RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 COX6CP09669 75 aa8.14□□□□□ -1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 PSMB2P49721 201 aa8.14□□□□□ -1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 MTURNQ8N3F0 131 aa8.14□□□□□ -1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A1B0GVX0 72 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 HSD52Q0P140 79 aa8.1□□□□□ -1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 K7ERJ3 54 aa8.09□□□□□ -1.11
SH3BP4-210ENST00000489601 VPS25Q9BRG1 176 aa8.08□□□□□ -1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 SPINK7P58062 85 aa8.07□□□□□ -1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 J3KT08 172 aa8.05□□□□□ -1.12
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SH3BP4-210ENST00000489601 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.04□□□□□ -1.12
SH3BP4-210ENST00000489601 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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SH3BP4-210ENST00000489601 LINC00846Q9NV44 126 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-210ENST00000489601 Q6ZQT0 140 aa8□□□□□ -1.13
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SH3BP4-210ENST00000489601 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.97□□□□□ -1.13
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SH3BP4-210ENST00000489601 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.95□□□□□ -1.14
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SH3BP4-210ENST00000489601 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.91□□□□□ -1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.9□□□□□ -1.14
SH3BP4-210ENST00000489601 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-210ENST00000489601 Q6ZVQ6 151 aa7.88□□□□□ -1.15
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SH3BP4-210ENST00000489601 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.82□□□□□ -1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.8□□□□□ -1.16
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SH3BP4-210ENST00000489601 hDV103S1A0JD37 113 aa7.74□□□□□ -1.17
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SH3BP4-210ENST00000489601 K7EQZ3 153 aa7.7□□□□□ -1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.68□□□□□ -1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 IGKV2-30P06310 120 aa7.68□□□□□ -1.18
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SH3BP4-210ENST00000489601 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.68□□□□□ -1.18
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SH3BP4-210ENST00000489601 CXCL6P80162 114 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 Q8N9L7 120 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 C5orf47Q569G3 176 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.51□□□□□ -1.21
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SH3BP4-210ENST00000489601 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 A6NN06 94 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 MT1BP07438 61 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 C9orf118A6NHY6 69 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 NEBP20929 6669 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 Q5VV11 94 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.47□□□□□ -1.21
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SH3BP4-210ENST00000489601 CSAG1Q6PB30 78 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-210ENST00000489601 S4R3F8 94 aa7.46□□□□□ -1.22
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SH3BP4-210ENST00000489601 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP4-210ENST00000489601 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.42□□□□□ -1.22
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SH3BP4-210ENST00000489601 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-210ENST00000489601 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP4-210ENST00000489601 CRIPTQ9P021 101 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3BP4-210ENST00000489601 PRO0461Q9UI25 63 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3BP4-210ENST00000489601 K7EP34 96 aa7.21□□□□□ -1.26
SH3BP4-210ENST00000489601 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.21□□□□□ -1.26
SH3BP4-210ENST00000489601 IMUPQ9GZP8 106 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-210ENST00000489601 KMT2DO14686 5537 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A087WVE0 104 aa7.17□□□□□ -1.26
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