RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ABCD4-222	ENST00000555617	HSD52	Q0P140	79 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A0B4J2C4	111 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617		A6NJY4	79 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1B0GWB2	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	COX7B	P24311	80 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	FXYD2	P54710	66 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	TSTD3	H0UI37	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	VAMP3	Q15836	100 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	TCL1B	O95988	128 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ABCD4-222	ENST00000555617		M0R143	59 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617	PCP4	P48539	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617		H0YGX0	51 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1B0GV90	55 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617		K7ERJ3	54 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1B0GX51	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617	TRIAP1	O43715	76 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617	SNCG	O76070	127 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617	COX6C	P09669	75 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617		Q6ZQY7	126 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCD4-222	ENST00000555617	PSMB2	P49721	201 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617	DSCR10	P59022	87 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617		H3BQ85	93 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617	LST1	O00453	97 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAC	P01848	142 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617	BATF	Q16520	125 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617		F8WEM9	126 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617	DNAL4	O96015	105 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	SPINK7	P58062	85 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617		Q6JHZ5	121 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617		H3BUT2	72 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	FABP2	P12104	132 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1W2PPM0	123 aa		4.42	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617		H3BMG7	143 aa		4.41	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.41	□□□□□ -1.7
ABCD4-222	ENST00000555617	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617		C9JAW5	83 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617		K7ERU9	68 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617		H3BT86	120 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ABCD4-222	ENST00000555617	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.33	□□□□□ -1.72
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1B0GV72	72 aa		4.33	□□□□□ -1.72
ABCD4-222	ENST00000555617		K7EP34	96 aa		4.33	□□□□□ -1.72
ABCD4-222	ENST00000555617	CCK	P06307	115 aa		4.33	□□□□□ -1.72

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