RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 M0R1W7 72 aa0.12□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 DEFB130BP0DP73 79 aa0.12□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 DEFB130AP0DP74 79 aa0.12□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 RPS27P42677 84 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 SMIM5Q71RC9 77 aa0.12□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.12□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 GNG13Q9P2W3 67 aa0.12□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 DMXL1Q9Y485 3027 aa0.12□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 LMO7Q8WWI1 1683 aa0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 ABCC8Q09428 1581 aa0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 COL6A3P12111 3177 aa0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 LRRK2Q5S007 2527 aa0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 SVEP1Q4LDE5 3571 aa0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 AKAP9Q99996 3911 aa0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 LINC01546A6NGU7 62 aa0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 SNRPGP15A8MWD9 76 aa0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 H0YGG7 62 aa0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 SPRR2DP22532 72 aa0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 LINC00158P58513 81 aa0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 APOBP04114 4563 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 KALRNO60229 2985 aa0.11□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 NBEAQ8NFP9 2946 aa0.1□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 MYO18BQ8IUG5 2567 aa0.1□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 DNAH6Q9C0G6 4158 aa0.1□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 FASNP49327 2511 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 NFAT5O94916 1531 aa0.1□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 STAB2Q8WWQ8 2551 aa0.1□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 FAM186AA6NE01 2351 aa0.1□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 VPS13DQ5THJ4 4388 aa0.1□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 DNAH2Q9P225 4427 aa0.1□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 LRP1BQ9NZR2 4599 aa0.09□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.09□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.39
USP15-218ENST00000552346 M0R2T5 61 aa0.09□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 SONP18583 2426 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 SPG11Q96JI7 2443 aa0.09□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 ZFHX4Q86UP3 3567 aa0.09□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 COL12A1Q99715 3063 aa0.09□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 KIF21BO75037 1637 aa0.09□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 ZANQ9Y493 2812 aa0.09□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 CHD7Q9P2D1 2997 aa0.09□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 DNAH7Q8WXX0 4024 aa0.09□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 DNAH1Q9P2D7 4330 aa0.08□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 ACACAQ13085 2346 aa0.08□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 IQGAP2Q13576 1575 aa0.08□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa0.08□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 IAPPP10997 89 aa0.08□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 FCER1GP30273 86 aa0.08□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 WT1-ASQ06250 92 aa0.08□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 DEFB135Q30KP9 77 aa0.08□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 NMES1Q9C002 83 aa0.08□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 CMC2Q9NRP2 79 aa0.08□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 S4R3F8 94 aa0.08□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa0.08□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 DNAH8Q96JB1 4490 aa0.08□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 SSPOA2VEC9 5147 aa0.07□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 ITPR3Q14573 2671 aa0.07□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa0.07□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 LINC00308Q8TCZ7 52 aa0.07□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 C6orf48Q9UBA6 75 aa0.07□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 LRP2P98164 4655 aa0.07□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 ATP7AQ04656 1500 aa0.07□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 MTORP42345 2549 aa0.07□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa0.07□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 ITPR1Q14643 2758 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 MXRA5Q9NR99 2828 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 COL6A5A8TX70 2615 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 RELNP78509 3460 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 ACACBO00763 2458 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 CCDC168Q8NDH2 2452 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 HTTP42858 3142 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 TLN2Q9Y4G6 2542 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 H0YGX0 51 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 PLNP26678 52 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 SPRR2BP35325 72 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 PRLHP81277 87 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 SERF2P84101 59 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 MINOS1Q5TGZ0 78 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 HMCN2Q8NDA2 5059 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 CSMD1Q96PZ7 3565 aa0.06□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 FRYQ5TBA9 3013 aa0.05□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 TFF3Q07654 80 aa0.05□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 279.6 ms