	XP32	Q5T750	250 aa		4.31	□□□□□ -1.72
SPTAN1-222	ENST00000630804	TG	P01266	2768 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SPTAN1-222	ENST00000630804	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SPTAN1-222	ENST00000630804	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SPTAN1-222	ENST00000630804	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPTAN1-222	ENST00000630804	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPTAN1-222	ENST00000630804	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SPTAN1-222	ENST00000630804	INE1	O15225	51 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SPTAN1-222	ENST00000630804	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4	□□□□□ -1.77
SPTAN1-222	ENST00000630804	BSN	Q9UPA5	3926 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SPTAN1-222	ENST00000630804	FBN3	Q75N90	2809 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SPTAN1-222	ENST00000630804	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SPTAN1-222	ENST00000630804	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SPTAN1-222	ENST00000630804	AKAP9	Q99996	3911 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SPTAN1-222	ENST00000630804	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SPTAN1-222	ENST00000630804	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SPTAN1-222	ENST00000630804	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SPTAN1-222	ENST00000630804	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SPTAN1-222	ENST00000630804	MT1HL1	P0DM35	61 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SPTAN1-222	ENST00000630804	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SPTAN1-222	ENST00000630804	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SPTAN1-222	ENST00000630804	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.59	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms