RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579527.5

TSPOAP1-AS1-203, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,042 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa15.1■□□□□ 0.01
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LINC00336Q6ZUF6 198 aa15.08■□□□□ 0
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PKD1P98161 4303 aa15.07■□□□□ 0
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 Q1T7F1 81 aa15.06■□□□□ 0
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NDUFS5O43920 106 aa15.03■□□□□ -0
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HYDINQ4G0P3 5121 aa15.03■□□□□ -0
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FAT2Q9NYQ8 4349 aa15.02■□□□□ -0
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 A0A087X002 238 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa14.99□□□□□ -0.01
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SPINK6Q6UWN8 80 aa14.97□□□□□ -0.01
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PRO0628Q9UI54 55 aa14.97□□□□□ -0.01
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 V9GYY9 64 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 C8orf87E5RJ46 101 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PCOTHQ58A44 107 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LRP1BQ9NZR2 4599 aa14.87□□□□□ -0.03
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 BRK1Q8WUW1 75 aa14.84□□□□□ -0.03
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa14.83□□□□□ -0.04
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 C1orf195Q5TG92 126 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 COA5Q86WW8 74 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa14.78□□□□□ -0.04
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PSPHP1O15172 72 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LINC00313P59037 77 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 Q5W150 140 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LIMD2Q9BT23 127 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SACSQ9NZJ4 4579 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 A8MUN3 132 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FAM229AH3BQW9 127 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 Q5VV11 94 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TYMSOSQ8TAI1 123 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HRES1P13985 223 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 C4orf48Q5BLP8 95 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PKHD1P08F94 4074 aa14.57□□□□□ -0.08
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa14.56□□□□□ -0.08
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SPINK1P00995 79 aa14.55□□□□□ -0.08
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PRR15LQ9BU68 103 aa14.55□□□□□ -0.08
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 A0A1B0GVY2 172 aa14.54□□□□□ -0.08
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 Q75L30 129 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 IGKV2-30P06310 120 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ACYP2P14621 99 aa14.46□□□□□ -0.1
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RPS29P62273 56 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SPAG11AQ6PDA7 123 aa14.44□□□□□ -0.1
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PRR26Q8N8Z3 221 aa14.44□□□□□ -0.1
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RETNLBQ9BQ08 111 aa14.43□□□□□ -0.1
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LINC00304Q8N9R0 145 aa14.42□□□□□ -0.1
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DMAC1Q96GE9 116 aa14.42□□□□□ -0.1
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 APOBP04114 4563 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RYR2Q92736 4967 aa14.3□□□□□ -0.12
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 A6NED7 52 aa14.29□□□□□ -0.12
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa14.24□□□□□ -0.13
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 A8MU10 97 aa14.22□□□□□ -0.13
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LCA10Q71F78 164 aa14.19□□□□□ -0.14
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa14.18□□□□□ -0.14
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa14.17□□□□□ -0.14
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FAT1Q14517 4588 aa14.16□□□□□ -0.14
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa14.11□□□□□ -0.15
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 C7orf65Q6ZTY9 151 aa14.1□□□□□ -0.15
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SPINK7P58062 85 aa14.07□□□□□ -0.16
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PMAIP1Q13794 54 aa14.04□□□□□ -0.16
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SPTSSBQ8NFR3 76 aa14.01□□□□□ -0.17
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa14□□□□□ -0.17
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 A8MUU9 505 aa14□□□□□ -0.17
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 A0A1B0GU69 56 aa13.98□□□□□ -0.17
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 C9orf92A6NGG3 77 aa13.98□□□□□ -0.17
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 Q8N1X5 172 aa13.86□□□□□ -0.19
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 A6NN06 94 aa13.83□□□□□ -0.2
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 Q5VSD8 79 aa13.83□□□□□ -0.2
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KRTAP10-8P60410 259 aa13.8□□□□□ -0.2
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HSPG2P98160 4391 aa13.75□□□□□ -0.21
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa13.74□□□□□ -0.21
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SPATA8Q6RVD6 105 aa13.73□□□□□ -0.21
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TNXBP22105 4242 aa13.72□□□□□ -0.21
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 UQCR11O14957 56 aa13.72□□□□□ -0.21
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RYR3Q15413 4870 aa13.68□□□□□ -0.22
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FAT3Q8TDW7 4589 aa13.67□□□□□ -0.22
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MIR22HGQ0VDD5 57 aa13.65□□□□□ -0.22
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RYR1P21817 5038 aa13.64□□□□□ -0.23
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SEC61GP60059 68 aa13.63□□□□□ -0.23
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa13.62□□□□□ -0.23
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa13.56□□□□□ -0.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 COX6B2Q6YFQ2 88 aa13.5□□□□□ -0.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RPL37P61927 97 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MT1HL1P0DM35 61 aa13.42□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 XP32Q5T750 250 aa13.4□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KIAA1109Q2LD37 5005 aa13.36□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.8 ms