RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591376.5

CIRBP-232, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene CIRBP, Length 830 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-232ENST00000591376 BATFQ16520 125 aa9.17□□□□□ -0.94
CIRBP-232ENST00000591376 SSPOA2VEC9 5147 aa9.17□□□□□ -0.94
CIRBP-232ENST00000591376 MPLKIPQ8TAP9 179 aa9.16□□□□□ -0.94
CIRBP-232ENST00000591376 MT2AP02795 61 aa9.15□□□□□ -0.94
CIRBP-232ENST00000591376 UBE2V1Q13404 147 aa9.15□□□□□ -0.94
CIRBP-232ENST00000591376 VPS25Q9BRG1 176 aa9.14□□□□□ -0.95
CIRBP-232ENST00000591376 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CIRBP-232ENST00000591376 C8orf87E5RJ46 101 aa9.11□□□□□ -0.95
CIRBP-232ENST00000591376 ATXN8Q156A1 80 aa9.11□□□□□ -0.95
CIRBP-232ENST00000591376 A0A1B0GVX0 72 aa9.1□□□□□ -0.95
CIRBP-232ENST00000591376 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.1□□□□□ -0.95
CIRBP-232ENST00000591376 RBM3P98179 157 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CIRBP-232ENST00000591376 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa9.08□□□□□ -0.96
CIRBP-232ENST00000591376 TAX1BP3O14907 124 aa9.08□□□□□ -0.96
CIRBP-232ENST00000591376 MT1FP04733 61 aa9.08□□□□□ -0.96
CIRBP-232ENST00000591376 DSCR8Q96T75 97 aa9.08□□□□□ -0.96
CIRBP-232ENST00000591376 C9orf118A6NHY6 69 aa9.07□□□□□ -0.96
CIRBP-232ENST00000591376 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.06□□□□□ -0.96
CIRBP-232ENST00000591376 MTURNQ8N3F0 131 aa9.06□□□□□ -0.96
CIRBP-232ENST00000591376 KRTAP10-10P60014 251 aa9.05□□□□□ -0.96
CIRBP-232ENST00000591376 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CIRBP-232ENST00000591376 J3KT08 172 aa9.02□□□□□ -0.97
CIRBP-232ENST00000591376 LCE2BO14633 110 aa9.02□□□□□ -0.97
CIRBP-232ENST00000591376 A0A1W2PPM0 123 aa9.01□□□□□ -0.97
CIRBP-232ENST00000591376 C9JAW5 83 aa9.01□□□□□ -0.97
CIRBP-232ENST00000591376 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa9.01□□□□□ -0.97
CIRBP-232ENST00000591376 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.01□□□□□ -0.97
CIRBP-232ENST00000591376 SPINK7P58062 85 aa8.99□□□□□ -0.97
CIRBP-232ENST00000591376 NDUFB1O75438 58 aa8.97□□□□□ -0.97
CIRBP-232ENST00000591376 Q6ZQT0 140 aa8.97□□□□□ -0.97
CIRBP-232ENST00000591376 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.97□□□□□ -0.97
CIRBP-232ENST00000591376 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CIRBP-232ENST00000591376 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.95□□□□□ -0.98
CIRBP-232ENST00000591376 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.94□□□□□ -0.98
CIRBP-232ENST00000591376 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CIRBP-232ENST00000591376 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.91□□□□□ -0.98
CIRBP-232ENST00000591376 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.91□□□□□ -0.98
CIRBP-232ENST00000591376 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.9□□□□□ -0.98
CIRBP-232ENST00000591376 H3BT86 120 aa8.9□□□□□ -0.98
CIRBP-232ENST00000591376 A8MWP4 228 aa8.89□□□□□ -0.99
CIRBP-232ENST00000591376 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.89□□□□□ -0.99
CIRBP-232ENST00000591376 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.89□□□□□ -0.99
CIRBP-232ENST00000591376 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.89□□□□□ -0.99
CIRBP-232ENST00000591376 A0A1B0GW54 56 aa8.87□□□□□ -0.99
CIRBP-232ENST00000591376 PDE6GP18545 87 aa8.87□□□□□ -0.99
CIRBP-232ENST00000591376 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.85□□□□□ -0.99
CIRBP-232ENST00000591376 Q6ZVQ6 151 aa8.84□□□□□ -0.99
CIRBP-232ENST00000591376 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CIRBP-232ENST00000591376 LINC00846Q9NV44 126 aa8.81□□□□□ -1
CIRBP-232ENST00000591376 K7EP34 96 aa8.8□□□□□ -1
CIRBP-232ENST00000591376 PRR15Q8IV56 129 aa8.79□□□□□ -1
CIRBP-232ENST00000591376 PRO0461Q9UI25 63 aa8.79□□□□□ -1
CIRBP-232ENST00000591376 NREPQ16612 68 aa8.78□□□□□ -1
CIRBP-232ENST00000591376 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CIRBP-232ENST00000591376 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CIRBP-232ENST00000591376 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.75□□□□□ -1.01
CIRBP-232ENST00000591376 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.74□□□□□ -1.01
CIRBP-232ENST00000591376 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.74□□□□□ -1.01
CIRBP-232ENST00000591376 NDUFS5O43920 106 aa8.71□□□□□ -1.02
CIRBP-232ENST00000591376 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.7□□□□□ -1.02
CIRBP-232ENST00000591376 hDV103S1A0JD37 113 aa8.69□□□□□ -1.02
CIRBP-232ENST00000591376 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.69□□□□□ -1.02
CIRBP-232ENST00000591376 K7EQZ3 153 aa8.67□□□□□ -1.02
CIRBP-232ENST00000591376 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CIRBP-232ENST00000591376 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.63□□□□□ -1.03
CIRBP-232ENST00000591376 F8W1H4 67 aa8.63□□□□□ -1.03
CIRBP-232ENST00000591376 IGKV2-30P06310 120 aa8.63□□□□□ -1.03
CIRBP-232ENST00000591376 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.6□□□□□ -1.03
CIRBP-232ENST00000591376 BPY2O14599 106 aa8.59□□□□□ -1.03
CIRBP-232ENST00000591376 ETDBQ3ZM63 59 aa8.58□□□□□ -1.04
CIRBP-232ENST00000591376 Q5W150 140 aa8.57□□□□□ -1.04
CIRBP-232ENST00000591376 CASC2Q6XLA1 102 aa8.52□□□□□ -1.05
CIRBP-232ENST00000591376 HCG22E2RYF7 251 aa8.51□□□□□ -1.05
CIRBP-232ENST00000591376 UBL5Q9BZL1 73 aa8.51□□□□□ -1.05
CIRBP-232ENST00000591376 Q8N9L7 120 aa8.5□□□□□ -1.05
CIRBP-232ENST00000591376 C4orf26Q17RF5 130 aa8.49□□□□□ -1.05
CIRBP-232ENST00000591376 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.45□□□□□ -1.06
CIRBP-232ENST00000591376 A0A1B0GV90 55 aa8.44□□□□□ -1.06
CIRBP-232ENST00000591376 CXCL6P80162 114 aa8.44□□□□□ -1.06
CIRBP-232ENST00000591376 C5orf47Q569G3 176 aa8.41□□□□□ -1.06
CIRBP-232ENST00000591376 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.4□□□□□ -1.06
CIRBP-232ENST00000591376 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.4□□□□□ -1.06
CIRBP-232ENST00000591376 S4R3F8 94 aa8.35□□□□□ -1.07
CIRBP-232ENST00000591376 ACYP1P07311 99 aa8.34□□□□□ -1.07
CIRBP-232ENST00000591376 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.33□□□□□ -1.08
CIRBP-232ENST00000591376 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.33□□□□□ -1.08
CIRBP-232ENST00000591376 CSAG1Q6PB30 78 aa8.31□□□□□ -1.08
CIRBP-232ENST00000591376 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.31□□□□□ -1.08
CIRBP-232ENST00000591376 A6NN06 94 aa8.29□□□□□ -1.08
CIRBP-232ENST00000591376 Q5VV11 94 aa8.28□□□□□ -1.08
CIRBP-232ENST00000591376 LCA10Q71F78 164 aa8.28□□□□□ -1.08
CIRBP-232ENST00000591376 MT1BP07438 61 aa8.27□□□□□ -1.09
CIRBP-232ENST00000591376 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.24□□□□□ -1.09
CIRBP-232ENST00000591376 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.23□□□□□ -1.09
CIRBP-232ENST00000591376 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.22□□□□□ -1.09
CIRBP-232ENST00000591376 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.22□□□□□ -1.09
CIRBP-232ENST00000591376 KLKP1Q107X0 134 aa8.18□□□□□ -1.1
CIRBP-232ENST00000591376 LINC00643Q86TS7 51 aa8.17□□□□□ -1.1
CIRBP-232ENST00000591376 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CIRBP-232ENST00000591376 NEBP20929 6669 aa8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 207.4 ms