RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556077.5

TTC8-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 8, humanhuman

TSL 5

Gene TTC8, Length 1,020 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC8-211ENST00000556077 SIGMAR1Q99720 223 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 C9orf118A6NHY6 69 aa6.63□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 TAX1BP3O14907 124 aa6.63□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 TRACP01848 142 aa6.63□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.63□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.63□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 H3BQ85 93 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 A8MWP4 228 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 H3BMG7 143 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 DNAL4O96015 105 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 IGKV4-1P06312 121 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.59□□□□□ -1.35
TTC8-211ENST00000556077 A0A1W2PPM0 123 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC8-211ENST00000556077 ATXN8Q156A1 80 aa6.58□□□□□ -1.36
TTC8-211ENST00000556077 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.56□□□□□ -1.36
TTC8-211ENST00000556077 FABP2P12104 132 aa6.56□□□□□ -1.36
TTC8-211ENST00000556077 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.55□□□□□ -1.36
TTC8-211ENST00000556077 UBE2V1Q13404 147 aa6.54□□□□□ -1.36
TTC8-211ENST00000556077 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC8-211ENST00000556077 A0A1W2PNM2 257 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC8-211ENST00000556077 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC8-211ENST00000556077 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.52□□□□□ -1.37
TTC8-211ENST00000556077 C8orf87E5RJ46 101 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC8-211ENST00000556077 SPINK7P58062 85 aa6.51□□□□□ -1.37
TTC8-211ENST00000556077 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.5□□□□□ -1.37
TTC8-211ENST00000556077 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TTC8-211ENST00000556077 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC8-211ENST00000556077 C9JAW5 83 aa6.48□□□□□ -1.37
TTC8-211ENST00000556077 NEBP20929 6669 aa6.47□□□□□ -1.37
TTC8-211ENST00000556077 H3BT86 120 aa6.47□□□□□ -1.37
TTC8-211ENST00000556077 K7EP34 96 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 A0A1B0GVX0 72 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 CCKP06307 115 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 PRO0461Q9UI25 63 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 J3KT08 172 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 DSCR8Q96T75 97 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 PDE6GP18545 87 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC8-211ENST00000556077 A0A1B0GV72 72 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC8-211ENST00000556077 A0A1B0GW54 56 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC8-211ENST00000556077 F8W1H4 67 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC8-211ENST00000556077 NDUFB1O75438 58 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC8-211ENST00000556077 Q6ZQT0 140 aa6.37□□□□□ -1.39
TTC8-211ENST00000556077 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.35□□□□□ -1.39
TTC8-211ENST00000556077 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC8-211ENST00000556077 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.34□□□□□ -1.39
TTC8-211ENST00000556077 VPS25Q9BRG1 176 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC8-211ENST00000556077 A0A1B0GV90 55 aa6.3□□□□□ -1.4
TTC8-211ENST00000556077 A6NN06 94 aa6.3□□□□□ -1.4
TTC8-211ENST00000556077 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.29□□□□□ -1.4
TTC8-211ENST00000556077 ETDBQ3ZM63 59 aa6.27□□□□□ -1.41
TTC8-211ENST00000556077 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.25□□□□□ -1.41
TTC8-211ENST00000556077 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.24□□□□□ -1.41
TTC8-211ENST00000556077 Q6ZVQ6 151 aa6.23□□□□□ -1.41
TTC8-211ENST00000556077 NREPQ16612 68 aa6.21□□□□□ -1.42
TTC8-211ENST00000556077 Q5VV11 94 aa6.2□□□□□ -1.42
TTC8-211ENST00000556077 KRTAP5-9P26371 169 aa6.18□□□□□ -1.42
TTC8-211ENST00000556077 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.17□□□□□ -1.42
TTC8-211ENST00000556077 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.17□□□□□ -1.42
TTC8-211ENST00000556077 ACYP1P07311 99 aa6.16□□□□□ -1.42
TTC8-211ENST00000556077 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
TTC8-211ENST00000556077 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.15□□□□□ -1.42
TTC8-211ENST00000556077 PRR15Q8IV56 129 aa6.15□□□□□ -1.42
TTC8-211ENST00000556077 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.15□□□□□ -1.42
TTC8-211ENST00000556077 UBL5Q9BZL1 73 aa6.15□□□□□ -1.42
TTC8-211ENST00000556077 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.13□□□□□ -1.43
TTC8-211ENST00000556077 BPY2O14599 106 aa6.12□□□□□ -1.43
TTC8-211ENST00000556077 NDUFS5O43920 106 aa6.12□□□□□ -1.43
TTC8-211ENST00000556077 KRTAP10-5P60370 271 aa6.12□□□□□ -1.43
TTC8-211ENST00000556077 MT1BP07438 61 aa6.11□□□□□ -1.43
TTC8-211ENST00000556077 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.11□□□□□ -1.43
TTC8-211ENST00000556077 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.11□□□□□ -1.43
TTC8-211ENST00000556077 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.1□□□□□ -1.43
TTC8-211ENST00000556077 IGKV2-30P06310 120 aa6.1□□□□□ -1.43
TTC8-211ENST00000556077 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.1□□□□□ -1.43
TTC8-211ENST00000556077 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.1□□□□□ -1.43
TTC8-211ENST00000556077 hDV103S1A0JD37 113 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC8-211ENST00000556077 J3QR89 54 aa6.07□□□□□ -1.44
TTC8-211ENST00000556077 K7EQZ3 153 aa6.07□□□□□ -1.44
TTC8-211ENST00000556077 CXCL6P80162 114 aa6.07□□□□□ -1.44
TTC8-211ENST00000556077 CSAG1Q6PB30 78 aa6.07□□□□□ -1.44
TTC8-211ENST00000556077 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.06□□□□□ -1.44
TTC8-211ENST00000556077 C5orf47Q569G3 176 aa6.06□□□□□ -1.44
TTC8-211ENST00000556077 KMT2DO14686 5537 aa6.03□□□□□ -1.44
TTC8-211ENST00000556077 C4orf26Q17RF5 130 aa6.03□□□□□ -1.44
TTC8-211ENST00000556077 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.03□□□□□ -1.44
TTC8-211ENST00000556077 MDN1Q9NU22 5596 aa6.02□□□□□ -1.45
TTC8-211ENST00000556077 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.5 ms