RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 H3BQ85 93 aa3.4□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 COX6CP09669 75 aa3.4□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.4□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.4□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 Q75L30 129 aa3.39□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.39□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1W2PNM2 257 aa3.38□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.38□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 Q96NJ1 140 aa3.38□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.37□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 TRACP01848 142 aa3.37□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.37□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.37□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1B0GV72 72 aa3.36□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 UBE2V1Q13404 147 aa3.36□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.36□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.36□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.35□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.35□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 SIGMAR1Q99720 223 aa3.35□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 A8MUU9 505 aa3.34□□□□□ -1.87
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CTDSPL-208ENST00000486978 IGKV4-1P06312 121 aa3.34□□□□□ -1.87
CTDSPL-208ENST00000486978 M0R143 59 aa3.33□□□□□ -1.88
CTDSPL-208ENST00000486978 DSCR10P59022 87 aa3.33□□□□□ -1.88
CTDSPL-208ENST00000486978 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.32□□□□□ -1.88
CTDSPL-208ENST00000486978 SMIM6P0DI80 62 aa3.32□□□□□ -1.88
CTDSPL-208ENST00000486978 LINC00313P59037 77 aa3.32□□□□□ -1.88
CTDSPL-208ENST00000486978 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CTDSPL-208ENST00000486978 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.32□□□□□ -1.88
CTDSPL-208ENST00000486978 DSCR8Q96T75 97 aa3.32□□□□□ -1.88
CTDSPL-208ENST00000486978 VPS25Q9BRG1 176 aa3.32□□□□□ -1.88
CTDSPL-208ENST00000486978 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.32□□□□□ -1.88
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CTDSPL-208ENST00000486978 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.31□□□□□ -1.88
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CTDSPL-208ENST00000486978 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.3□□□□□ -1.88
CTDSPL-208ENST00000486978 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CTDSPL-208ENST00000486978 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.29□□□□□ -1.88
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CTDSPL-208ENST00000486978 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.28□□□□□ -1.88
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1B0GVX0 72 aa3.28□□□□□ -1.88
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CTDSPL-208ENST00000486978 TSTD3H0UI37 97 aa3.28□□□□□ -1.88
CTDSPL-208ENST00000486978 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.28□□□□□ -1.88
CTDSPL-208ENST00000486978 J3KT08 172 aa3.28□□□□□ -1.88
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CTDSPL-208ENST00000486978 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.28□□□□□ -1.88
CTDSPL-208ENST00000486978 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.27□□□□□ -1.89
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CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1B0GW54 56 aa3.26□□□□□ -1.89
CTDSPL-208ENST00000486978 PDE6GP18545 87 aa3.26□□□□□ -1.89
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CTDSPL-208ENST00000486978 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.23□□□□□ -1.89
CTDSPL-208ENST00000486978 A8MWP4 228 aa3.23□□□□□ -1.89
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM236CP0DP71 79 aa3.23□□□□□ -1.89
CTDSPL-208ENST00000486978 HRES1P13985 223 aa3.23□□□□□ -1.89
CTDSPL-208ENST00000486978 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.23□□□□□ -1.89
CTDSPL-208ENST00000486978 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.23□□□□□ -1.89
CTDSPL-208ENST00000486978 H3BT86 120 aa3.22□□□□□ -1.89
CTDSPL-208ENST00000486978 TAX1BP3O14907 124 aa3.22□□□□□ -1.89
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CTDSPL-208ENST00000486978 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
CTDSPL-208ENST00000486978 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.22□□□□□ -1.89
CTDSPL-208ENST00000486978 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.21□□□□□ -1.9
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1W2PPM0 123 aa3.21□□□□□ -1.9
CTDSPL-208ENST00000486978 PCP4P48539 62 aa3.21□□□□□ -1.9
CTDSPL-208ENST00000486978 NREPQ16612 68 aa3.21□□□□□ -1.9
CTDSPL-208ENST00000486978 KMT2DO14686 5537 aa3.21□□□□□ -1.9
CTDSPL-208ENST00000486978 PRR15Q8IV56 129 aa3.2□□□□□ -1.9
CTDSPL-208ENST00000486978 SPINK7P58062 85 aa3.19□□□□□ -1.9
CTDSPL-208ENST00000486978 Q6ZVQ6 151 aa3.19□□□□□ -1.9
CTDSPL-208ENST00000486978 MTURNQ8N3F0 131 aa3.19□□□□□ -1.9
CTDSPL-208ENST00000486978 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.17□□□□□ -1.9
CTDSPL-208ENST00000486978 KRTAP10-10P60014 251 aa3.17□□□□□ -1.9
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.17□□□□□ -1.9
CTDSPL-208ENST00000486978 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
CTDSPL-208ENST00000486978 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.17□□□□□ -1.9
CTDSPL-208ENST00000486978 K7EQZ3 153 aa3.16□□□□□ -1.9
CTDSPL-208ENST00000486978 hDV103S1A0JD37 113 aa3.15□□□□□ -1.91
CTDSPL-208ENST00000486978 BPY2O14599 106 aa3.15□□□□□ -1.91
CTDSPL-208ENST00000486978 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.15□□□□□ -1.91
CTDSPL-208ENST00000486978 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.15□□□□□ -1.91
CTDSPL-208ENST00000486978 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.15□□□□□ -1.91
CTDSPL-208ENST00000486978 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.15□□□□□ -1.91
CTDSPL-208ENST00000486978 LINC00846Q9NV44 126 aa3.15□□□□□ -1.91
CTDSPL-208ENST00000486978 NDUFS5O43920 106 aa3.14□□□□□ -1.91
CTDSPL-208ENST00000486978 K7EP34 96 aa3.12□□□□□ -1.91
CTDSPL-208ENST00000486978 PRO0461Q9UI25 63 aa3.12□□□□□ -1.91
CTDSPL-208ENST00000486978 CASC2Q6XLA1 102 aa3.11□□□□□ -1.91
CTDSPL-208ENST00000486978 Q8N9L7 120 aa3.11□□□□□ -1.91
CTDSPL-208ENST00000486978 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.1□□□□□ -1.91
CTDSPL-208ENST00000486978 UBL5Q9BZL1 73 aa3.1□□□□□ -1.91
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