RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549107.5

PTPRR-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRR, Length 862 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-208ENST00000549107 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 Q96NJ1 140 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 J3KT08 172 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-208ENST00000549107 ATOX1O00244 68 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-208ENST00000549107 A8MWP4 228 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-208ENST00000549107 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-208ENST00000549107 Q5XG85 94 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-208ENST00000549107 PRR15Q8IV56 129 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-208ENST00000549107 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-208ENST00000549107 LIMD2Q9BT23 127 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-208ENST00000549107 HCG22E2RYF7 251 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 NDUFB1O75438 58 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 SPINK1P00995 79 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 Q8N1X5 172 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 A0A1B0GVX0 72 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 C1orf195Q5TG92 126 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 SERP2Q8N6R1 65 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 COX7CP15954 63 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 CASC2Q6XLA1 102 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 CCDC179H3BU77 68 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRR-208ENST00000549107 HERC1Q15751 4861 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-208ENST00000549107 UQCRQO14949 82 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP10-8P60410 259 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRR-208ENST00000549107 OCR1Q9BZK8 76 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRR-208ENST00000549107 hDV103S1A0JD37 113 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRR-208ENST00000549107 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-208ENST00000549107 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-208ENST00000549107 C8orf87E5RJ46 101 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-208ENST00000549107 TNXBP22105 4242 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-208ENST00000549107 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-208ENST00000549107 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRR-208ENST00000549107 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRR-208ENST00000549107 LINC00313P59037 77 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-208ENST00000549107 C20orf197Q8N268 126 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-208ENST00000549107 MT1HL1P0DM35 61 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-208ENST00000549107 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-208ENST00000549107 NDUFS5O43920 106 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 OXTP01178 125 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 C5orf47Q569G3 176 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 LCE1DQ5T752 114 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 A0A0U1RQV1 116 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 KLKP1Q107X0 134 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 SNURFQ9Y675 71 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 MYCBP2O75592 4640 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 H0Y9P7 68 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 MP68P56378 58 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRR-208ENST00000549107 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRR-208ENST00000549107 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRR-208ENST00000549107 C9orf92A6NGG3 77 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-208ENST00000549107 H3BPC8 53 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-208ENST00000549107 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-208ENST00000549107 LINC00208Q96KT6 92 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRR-208ENST00000549107 H7BZZ5 65 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRR-208ENST00000549107 NDUFC1O43677 76 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRR-208ENST00000549107 Q5W150 140 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-208ENST00000549107 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRR-208ENST00000549107 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-208ENST00000549107 TMEM258P61165 79 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRR-208ENST00000549107 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-208ENST00000549107 A8MUU9 505 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-208ENST00000549107 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-208ENST00000549107 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRR-208ENST00000549107 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRR-208ENST00000549107 FAM236CP0DP71 79 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRR-208ENST00000549107 PRR4Q16378 134 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRR-208ENST00000549107 Q75L30 129 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRR-208ENST00000549107 IGKV2-30P06310 120 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-208ENST00000549107 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-208ENST00000549107 PCOTHQ58A44 107 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRR-208ENST00000549107 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRR-208ENST00000549107 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRR-208ENST00000549107 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRR-208ENST00000549107 TPRXLQ17RH7 258 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRR-208ENST00000549107 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRR-208ENST00000549107 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRR-208ENST00000549107 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRR-208ENST00000549107 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.98□□□□□ -1.45
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