RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-206ENST00000517323 SPINK1P00995 79 aa8.82□□□□□ -1
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.81□□□□□ -1
TRPS1-206ENST00000517323 HERC1Q15751 4861 aa8.8□□□□□ -1
TRPS1-206ENST00000517323 C1orf195Q5TG92 126 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
TRPS1-206ENST00000517323 OXTP01178 125 aa8.79□□□□□ -1
TRPS1-206ENST00000517323 IGKV4-1P06312 121 aa8.78□□□□□ -1
TRPS1-206ENST00000517323 A0A1B0GW54 56 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-206ENST00000517323 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-206ENST00000517323 BPY2O14599 106 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-206ENST00000517323 DSCR10P59022 87 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-206ENST00000517323 J3QL48 77 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-206ENST00000517323 LIMD2Q9BT23 127 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-206ENST00000517323 K7EQZ3 153 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-206ENST00000517323 Q5XG85 94 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-206ENST00000517323 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-206ENST00000517323 LPAP08519 4548 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-206ENST00000517323 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-206ENST00000517323 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-206ENST00000517323 C4orf26Q17RF5 130 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-206ENST00000517323 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-206ENST00000517323 C20orf197Q8N268 126 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-206ENST00000517323 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-206ENST00000517323 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-206ENST00000517323 FAM236CP0DP71 79 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-206ENST00000517323 CXCL6P80162 114 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-206ENST00000517323 A8MWP4 228 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-206ENST00000517323 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.65□□□□□ -1.03
TRPS1-206ENST00000517323 C9orf92A6NGG3 77 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-206ENST00000517323 H7BZZ5 65 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-206ENST00000517323 KLKP1Q107X0 134 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-206ENST00000517323 PRR15Q8IV56 129 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-206ENST00000517323 A0A1B0GVX0 72 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-206ENST00000517323 PRR4Q16378 134 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-206ENST00000517323 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-206ENST00000517323 NDUFB1O75438 58 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-206ENST00000517323 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-206ENST00000517323 LRP2P98164 4655 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-206ENST00000517323 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-206ENST00000517323 NDUFC1O43677 76 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-206ENST00000517323 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-206ENST00000517323 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-206ENST00000517323 HCG22E2RYF7 251 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-206ENST00000517323 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-206ENST00000517323 PRO0628Q9UI54 55 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00313P59037 77 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-206ENST00000517323 SNURFQ9Y675 71 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-206ENST00000517323 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-206ENST00000517323 CASC2Q6XLA1 102 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-206ENST00000517323 hDV103S1A0JD37 113 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-206ENST00000517323 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TRPS1-206ENST00000517323 NDUFS5O43920 106 aa8.44□□□□□ -1.06
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.43□□□□□ -1.06
TRPS1-206ENST00000517323 C8orf87E5RJ46 101 aa8.42□□□□□ -1.06
TRPS1-206ENST00000517323 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
TRPS1-206ENST00000517323 XP32Q5T750 250 aa8.41□□□□□ -1.06
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TRPS1-206ENST00000517323 TPRXLQ17RH7 258 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-206ENST00000517323 OCR1Q9BZK8 76 aa8.37□□□□□ -1.07
TRPS1-206ENST00000517323 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-206ENST00000517323 Q5W150 140 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-206ENST00000517323 MUC2Q02817 5179 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-206ENST00000517323 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-206ENST00000517323 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-206ENST00000517323 A8MUU9 505 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-206ENST00000517323 BRK1Q8WUW1 75 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-206ENST00000517323 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-206ENST00000517323 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-206ENST00000517323 Q75L30 129 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-206ENST00000517323 RNF213Q63HN8 5207 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-206ENST00000517323 PCOTHQ58A44 107 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-206ENST00000517323 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-206ENST00000517323 H0Y9P7 68 aa8.21□□□□□ -1.1
TRPS1-206ENST00000517323 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-206ENST00000517323 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-206ENST00000517323 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-206ENST00000517323 Q1T7F1 81 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00208Q96KT6 92 aa8.17□□□□□ -1.1
TRPS1-206ENST00000517323 V9GYY9 64 aa8.17□□□□□ -1.1
TRPS1-206ENST00000517323 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-206ENST00000517323 IGKV2-30P06310 120 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPS1-206ENST00000517323 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.15□□□□□ -1.11
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.14□□□□□ -1.11
TRPS1-206ENST00000517323 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-206ENST00000517323 MUC17Q685J3 4493 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-206ENST00000517323 MP68P56378 58 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-206ENST00000517323 SPINK7P58062 85 aa8.08□□□□□ -1.12
TRPS1-206ENST00000517323 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-206ENST00000517323 SEC61GP60059 68 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-206ENST00000517323 PMAIP1Q13794 54 aa8.02□□□□□ -1.13
TRPS1-206ENST00000517323 PSPHP1O15172 72 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-206ENST00000517323 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-206ENST00000517323 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPS1-206ENST00000517323 H3BPC8 53 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-206ENST00000517323 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.98□□□□□ -1.13
TRPS1-206ENST00000517323 HRES1P13985 223 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-206ENST00000517323 A8MUN3 132 aa7.95□□□□□ -1.14
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