RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 SFTA2Q6UW10 78 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRM-210ENST00000578916 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00643Q86TS7 51 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRM-210ENST00000578916 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRM-210ENST00000578916 SSPOA2VEC9 5147 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRM-210ENST00000578916 NCR3O14931 201 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRM-210ENST00000578916 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRM-210ENST00000578916 ERC2-IT1O76042 136 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRM-210ENST00000578916 Q1T7F1 81 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRM-210ENST00000578916 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRM-210ENST00000578916 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRM-210ENST00000578916 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 USH2AO75445 5202 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 LINC01546A6NGU7 62 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00310P59036 64 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 LIMD2Q9BT23 127 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 IGLV6-57P01721 117 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0J9YXY3 114 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 K7ERS5 55 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 Q9BRP9 147 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 C11orf86A6NJI1 115 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZRX8 168 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-210ENST00000578916 H7BZZ5 65 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 CFC1P0CG37 223 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 LUZP6Q538Z0 58 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 hDV103S1A0JD37 113 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM223A0PJW6 202 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 KLKP1Q107X0 134 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 A0A096LNJ9 63 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 A6NED7 52 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0B4J2C4 111 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 H7C2G1 150 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 SPRR1BP22528 89 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 FXYD2P54710 66 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 A8MWP4 228 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 HCG22E2RYF7 251 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 C20orf197Q8N268 126 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 BPY2O14599 106 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 Q1RN00 199 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 CASC2Q6XLA1 102 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 SMIM29Q86T20 159 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-210ENST00000578916 Q6JHZ5 121 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 F8WEM9 126 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 LEPROTL1O95214 131 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 ROMO1P60602 79 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 ATXN8Q156A1 80 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 COX6CP09669 75 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1B0GVX0 72 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00846Q9NV44 126 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0G2JQZ4 141 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 MT2AP02795 61 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF815PA8K554 130 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 COX7BP24311 80 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-210ENST00000578916 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-210ENST00000578916 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-210ENST00000578916 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZQT0 140 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-210ENST00000578916 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-210ENST00000578916 MT1FP04733 61 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRM-210ENST00000578916 PLNP26678 52 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRM-210ENST00000578916 Q5VV11 94 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP10-10P60014 251 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRM-210ENST00000578916 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.6□□□□□ -1.67
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