RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A1B0GVX0 72 aa10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A1B0GW54 56 aa10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-217ENST00000590124 PDE6GP18545 87 aa10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-217ENST00000590124 COX6B2Q6YFQ2 88 aa10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-217ENST00000590124 J3KT08 172 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-217ENST00000590124 C14orf132Q9NPU4 83 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A1W2PPM0 123 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-217ENST00000590124 C8orf87E5RJ46 101 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-217ENST00000590124 H3BT86 120 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-217ENST00000590124 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-217ENST00000590124 LORP23490 312 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-217ENST00000590124 MTURNQ8N3F0 131 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-217ENST00000590124 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-217ENST00000590124 A8MWP4 228 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-217ENST00000590124 M0R2T5 61 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-217ENST00000590124 NDUFB1O75438 58 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-217ENST00000590124 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-217ENST00000590124 NREPQ16612 68 aa10.11□□□□□ -0.79
EFTUD2-217ENST00000590124 SPCS1Q9Y6A9 102 aa10.11□□□□□ -0.79
EFTUD2-217ENST00000590124 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-217ENST00000590124 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-217ENST00000590124 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa10.08□□□□□ -0.8
EFTUD2-217ENST00000590124 HRES1P13985 223 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-217ENST00000590124 MPLKIPQ8TAP9 179 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-217ENST00000590124 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-217ENST00000590124 PRR15Q8IV56 129 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-217ENST00000590124 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
EFTUD2-217ENST00000590124 Q6ZVQ6 151 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-217ENST00000590124 PRO0461Q9UI25 63 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-217ENST00000590124 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-217ENST00000590124 K7EP34 96 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-217ENST00000590124 K7EQZ3 153 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-217ENST00000590124 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM236CP0DP71 79 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-217ENST00000590124 SPINK7P58062 85 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-217ENST00000590124 TMEM254Q8TBM7 123 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-217ENST00000590124 BPY2O14599 106 aa9.94□□□□□ -0.82
EFTUD2-217ENST00000590124 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-217ENST00000590124 hDV103S1A0JD37 113 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 PCP4L1A6NKN8 68 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 LINC00846Q9NV44 126 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 Q8N9L7 120 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 NDUFS5O43920 106 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 WFDC13Q8IUB5 93 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 UBL5Q9BZL1 73 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 F8W1H4 67 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 CASC2Q6XLA1 102 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 Q5W150 140 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-217ENST00000590124 MT2AP02795 61 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-217ENST00000590124 ETDBQ3ZM63 59 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-217ENST00000590124 HCG22E2RYF7 251 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-217ENST00000590124 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-217ENST00000590124 MT1FP04733 61 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-217ENST00000590124 IGKV2-30P06310 120 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-217ENST00000590124 CXCL6P80162 114 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-217ENST00000590124 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-217ENST00000590124 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP10-10P60014 251 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-217ENST00000590124 USH2AO75445 5202 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-217ENST00000590124 ACYP1P07311 99 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-217ENST00000590124 C4orf26Q17RF5 130 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-217ENST00000590124 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-217ENST00000590124 LCE2BO14633 110 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-217ENST00000590124 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-217ENST00000590124 SSPOA2VEC9 5147 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A1B0GV90 55 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-217ENST00000590124 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-217ENST00000590124 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-217ENST00000590124 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-217ENST00000590124 TRAV22A0A0B4J277 110 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-217ENST00000590124 LINC00643Q86TS7 51 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-217ENST00000590124 S4R3F8 94 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-217ENST00000590124 C5orf47Q569G3 176 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-217ENST00000590124 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A087WVE0 104 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-217ENST00000590124 UQCRQO14949 82 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-217ENST00000590124 LCA10Q71F78 164 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-217ENST00000590124 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-217ENST00000590124 CSAG1Q6PB30 78 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-217ENST00000590124 H0Y9P7 68 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-217ENST00000590124 ATOX1O00244 68 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-217ENST00000590124 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-217ENST00000590124 J3QR89 54 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-217ENST00000590124 OCR1Q9BZK8 76 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD2-217ENST00000590124 LINC00208Q96KT6 92 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms