RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576		J3QL48	77 aa		5.26	□□□□□ -1.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	C20orf197	Q8N268	126 aa		5.26	□□□□□ -1.57
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1B0GW54	56 aa		5.23	□□□□□ -1.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	LIMD2	Q9BT23	127 aa		5.23	□□□□□ -1.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		5.22	□□□□□ -1.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM236C	P0DP71	79 aa		5.22	□□□□□ -1.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		5.22	□□□□□ -1.57
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEC61G	P60059	68 aa		5.22	□□□□□ -1.57
EFTUD2-223	ENST00000592576		H7BZZ5	65 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNURF	Q9Y675	71 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	HERC1	Q15751	4861 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	NREP	Q16612	68 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	C1orf195	Q5TG92	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q6ZVQ6	151 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q96NJ1	140 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-223	ENST00000592576		V9GYY9	64 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0U1RQV1	116 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV4-1	P06312	121 aa		5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLKP1	Q107X0	134 aa		5.14	□□□□□ -1.59
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q8N9L7	120 aa		5.13	□□□□□ -1.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		5.13	□□□□□ -1.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	BPY2	O14599	106 aa		5.13	□□□□□ -1.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRR4	Q16378	134 aa		5.12	□□□□□ -1.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	DSCR10	P59022	87 aa		5.11	□□□□□ -1.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		5.1	□□□□□ -1.59
EFTUD2-223	ENST00000592576		A8MWP4	228 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EFTUD2-223	ENST00000592576	CXCL6	P80162	114 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EFTUD2-223	ENST00000592576		K7EQZ3	153 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDUFB1	O75438	58 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1B0GVX0	72 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRR15	Q8IV56	129 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	LPA	P08519	4548 aa		5.07	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	C9orf92	A6NGG3	77 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDUFC1	O43677	76 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		5.04	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00313	P59037	77 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	TPRXL	Q17RH7	258 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRP2	P98164	4655 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		5.02	□□□□□ -1.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	C8orf87	E5RJ46	101 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		5	□□□□□ -1.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	XP32	Q5T750	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EFTUD2-223	ENST00000592576		A8MUU9	505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q1T7F1	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDUFS5	O43920	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q75L30	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	MP68	P56378	58 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFTUD2-223	ENST00000592576		A8MU10	97 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSPHP1	O15172	72 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFTUD2-223	ENST00000592576	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00208	Q96KT6	92 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q5W150	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	MUC2	Q02817	5179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-223	ENST00000592576		A8MUN3	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q5VV11	94 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-223	ENST00000592576		H0Y9P7	68 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPINK7	P58062	85 aa		4.77	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 190 ms