RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRB-210ENST00000551525 ITPR2Q14571 2701 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 ATMQ13315 3056 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 ITPR1Q14643 2758 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 COL12A1Q99715 3063 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 ZZEF1O43149 2961 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
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PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 HIVEP1P15822 2718 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 TACC2O95359 2948 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 P0C880 135 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRB-210ENST00000551525 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRB-210ENST00000551525 PP632Q6XCG6 107 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRB-210ENST00000551525 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRB-210ENST00000551525 NBEAQ8NFP9 2946 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRB-210ENST00000551525 S4R3F8 94 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRB-210ENST00000551525 KALRNO60229 2985 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRB-210ENST00000551525 R4GN34 69 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRB-210ENST00000551525 APCP25054 2843 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRB-210ENST00000551525 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRB-210ENST00000551525 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRB-210ENST00000551525 TENM4Q6N022 2769 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRB-210ENST00000551525 RELNP78509 3460 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRB-210ENST00000551525 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRB-210ENST00000551525 LRBAP50851 2863 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRB-210ENST00000551525 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRB-210ENST00000551525 BSNQ9UPA5 3926 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRB-210ENST00000551525 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRB-210ENST00000551525 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.54□□□□□ -1.84
PTPRB-210ENST00000551525 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRB-210ENST00000551525 ZANQ9Y493 2812 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRB-210ENST00000551525 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRB-210ENST00000551525 INE1O15225 51 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRB-210ENST00000551525 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRB-210ENST00000551525 H0YAA0 97 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRB-210ENST00000551525 TPRXLQ17RH7 258 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRB-210ENST00000551525 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRB-210ENST00000551525 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRB-210ENST00000551525 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GVY2 172 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRB-210ENST00000551525 NF1P21359 2839 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRB-210ENST00000551525 M0QZ58 72 aa3.42□□□□□ -1.86
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PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP10-8P60410 259 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRB-210ENST00000551525 PDZD2O15018 2839 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP10-10P60014 251 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRB-210ENST00000551525 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRB-210ENST00000551525 SVEP1Q4LDE5 3571 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRB-210ENST00000551525 TENM1Q9UKZ4 2725 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRB-210ENST00000551525 VPS13CQ709C8 3753 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRB-210ENST00000551525 TENM3Q9P273 2699 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRB-210ENST00000551525 TENM2Q9NT68 2774 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRB-210ENST00000551525 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRB-210ENST00000551525 ZFHX3Q15911 3703 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRB-210ENST00000551525 LCE2BO14633 110 aa3.28□□□□□ -1.89
PTPRB-210ENST00000551525 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRB-210ENST00000551525 AKAP9Q99996 3911 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRB-210ENST00000551525 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRB-210ENST00000551525 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRB-210ENST00000551525 LCE2CQ5TA81 110 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRB-210ENST00000551525 VWFP04275 2813 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRB-210ENST00000551525 TGP01266 2768 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRB-210ENST00000551525 CUBNO60494 3623 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP12-2P59991 146 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRB-210ENST00000551525 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.92
PTPRB-210ENST00000551525 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRB-210ENST00000551525 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRB-210ENST00000551525 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP12-1P59990 96 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRB-210ENST00000551525 MT1HL1P0DM35 61 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRB-210ENST00000551525 DNHD1Q96M86 4753 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRB-210ENST00000551525 ALMS1Q8TCU4 4167 aa2.98□□□□□ -1.93
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