RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 H3BNG1 76 aa0.31□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 M0QZ58 72 aa0.31□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPRR2BP35325 72 aa0.31□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CLPSL2Q6UWE3 100 aa0.31□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KMT2DO14686 5537 aa0.3□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ACANP16112 2415 aa0.3□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PKD1L2Q7Z442 2459 aa0.29□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 USP24Q9UPU5 2620 aa0.29□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TNP1P09430 55 aa0.29□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.29□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa0.28□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PHGR1C9JFL3 82 aa0.28□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AKAP13Q12802 2813 aa0.28□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CREBBPQ92793 2442 aa0.28□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 A0A0C4DFX4 3053 aa0.28□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 APC2O95996 2303 aa0.27□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PTPN13Q12923 2485 aa0.27□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DEFB110Q30KQ9 67 aa0.27□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WNK1Q9H4A3 2382 aa0.27□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LYSTQ99698 3801 aa0.27□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.26□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PKD1P98161 4303 aa0.26□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 COL6A5A8TX70 2615 aa0.26□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SACSQ9NZJ4 4579 aa0.26□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HECTD1Q9ULT8 2610 aa0.26□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.25□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa0.25□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPRR2AP35326 72 aa0.25□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LEAP2Q969E1 77 aa0.25□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TOMM7Q9P0U1 55 aa0.25□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPTBN4Q9H254 2564 aa0.25□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ACACAQ13085 2346 aa0.25□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa0.24□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 STAB1Q9NY15 2570 aa0.24□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HSPG2P98160 4391 aa0.23□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.23□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.23□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa0.23□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CACNA1AO00555 2505 aa0.23□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HMCN2Q8NDA2 5059 aa0.23□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PDZD2O15018 2839 aa0.22□□□□□ -2.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LRP1BQ9NZR2 4599 aa0.21□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNAH2Q9P225 4427 aa0.21□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa0.21□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNAH11Q96DT5 4516 aa0.21□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MT1AP04731 61 aa0.21□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 VPS13DQ5THJ4 4388 aa0.21□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.21□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNAH3Q8TD57 4116 aa0.21□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SONP18583 2426 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCDC168Q8NDH2 2452 aa0.2□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPRR2EP22531 72 aa0.2□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa0.2□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MTORP42345 2549 aa0.2□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAST4O15021 2626 aa0.19□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DCHS2Q6V1P9 2916 aa0.19□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNAH9Q9NYC9 4486 aa0.19□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPART-AS1P0CW21 52 aa0.19□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 COL7A1Q02388 2944 aa0.19□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ACACBO00763 2458 aa0.19□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PKHD1P08F94 4074 aa0.18□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LRP2P98164 4655 aa0.18□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LINC01590Q5TEZ4 76 aa0.18□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPRR2FQ96RM1 72 aa0.18□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TTTY10Q9BZA0 68 aa0.18□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM186AA6NE01 2351 aa0.18□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZZEF1O43149 2961 aa0.18□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FLNCQ14315 2725 aa0.17□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NF1P21359 2839 aa0.17□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRCDQ00LT1 54 aa0.17□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.17□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZANQ9Y493 2812 aa0.17□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 APOBP04114 4563 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TENM2Q9NT68 2774 aa0.16□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa0.16□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNAH6Q9C0G6 4158 aa0.16□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNAH7Q8WXX0 4024 aa0.16□□□□□ -2.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPG11Q96JI7 2443 aa0.15□□□□□ -2.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.15□□□□□ -2.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DMXL1Q9Y485 3027 aa0.15□□□□□ -2.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNAH1Q9P2D7 4330 aa0.15□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 205.2 ms