RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623498.3

SEM1-223, Transcript of SEM1, 26S proteasome complex subunit, human

TSL 5 BASIC

Gene SEM1, Length 582 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEM1-223	ENST00000623498	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SEM1-223	ENST00000623498	BPY2	O14599	106 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498	SIGMAR1	Q99720	223 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498	CDIP1	Q9H305	208 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498	CXCL6	P80162	114 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498	C1orf195	Q5TG92	126 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498		Q96NJ1	140 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498	IGKV4-1	P06312	121 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498	NDUFB1	O75438	58 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498		A8MWP4	228 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498	DSCR10	P59022	87 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SEM1-223	ENST00000623498	RNF213	Q63HN8	5207 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SEM1-223	ENST00000623498	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SEM1-223	ENST00000623498	PRR15	Q8IV56	129 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SEM1-223	ENST00000623498	IMUP	Q9GZP8	106 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SEM1-223	ENST00000623498		A0A1B0GVX0	72 aa		5	□□□□□ -1.61
SEM1-223	ENST00000623498	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		5	□□□□□ -1.61
SEM1-223	ENST00000623498	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		5	□□□□□ -1.61
SEM1-223	ENST00000623498	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEM1-223	ENST00000623498	TNXB	P22105	4242 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEM1-223	ENST00000623498	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEM1-223	ENST00000623498		K7EQZ3	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEM1-223	ENST00000623498	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEM1-223	ENST00000623498	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SEM1-223	ENST00000623498	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SEM1-223	ENST00000623498		Q8N9L7	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SEM1-223	ENST00000623498	LINC00313	P59037	77 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SEM1-223	ENST00000623498	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SEM1-223	ENST00000623498	PRR4	Q16378	134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SEM1-223	ENST00000623498	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SEM1-223	ENST00000623498	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEM1-223	ENST00000623498		A0A087WVE0	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEM1-223	ENST00000623498	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEM1-223	ENST00000623498	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEM1-223	ENST00000623498	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEM1-223	ENST00000623498	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEM1-223	ENST00000623498	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEM1-223	ENST00000623498	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEM1-223	ENST00000623498	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498		A8MUU9	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498	ATOX1	O00244	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498	NDUFS5	O43920	106 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498		Q75L30	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SEM1-223	ENST00000623498	LRP2	P98164	4655 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SEM1-223	ENST00000623498	UQCRQ	O14949	82 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEM1-223	ENST00000623498	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SEM1-223	ENST00000623498	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SEM1-223	ENST00000623498	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SEM1-223	ENST00000623498	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SEM1-223	ENST00000623498	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SEM1-223	ENST00000623498		A0A0U1RQV1	116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEM1-223	ENST00000623498	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SEM1-223	ENST00000623498	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SEM1-223	ENST00000623498	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SEM1-223	ENST00000623498	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SEM1-223	ENST00000623498	MUC2	Q02817	5179 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEM1-223	ENST00000623498	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEM1-223	ENST00000623498	MP68	P56378	58 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEM1-223	ENST00000623498		Q5W150	140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEM1-223	ENST00000623498	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEM1-223	ENST00000623498	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEM1-223	ENST00000623498		H3BPC8	53 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SEM1-223	ENST00000623498		H0Y9P7	68 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEM1-223	ENST00000623498	COX7C	P15954	63 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SEM1-223	ENST00000623498	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SEM1-223	ENST00000623498	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SEM1-223	ENST00000623498	LINC00208	Q96KT6	92 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SEM1-223	ENST00000623498	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SEM1-223	ENST00000623498	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SEM1-223	ENST00000623498	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SEM1-223	ENST00000623498	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SEM1-223	ENST00000623498	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SEM1-223	ENST00000623498	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEM1-223	ENST00000623498	SPINK7	P58062	85 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEM1-223	ENST00000623498	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEM1-223	ENST00000623498	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEM1-223	ENST00000623498	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEM1-223	ENST00000623498	LPA	P08519	4548 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEM1-223	ENST00000623498	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEM1-223	ENST00000623498	NDUFC1	O43677	76 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEM1-223	ENST00000623498	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEM1-223	ENST00000623498	PCP4	P48539	62 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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