RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-214ENST00000548849 A0A1B0GVX0 72 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-214ENST00000548849 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-214ENST00000548849 SPATA45Q537H7 98 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-214ENST00000548849 A8MWP4 228 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-214ENST00000548849 FXYD2P54710 66 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-214ENST00000548849 VPS25Q9BRG1 176 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-214ENST00000548849 PSMB2P49721 201 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-214ENST00000548849 VAMP8Q9BV40 100 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-214ENST00000548849 COX6CP09669 75 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-214ENST00000548849 S100A1P23297 94 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-214ENST00000548849 UBE2V1Q13404 147 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-214ENST00000548849 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-214ENST00000548849 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-214ENST00000548849 J3KT08 172 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-214ENST00000548849 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-214ENST00000548849 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-214ENST00000548849 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-214ENST00000548849 DSCR8Q96T75 97 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-214ENST00000548849 K7ERJ3 54 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-214ENST00000548849 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-214ENST00000548849 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-214ENST00000548849 NDUFB1O75438 58 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-214ENST00000548849 HSD52Q0P140 79 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-214ENST00000548849 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-214ENST00000548849 C9JAW5 83 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-214ENST00000548849 Q6ZQT0 140 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-214ENST00000548849 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-214ENST00000548849 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8□□□□□ -1.13
CS-214ENST00000548849 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-214ENST00000548849 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-214ENST00000548849 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-214ENST00000548849 Q6ZVQ6 151 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-214ENST00000548849 PRR15Q8IV56 129 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-214ENST00000548849 A0A1B0GW54 56 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-214ENST00000548849 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-214ENST00000548849 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-214ENST00000548849 PYY3Q5JQD4 70 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-214ENST00000548849 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-214ENST00000548849 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-214ENST00000548849 NDUFS5O43920 106 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-214ENST00000548849 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-214ENST00000548849 NEBP20929 6669 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-214ENST00000548849 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-214ENST00000548849 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-214ENST00000548849 NREPQ16612 68 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-214ENST00000548849 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-214ENST00000548849 IGKV2-30P06310 120 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-214ENST00000548849 PDE6GP18545 87 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-214ENST00000548849 hDV103S1A0JD37 113 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-214ENST00000548849 ATXN8Q156A1 80 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-214ENST00000548849 A6NN06 94 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-214ENST00000548849 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-214ENST00000548849 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-214ENST00000548849 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-214ENST00000548849 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-214ENST00000548849 K7EQZ3 153 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-214ENST00000548849 Q5W150 140 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-214ENST00000548849 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-214ENST00000548849 C4orf26Q17RF5 130 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-214ENST00000548849 C5orf47Q569G3 176 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-214ENST00000548849 MT1BP07438 61 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-214ENST00000548849 Q5VV11 94 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-214ENST00000548849 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-214ENST00000548849 BPY2O14599 106 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-214ENST00000548849 HCG22E2RYF7 251 aa7.63□□□□□ -1.19
CS-214ENST00000548849 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.62□□□□□ -1.19
CS-214ENST00000548849 M0R143 59 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-214ENST00000548849 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-214ENST00000548849 KRTAP10-5P60370 271 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-214ENST00000548849 CASC2Q6XLA1 102 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-214ENST00000548849 S4R3F8 94 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-214ENST00000548849 CSAG1Q6PB30 78 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-214ENST00000548849 Q8N9L7 120 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-214ENST00000548849 CXCL6P80162 114 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-214ENST00000548849 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-214ENST00000548849 KRTAP5-9P26371 169 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-214ENST00000548849 LCA10Q71F78 164 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-214ENST00000548849 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-214ENST00000548849 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-214ENST00000548849 KMT2DO14686 5537 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-214ENST00000548849 MDN1Q9NU22 5596 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-214ENST00000548849 KLKP1Q107X0 134 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-214ENST00000548849 H3BT86 120 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-214ENST00000548849 TSTD3H0UI37 97 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-214ENST00000548849 IMUPQ9GZP8 106 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-214ENST00000548849 BATFQ16520 125 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-214ENST00000548849 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-214ENST00000548849 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-214ENST00000548849 C9orf118A6NHY6 69 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-214ENST00000548849 CRIPTQ9P021 101 aa7.36□□□□□ -1.23
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PPM0 123 aa7.35□□□□□ -1.23
CS-214ENST00000548849 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CS-214ENST00000548849 UBL5Q9BZL1 73 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-214ENST00000548849 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-214ENST00000548849 TAX1BP3O14907 124 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-214ENST00000548849 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-214ENST00000548849 A0A087WVE0 104 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-214ENST00000548849 SPRR2EP22531 72 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-214ENST00000548849 SPRR2BP35325 72 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.6 ms