RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.97□□□□□ -0.97
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 PDE6GP18545 87 aa8.95□□□□□ -0.98
GMDS-AS1-211ENST00000533653 Q96NJ1 140 aa8.95□□□□□ -0.98
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.94□□□□□ -0.98
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A1B0GW54 56 aa8.94□□□□□ -0.98
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 DSCR10P59022 87 aa8.74□□□□□ -1.01
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NDUFB1O75438 58 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.7□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A8MWP4 228 aa8.69□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NREPQ16612 68 aa8.69□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-211ENST00000533653 F8W1H4 67 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.65□□□□□ -1.02
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRR15Q8IV56 129 aa8.61□□□□□ -1.03
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.6□□□□□ -1.03
GMDS-AS1-211ENST00000533653 Q6ZVQ6 151 aa8.58□□□□□ -1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BPY2O14599 106 aa8.57□□□□□ -1.04
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.56□□□□□ -1.04
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 UBL5Q9BZL1 73 aa8.56□□□□□ -1.04
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.52□□□□□ -1.05
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ACYP1P07311 99 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CXCL6P80162 114 aa8.42□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MT1HP80294 61 aa8.42□□□□□ -1.06
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A1B0GV90 55 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CASC2Q6XLA1 102 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HCG22E2RYF7 251 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NDUFS5O43920 106 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HRES1P13985 223 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.35□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPINK7P58062 85 aa8.34□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.34□□□□□ -1.07
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GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM236CP0DP71 79 aa8.29□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 M0R2T5 61 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.23□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.23□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 J3QR89 54 aa8.22□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 Q5W150 140 aa8.22□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LINC00643Q86TS7 51 aa8.22□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.17□□□□□ -1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGKV2-30P06310 120 aa8.17□□□□□ -1.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.06□□□□□ -1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.04□□□□□ -1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A087WVE0 104 aa8.03□□□□□ -1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UQCRQO14949 82 aa8.03□□□□□ -1.12
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8□□□□□ -1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 K7ERU9 68 aa8□□□□□ -1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATOX1O00244 68 aa8□□□□□ -1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8□□□□□ -1.13
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C4orf26Q17RF5 130 aa7.99□□□□□ -1.13
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