RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRU-209ENST00000526080 A0A1B0GV72 72 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRU-209ENST00000526080 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP10-5P60370 271 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRU-209ENST00000526080 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRU-209ENST00000526080 COX8AP10176 69 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRU-209ENST00000526080 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRU-209ENST00000526080 DLEU1O43261 78 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRU-209ENST00000526080 TRIAP1O43715 76 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRU-209ENST00000526080 Q5VV11 94 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRU-209ENST00000526080 VAMP8Q9BV40 100 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRU-209ENST00000526080 H3BQ85 93 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRU-209ENST00000526080 J3KT08 172 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRU-209ENST00000526080 SMIM6P0DI80 62 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRU-209ENST00000526080 PYY3Q5JQD4 70 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRU-209ENST00000526080 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRU-209ENST00000526080 DNAL4O96015 105 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRU-209ENST00000526080 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRU-209ENST00000526080 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRU-209ENST00000526080 HIGD1BQ9P298 99 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRU-209ENST00000526080 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRU-209ENST00000526080 SPATA45Q537H7 98 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRU-209ENST00000526080 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRU-209ENST00000526080 DSCR8Q96T75 97 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRU-209ENST00000526080 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRU-209ENST00000526080 UBE2V1Q13404 147 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRU-209ENST00000526080 VPS25Q9BRG1 176 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRU-209ENST00000526080 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRU-209ENST00000526080 NDUFB1O75438 58 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRU-209ENST00000526080 Q6ZQT0 140 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRU-209ENST00000526080 Q6ZVQ6 151 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRU-209ENST00000526080 CEND1Q8N111 149 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRU-209ENST00000526080 TSTD3H0UI37 97 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRU-209ENST00000526080 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRU-209ENST00000526080 C14orf144Q96I85 54 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRU-209ENST00000526080 FXYD2P54710 66 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRU-209ENST00000526080 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRU-209ENST00000526080 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRU-209ENST00000526080 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRU-209ENST00000526080 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRU-209ENST00000526080 A6NJY4 79 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRU-209ENST00000526080 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 SPRR2EP22531 72 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 SPRR2BP35325 72 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 SPRR2AP35326 72 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 C5orf47Q569G3 176 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 PRR15Q8IV56 129 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 C9JAW5 83 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 PSMB2P49721 201 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 K7ERJ3 54 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 IGKV2-30P06310 120 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRU-209ENST00000526080 COX6CP09669 75 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRU-209ENST00000526080 HSD52Q0P140 79 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRU-209ENST00000526080 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRU-209ENST00000526080 M0R143 59 aa6□□□□□ -1.45
PTPRU-209ENST00000526080 C4orf26Q17RF5 130 aa6□□□□□ -1.45
PTPRU-209ENST00000526080 Q5W150 140 aa6□□□□□ -1.45
PTPRU-209ENST00000526080 A0A1B0GW54 56 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRU-209ENST00000526080 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRU-209ENST00000526080 KLKP1Q107X0 134 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRU-209ENST00000526080 hDV103S1A0JD37 113 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRU-209ENST00000526080 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRU-209ENST00000526080 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRU-209ENST00000526080 NDUFS5O43920 106 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRU-209ENST00000526080 S4R3F8 94 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRU-209ENST00000526080 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRU-209ENST00000526080 IMUPQ9GZP8 106 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRU-209ENST00000526080 BATFQ16520 125 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRU-209ENST00000526080 LCA10Q71F78 164 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRU-209ENST00000526080 K7EQZ3 153 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRU-209ENST00000526080 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRU-209ENST00000526080 NREPQ16612 68 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRU-209ENST00000526080 PDE6GP18545 87 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRU-209ENST00000526080 SPRR2DP22532 72 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRU-209ENST00000526080 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRU-209ENST00000526080 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRU-209ENST00000526080 CRIPTQ9P021 101 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRU-209ENST00000526080 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRU-209ENST00000526080 MT1XP80297 61 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRU-209ENST00000526080 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRU-209ENST00000526080 HCG22E2RYF7 251 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRU-209ENST00000526080 C9orf118A6NHY6 69 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRU-209ENST00000526080 TAX1BP3O14907 124 aa5.79□□□□□ -1.48
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