RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481114.1

SDCCAG3-210, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 2

Gene SDCCAG3, Length 340 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-210ENST00000481114 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.27□□□□□ -1.41
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.27□□□□□ -1.41
SDCCAG3-210ENST00000481114 H3BQ85 93 aa6.26□□□□□ -1.41
SDCCAG3-210ENST00000481114 SMIM6P0DI80 62 aa6.26□□□□□ -1.41
SDCCAG3-210ENST00000481114 DLEU1O43261 78 aa6.25□□□□□ -1.41
SDCCAG3-210ENST00000481114 VPS25Q9BRG1 176 aa6.25□□□□□ -1.41
SDCCAG3-210ENST00000481114 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.25□□□□□ -1.41
SDCCAG3-210ENST00000481114 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.24□□□□□ -1.41
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRIAP1O43715 76 aa6.24□□□□□ -1.41
SDCCAG3-210ENST00000481114 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.23□□□□□ -1.41
SDCCAG3-210ENST00000481114 A6NN06 94 aa6.22□□□□□ -1.41
SDCCAG3-210ENST00000481114 J3KT08 172 aa6.22□□□□□ -1.41
SDCCAG3-210ENST00000481114 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.22□□□□□ -1.41
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIGD1BQ9P298 99 aa6.22□□□□□ -1.41
SDCCAG3-210ENST00000481114 C14orf144Q96I85 54 aa6.21□□□□□ -1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 NDUFB1O75438 58 aa6.2□□□□□ -1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.19□□□□□ -1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 A6NJY4 79 aa6.19□□□□□ -1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 CEND1Q8N111 149 aa6.19□□□□□ -1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 DSCR8Q96T75 97 aa6.19□□□□□ -1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 UBE2V1Q13404 147 aa6.18□□□□□ -1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.17□□□□□ -1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 PSMB2P49721 201 aa6.17□□□□□ -1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.17□□□□□ -1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 FXYD2P54710 66 aa6.15□□□□□ -1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.15□□□□□ -1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 COX6CP09669 75 aa6.14□□□□□ -1.43
SDCCAG3-210ENST00000481114 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.14□□□□□ -1.43
SDCCAG3-210ENST00000481114 SPATA45Q537H7 98 aa6.13□□□□□ -1.43
SDCCAG3-210ENST00000481114 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.13□□□□□ -1.43
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q6ZQT0 140 aa6.12□□□□□ -1.43
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q6ZVQ6 151 aa6.12□□□□□ -1.43
SDCCAG3-210ENST00000481114 C9JAW5 83 aa6.1□□□□□ -1.43
SDCCAG3-210ENST00000481114 MT1BP07438 61 aa6.1□□□□□ -1.43
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q5VV11 94 aa6.1□□□□□ -1.43
SDCCAG3-210ENST00000481114 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.09□□□□□ -1.43
SDCCAG3-210ENST00000481114 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.09□□□□□ -1.43
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP5-9P26371 169 aa6.09□□□□□ -1.43
SDCCAG3-210ENST00000481114 A0A1B0GV90 55 aa6.07□□□□□ -1.44
SDCCAG3-210ENST00000481114 TSTD3H0UI37 97 aa6.07□□□□□ -1.44
SDCCAG3-210ENST00000481114 K7ERJ3 54 aa6.07□□□□□ -1.44
SDCCAG3-210ENST00000481114 VAMP8Q9BV40 100 aa6.06□□□□□ -1.44
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP10-5P60370 271 aa6.05□□□□□ -1.44
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.04□□□□□ -1.44
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGKV2-30P06310 120 aa6.04□□□□□ -1.44
SDCCAG3-210ENST00000481114 PYY3Q5JQD4 70 aa6.04□□□□□ -1.44
SDCCAG3-210ENST00000481114 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SDCCAG3-210ENST00000481114 NDUFS5O43920 106 aa6.03□□□□□ -1.44
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.03□□□□□ -1.44
SDCCAG3-210ENST00000481114 PRR15Q8IV56 129 aa6.03□□□□□ -1.44
SDCCAG3-210ENST00000481114 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.03□□□□□ -1.44
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.02□□□□□ -1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.02□□□□□ -1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.02□□□□□ -1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.02□□□□□ -1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 KMT2DO14686 5537 aa6.01□□□□□ -1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.01□□□□□ -1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 C5orf47Q569G3 176 aa6.01□□□□□ -1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.01□□□□□ -1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 HSD52Q0P140 79 aa6□□□□□ -1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6□□□□□ -1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 A0A1B0GW54 56 aa5.99□□□□□ -1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 MDN1Q9NU22 5596 aa5.98□□□□□ -1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 hDV103S1A0JD37 113 aa5.98□□□□□ -1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 M0R143 59 aa5.97□□□□□ -1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 C4orf26Q17RF5 130 aa5.97□□□□□ -1.45
SDCCAG3-210ENST00000481114 PCP4P48539 62 aa5.96□□□□□ -1.46
SDCCAG3-210ENST00000481114 NREPQ16612 68 aa5.95□□□□□ -1.46
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q5W150 140 aa5.95□□□□□ -1.46
SDCCAG3-210ENST00000481114 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.94□□□□□ -1.46
SDCCAG3-210ENST00000481114 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.94□□□□□ -1.46
SDCCAG3-210ENST00000481114 IMUPQ9GZP8 106 aa5.93□□□□□ -1.46
SDCCAG3-210ENST00000481114 PDE6GP18545 87 aa5.92□□□□□ -1.46
SDCCAG3-210ENST00000481114 CSAG1Q6PB30 78 aa5.92□□□□□ -1.46
SDCCAG3-210ENST00000481114 S4R3F8 94 aa5.91□□□□□ -1.46
SDCCAG3-210ENST00000481114 K7EQZ3 153 aa5.9□□□□□ -1.46
SDCCAG3-210ENST00000481114 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.89□□□□□ -1.47
SDCCAG3-210ENST00000481114 KLKP1Q107X0 134 aa5.88□□□□□ -1.47
SDCCAG3-210ENST00000481114 SPRR2EP22531 72 aa5.87□□□□□ -1.47
SDCCAG3-210ENST00000481114 SPRR2BP35325 72 aa5.87□□□□□ -1.47
SDCCAG3-210ENST00000481114 SPRR2AP35326 72 aa5.87□□□□□ -1.47
SDCCAG3-210ENST00000481114 ATXN8Q156A1 80 aa5.87□□□□□ -1.47
SDCCAG3-210ENST00000481114 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.86□□□□□ -1.47
SDCCAG3-210ENST00000481114 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.86□□□□□ -1.47
SDCCAG3-210ENST00000481114 LCA10Q71F78 164 aa5.85□□□□□ -1.47
SDCCAG3-210ENST00000481114 HCG22E2RYF7 251 aa5.84□□□□□ -1.47
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.84□□□□□ -1.47
SDCCAG3-210ENST00000481114 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.81□□□□□ -1.48
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.81□□□□□ -1.48
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.81□□□□□ -1.48
SDCCAG3-210ENST00000481114 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.81□□□□□ -1.48
SDCCAG3-210ENST00000481114 BPY2O14599 106 aa5.8□□□□□ -1.48
SDCCAG3-210ENST00000481114 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SDCCAG3-210ENST00000481114 CASC2Q6XLA1 102 aa5.8□□□□□ -1.48
SDCCAG3-210ENST00000481114 CXCL6P80162 114 aa5.79□□□□□ -1.48
SDCCAG3-210ENST00000481114 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SDCCAG3-210ENST00000481114 BATFQ16520 125 aa5.76□□□□□ -1.49
SDCCAG3-210ENST00000481114 SVIPQ8NHG7 77 aa5.76□□□□□ -1.49
SDCCAG3-210ENST00000481114 CRIPTQ9P021 101 aa5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.7 ms