RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555700.1

PAPLN-209, Transcript of papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PAPLN, Length 4,668 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLN-209ENST00000555700 LAMA5O15230 3695 aa7.33□□□□□ -1.24
PAPLN-209ENST00000555700 SPINK7P58062 85 aa7.33□□□□□ -1.24
PAPLN-209ENST00000555700 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PAPLN-209ENST00000555700 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.32□□□□□ -1.24
PAPLN-209ENST00000555700 Q5VV11 94 aa7.31□□□□□ -1.24
PAPLN-209ENST00000555700 Q5VSD8 79 aa7.31□□□□□ -1.24
PAPLN-209ENST00000555700 A0A1B0GU33 70 aa7.3□□□□□ -1.24
PAPLN-209ENST00000555700 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.29□□□□□ -1.24
PAPLN-209ENST00000555700 DMAC1Q96GE9 116 aa7.29□□□□□ -1.24
PAPLN-209ENST00000555700 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.28□□□□□ -1.24
PAPLN-209ENST00000555700 TENM3Q9P273 2699 aa7.27□□□□□ -1.24
PAPLN-209ENST00000555700 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.27□□□□□ -1.25
PAPLN-209ENST00000555700 A0A0D9SG42 100 aa7.27□□□□□ -1.25
PAPLN-209ENST00000555700 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.27□□□□□ -1.25
PAPLN-209ENST00000555700 DMDP11532 3685 aa7.26□□□□□ -1.25
PAPLN-209ENST00000555700 CRIPTQ9P021 101 aa7.25□□□□□ -1.25
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.24□□□□□ -1.25
PAPLN-209ENST00000555700 PDZD2O15018 2839 aa7.24□□□□□ -1.25
PAPLN-209ENST00000555700 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.22□□□□□ -1.25
PAPLN-209ENST00000555700 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.21□□□□□ -1.25
PAPLN-209ENST00000555700 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.21□□□□□ -1.26
PAPLN-209ENST00000555700 LINC01554Q52M75 96 aa7.21□□□□□ -1.26
PAPLN-209ENST00000555700 CSAG1Q6PB30 78 aa7.18□□□□□ -1.26
PAPLN-209ENST00000555700 S4R3F8 94 aa7.18□□□□□ -1.26
PAPLN-209ENST00000555700 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PAPLN-209ENST00000555700 PRAC1Q96KF2 57 aa7.1□□□□□ -1.27
PAPLN-209ENST00000555700 VWFP04275 2813 aa7.09□□□□□ -1.27
PAPLN-209ENST00000555700 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.08□□□□□ -1.28
PAPLN-209ENST00000555700 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PAPLN-209ENST00000555700 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PAPLN-209ENST00000555700 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.02□□□□□ -1.29
PAPLN-209ENST00000555700 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7□□□□□ -1.29
PAPLN-209ENST00000555700 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7□□□□□ -1.29
PAPLN-209ENST00000555700 TENM2Q9NT68 2774 aa6.99□□□□□ -1.29
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.98□□□□□ -1.29
PAPLN-209ENST00000555700 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PAPLN-209ENST00000555700 R4GN34 69 aa6.98□□□□□ -1.29
PAPLN-209ENST00000555700 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.97□□□□□ -1.29
PAPLN-209ENST00000555700 TGP01266 2768 aa6.97□□□□□ -1.29
PAPLN-209ENST00000555700 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.96□□□□□ -1.3
PAPLN-209ENST00000555700 M0R2T5 61 aa6.95□□□□□ -1.3
PAPLN-209ENST00000555700 A8MUU9 505 aa6.93□□□□□ -1.3
PAPLN-209ENST00000555700 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.91□□□□□ -1.3
PAPLN-209ENST00000555700 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.91□□□□□ -1.3
PAPLN-209ENST00000555700 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.87□□□□□ -1.31
PAPLN-209ENST00000555700 M0QZ58 72 aa6.87□□□□□ -1.31
PAPLN-209ENST00000555700 H3BS24 57 aa6.86□□□□□ -1.31
PAPLN-209ENST00000555700 ROMO1P60602 79 aa6.86□□□□□ -1.31
PAPLN-209ENST00000555700 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.85□□□□□ -1.31
PAPLN-209ENST00000555700 A6NN06 94 aa6.83□□□□□ -1.32
PAPLN-209ENST00000555700 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PAPLN-209ENST00000555700 ZFHX3Q15911 3703 aa6.81□□□□□ -1.32
PAPLN-209ENST00000555700 A8MU10 97 aa6.8□□□□□ -1.32
PAPLN-209ENST00000555700 LUZP6Q538Z0 58 aa6.8□□□□□ -1.32
PAPLN-209ENST00000555700 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.77□□□□□ -1.32
PAPLN-209ENST00000555700 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.76□□□□□ -1.33
PAPLN-209ENST00000555700 BSNQ9UPA5 3926 aa6.76□□□□□ -1.33
PAPLN-209ENST00000555700 XP32Q5T750 250 aa6.71□□□□□ -1.34
PAPLN-209ENST00000555700 CUBNO60494 3623 aa6.68□□□□□ -1.34
PAPLN-209ENST00000555700 A0A1B0GVY2 172 aa6.65□□□□□ -1.35
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.64□□□□□ -1.35
PAPLN-209ENST00000555700 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.63□□□□□ -1.35
PAPLN-209ENST00000555700 FBN3Q75N90 2809 aa6.6□□□□□ -1.35
PAPLN-209ENST00000555700 TPRXLQ17RH7 258 aa6.6□□□□□ -1.35
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.6□□□□□ -1.35
PAPLN-209ENST00000555700 PLAC4Q8WY50 150 aa6.59□□□□□ -1.35
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP10-8P60410 259 aa6.57□□□□□ -1.36
PAPLN-209ENST00000555700 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.53□□□□□ -1.36
PAPLN-209ENST00000555700 A0A0A0MQY5 61 aa6.52□□□□□ -1.37
PAPLN-209ENST00000555700 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PAPLN-209ENST00000555700 H0YAA0 97 aa6.49□□□□□ -1.37
PAPLN-209ENST00000555700 COL7A1Q02388 2944 aa6.38□□□□□ -1.39
PAPLN-209ENST00000555700 P0C880 135 aa6.37□□□□□ -1.39
PAPLN-209ENST00000555700 NDUFAF8A1L188 74 aa6.35□□□□□ -1.39
PAPLN-209ENST00000555700 VPS13CQ709C8 3753 aa6.34□□□□□ -1.39
PAPLN-209ENST00000555700 TNP1P09430 55 aa6.34□□□□□ -1.39
PAPLN-209ENST00000555700 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.27□□□□□ -1.41
PAPLN-209ENST00000555700 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PAPLN-209ENST00000555700 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.25□□□□□ -1.41
PAPLN-209ENST00000555700 PP632Q6XCG6 107 aa6.23□□□□□ -1.41
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP10-10P60014 251 aa6.14□□□□□ -1.43
PAPLN-209ENST00000555700 AKAP9Q99996 3911 aa6.12□□□□□ -1.43
PAPLN-209ENST00000555700 MT1HL1P0DM35 61 aa6.12□□□□□ -1.43
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP12-2P59991 146 aa6.08□□□□□ -1.44
PAPLN-209ENST00000555700 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.08□□□□□ -1.44
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP12-1P59990 96 aa6.04□□□□□ -1.44
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.98□□□□□ -1.45
PAPLN-209ENST00000555700 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.95□□□□□ -1.46
PAPLN-209ENST00000555700 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.93□□□□□ -1.46
PAPLN-209ENST00000555700 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.92□□□□□ -1.46
PAPLN-209ENST00000555700 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.9□□□□□ -1.46
PAPLN-209ENST00000555700 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.89□□□□□ -1.47
PAPLN-209ENST00000555700 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.89□□□□□ -1.47
PAPLN-209ENST00000555700 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.88□□□□□ -1.47
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