RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

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Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.56□□□□□ -1.68
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ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF548-208ENST00000597576 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF548-208ENST00000597576 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF548-208ENST00000597576 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ZNF548-208ENST00000597576 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ZNF548-208ENST00000597576 CD164Q04900 197 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF548-208ENST00000597576 DSCR8Q96T75 97 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF548-208ENST00000597576 LIMD2Q9BT23 127 aa4.54□□□□□ -1.68
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ZNF548-208ENST00000597576 SMIM29Q86T20 159 aa4.53□□□□□ -1.68
ZNF548-208ENST00000597576 SVIPQ8NHG7 77 aa4.53□□□□□ -1.68
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ZNF548-208ENST00000597576 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
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ZNF548-208ENST00000597576 UQCRQO14949 82 aa4.49□□□□□ -1.69
ZNF548-208ENST00000597576 PRR4Q16378 134 aa4.49□□□□□ -1.69
ZNF548-208ENST00000597576 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.49□□□□□ -1.69
ZNF548-208ENST00000597576 IGFL1Q6UW32 110 aa4.47□□□□□ -1.69
ZNF548-208ENST00000597576 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
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ZNF548-208ENST00000597576 Q5XG85 94 aa4.46□□□□□ -1.7
ZNF548-208ENST00000597576 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.46□□□□□ -1.7
ZNF548-208ENST00000597576 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
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ZNF548-208ENST00000597576 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.45□□□□□ -1.7
ZNF548-208ENST00000597576 CXCL6P80162 114 aa4.45□□□□□ -1.7
ZNF548-208ENST00000597576 USH2AO75445 5202 aa4.45□□□□□ -1.7
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ZNF548-208ENST00000597576 Q6ZVQ6 151 aa4.44□□□□□ -1.7
ZNF548-208ENST00000597576 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
ZNF548-208ENST00000597576 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
ZNF548-208ENST00000597576 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
ZNF548-208ENST00000597576 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.43□□□□□ -1.7
ZNF548-208ENST00000597576 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.42□□□□□ -1.7
ZNF548-208ENST00000597576 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.42□□□□□ -1.7
ZNF548-208ENST00000597576 SERP2Q8N6R1 65 aa4.42□□□□□ -1.7
ZNF548-208ENST00000597576 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.41□□□□□ -1.7
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ZNF548-208ENST00000597576 TPRXLQ17RH7 258 aa4.38□□□□□ -1.71
ZNF548-208ENST00000597576 C1orf195Q5TG92 126 aa4.37□□□□□ -1.71
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ZNF548-208ENST00000597576 IGKV4-1P06312 121 aa4.33□□□□□ -1.72
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFC1O43677 76 aa4.32□□□□□ -1.72
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.31□□□□□ -1.72
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ZNF548-208ENST00000597576 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ZNF548-208ENST00000597576 DSCR10P59022 87 aa4.29□□□□□ -1.72
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ZNF548-208ENST00000597576 Q8N9L7 120 aa4.27□□□□□ -1.73
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ZNF548-208ENST00000597576 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.23□□□□□ -1.73
ZNF548-208ENST00000597576 Q75L30 129 aa4.23□□□□□ -1.73
ZNF548-208ENST00000597576 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
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ZNF548-208ENST00000597576 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.21□□□□□ -1.74
ZNF548-208ENST00000597576 H7BZZ5 65 aa4.2□□□□□ -1.74
ZNF548-208ENST00000597576 CASC2Q6XLA1 102 aa4.2□□□□□ -1.74
ZNF548-208ENST00000597576 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.2□□□□□ -1.74
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