RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483863.2

PDE4B-208, Transcript of phosphodiesterase 4B, human

TSL 4

Gene PDE4B, Length 572 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4B-208	ENST00000483863	KMT2A	Q03164	3969 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	SPTBN2	O15020	2390 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	F8	P00451	2351 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	KALRN	O60229	2985 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	COL6A5	A8TX70	2615 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	NCOR1	O75376	2440 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863		M0QY20	66 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	SPINK1	P00995	79 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	DEFB131A	P59861	70 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	DEFB106A	Q8N104	65 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	ITPR3	Q14573	2671 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	TACC2	O95359	2948 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	CEP290	O15078	2479 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	TTC28	Q96AY4	2481 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	TNXB	P22105	4242 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	LRBA	P50851	2863 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	MUC3A	Q02505	3323 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	ATM	Q13315	3056 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	NF1	P21359	2839 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	DNAH2	Q9P225	4427 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	LAMA5	O15230	3695 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	COL7A1	Q02388	2944 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863		H3BUA1	57 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	PRCD	Q00LT1	54 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	COL12A1	Q99715	3063 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	PKD1	P98161	4303 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	CUBN	O60494	3623 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	AKAP9	Q99996	3911 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	SMR3A	Q99954	134 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	FRYL	O94915	3013 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	HTT	P42858	3142 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	HIVEP1	P15822	2718 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	TRIO	O75962	3097 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	AKAP6	Q13023	2319 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	PIEZO1	Q92508	2521 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	ZAN	Q9Y493	2812 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863		K7EIM0	57 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	PRM1	P04553	51 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	CEP350	Q5VT06	3117 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	DMD	P11532	3685 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	ACACA	Q13085	2346 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	STAB1	Q9NY15	2570 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	NBAS	A2RRP1	2371 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
PDE4B-208	ENST00000483863	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		0.17	□□□□□ -2.38

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