RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.87□□□□□ -1.15
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C9orf170-201ENST00000623052 IGLV7-43P04211 117 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf170-201ENST00000623052 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.85□□□□□ -1.15
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C9orf170-201ENST00000623052 A8MUN3 132 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.84□□□□□ -1.16
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C9orf170-201ENST00000623052 Q5W150 140 aa7.79□□□□□ -1.16
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C9orf170-201ENST00000623052 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.79□□□□□ -1.16
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C9orf170-201ENST00000623052 C1orf195Q5TG92 126 aa7.73□□□□□ -1.17
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C9orf170-201ENST00000623052 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.7□□□□□ -1.18
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C9orf170-201ENST00000623052 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.66□□□□□ -1.18
C9orf170-201ENST00000623052 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.65□□□□□ -1.18
C9orf170-201ENST00000623052 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.65□□□□□ -1.19
C9orf170-201ENST00000623052 C8orf87E5RJ46 101 aa7.64□□□□□ -1.19
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C9orf170-201ENST00000623052 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.63□□□□□ -1.19
C9orf170-201ENST00000623052 LCA10Q71F78 164 aa7.63□□□□□ -1.19
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00313P59037 77 aa7.61□□□□□ -1.19
C9orf170-201ENST00000623052 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf170-201ENST00000623052 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf170-201ENST00000623052 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.57□□□□□ -1.2
C9orf170-201ENST00000623052 A6NED7 52 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf170-201ENST00000623052 DMAC1Q96GE9 116 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV2-30P06310 120 aa7.54□□□□□ -1.2
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C9orf170-201ENST00000623052 SPINK7P58062 85 aa7.54□□□□□ -1.2
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C9orf170-201ENST00000623052 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf170-201ENST00000623052 ACYP2P14621 99 aa7.5□□□□□ -1.21
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C9orf170-201ENST00000623052 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.49□□□□□ -1.21
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C9orf170-201ENST00000623052 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.46□□□□□ -1.21
C9orf170-201ENST00000623052 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf170-201ENST00000623052 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
C9orf170-201ENST00000623052 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf170-201ENST00000623052 A6NN06 94 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf170-201ENST00000623052 FAT1Q14517 4588 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf170-201ENST00000623052 SPINK1P00995 79 aa7.4□□□□□ -1.22
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C9orf170-201ENST00000623052 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.33□□□□□ -1.24
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C9orf170-201ENST00000623052 A0A1B0GVY2 172 aa7.29□□□□□ -1.24
C9orf170-201ENST00000623052 Q8N1X5 172 aa7.28□□□□□ -1.24
C9orf170-201ENST00000623052 C9orf92A6NGG3 77 aa7.25□□□□□ -1.25
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C9orf170-201ENST00000623052 A8MUU9 505 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf170-201ENST00000623052 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf170-201ENST00000623052 TNXBP22105 4242 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf170-201ENST00000623052 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf170-201ENST00000623052 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.18□□□□□ -1.26
C9orf170-201ENST00000623052 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.18□□□□□ -1.26
C9orf170-201ENST00000623052 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.18□□□□□ -1.26
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C9orf170-201ENST00000623052 UQCR11O14957 56 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf170-201ENST00000623052 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
C9orf170-201ENST00000623052 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.13□□□□□ -1.27
C9orf170-201ENST00000623052 HSPG2P98160 4391 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf170-201ENST00000623052 PRAC1Q96KF2 57 aa7.1□□□□□ -1.27
C9orf170-201ENST00000623052 H0YAA0 97 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf170-201ENST00000623052 RYR3Q15413 4870 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf170-201ENST00000623052 MYCBP2O75592 4640 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf170-201ENST00000623052 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf170-201ENST00000623052 RYR1P21817 5038 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf170-201ENST00000623052 KRTAP10-8P60410 259 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf170-201ENST00000623052 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf170-201ENST00000623052 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.93□□□□□ -1.3
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