RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 SVBPQ8N300 66 aa-1.48□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 C6orf48Q9UBA6 75 aa-1.48□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 NCOA2Q15596 1464 aa-1.49□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 hADV29S1A0JD25 119 aa-1.49□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 NDUFA4O00483 81 aa-1.49□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 PYDC1Q8WXC3 89 aa-1.49□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 MED14O60244 1454 aa-1.5□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-1.5□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 S100A8P05109 93 aa-1.5□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 AKAIN1P0CW23 69 aa-1.5□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 RGPD1P0DJD0 1748 aa-1.5□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 ITSN1Q15811 1721 aa-1.5□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 CEP250Q9BV73 2442 aa-1.5□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-1.5□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 KIF21BO75037 1637 aa-1.51□□□□□ -2.65
SENP6-210ENST00000487548 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-1.51□□□□□ -2.65
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SENP6-210ENST00000487548 S100A1P23297 94 aa-1.52□□□□□ -2.65
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SENP6-210ENST00000487548 HFM1A2PYH4 1435 aa-1.52□□□□□ -2.65
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SENP6-210ENST00000487548 LINC00470Q9BZP3 86 aa-1.53□□□□□ -2.65
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SENP6-210ENST00000487548 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-1.54□□□□□ -2.66
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SENP6-210ENST00000487548 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
SENP6-210ENST00000487548 CLASP1Q7Z460 1538 aa-1.56□□□□□ -2.66
SENP6-210ENST00000487548 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-1.56□□□□□ -2.66
SENP6-210ENST00000487548 UACAQ9BZF9 1416 aa-1.56□□□□□ -2.66
SENP6-210ENST00000487548 PPLO60437 1756 aa-1.56□□□□□ -2.66
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SENP6-210ENST00000487548 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-1.56□□□□□ -2.66
SENP6-210ENST00000487548 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-1.56□□□□□ -2.66
SENP6-210ENST00000487548 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-1.56□□□□□ -2.66
SENP6-210ENST00000487548 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-1.56□□□□□ -2.66
SENP6-210ENST00000487548 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-1.57□□□□□ -2.66
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SENP6-210ENST00000487548 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-1.57□□□□□ -2.66
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SENP6-210ENST00000487548 RALGAPBQ86X10 1494 aa-1.57□□□□□ -2.66
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SENP6-210ENST00000487548 C20orf202A1L168 122 aa-1.58□□□□□ -2.66
SENP6-210ENST00000487548 GNG4P50150 75 aa-1.58□□□□□ -2.66
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SENP6-210ENST00000487548 PZPP20742 1482 aa-1.58□□□□□ -2.66
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SENP6-210ENST00000487548 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP-1.6□□□□□ -2.67
SENP6-210ENST00000487548 LOC400499M0QZD8 3231 aa-1.6□□□□□ -2.67
SENP6-210ENST00000487548 ABCA3Q99758 1704 aa-1.6□□□□□ -2.67
SENP6-210ENST00000487548 UNC80Q8N2C7 3258 aa-1.6□□□□□ -2.67
SENP6-210ENST00000487548 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
SENP6-210ENST00000487548 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.61□□□□□ -2.67
SENP6-210ENST00000487548 MYO5CQ9NQX4 1742 aa-1.61□□□□□ -2.67
SENP6-210ENST00000487548 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
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