RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.87□□□□□ -1.79
MITF-215ENST00000478490 NREPQ16612 68 aa3.86□□□□□ -1.79
MITF-215ENST00000478490 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.86□□□□□ -1.79
MITF-215ENST00000478490 A0A087WVE0 104 aa3.85□□□□□ -1.79
MITF-215ENST00000478490 CRYGAP11844 174 aa3.85□□□□□ -1.79
MITF-215ENST00000478490 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.85□□□□□ -1.79
MITF-215ENST00000478490 C1orf137Q5JT78 98 aa3.85□□□□□ -1.79
MITF-215ENST00000478490 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.85□□□□□ -1.79
MITF-215ENST00000478490 A0A1W2PNN7 141 aa3.84□□□□□ -1.79
MITF-215ENST00000478490 Q8NBF4 154 aa3.84□□□□□ -1.79
MITF-215ENST00000478490 SPRR4Q96PI1 79 aa3.84□□□□□ -1.79
MITF-215ENST00000478490 MT1HL1P0DM35 61 aa3.84□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.83□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 BPY2O14599 106 aa3.83□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 SPRR1BP22528 89 aa3.83□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.82□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 ERC2-IT1O76042 136 aa3.82□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.82□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 A0A1W2PNM2 257 aa3.81□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 UBE2AP49459 152 aa3.81□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.81□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 LRP2P98164 4655 aa3.81□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 PRLHP81277 87 aa3.81□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 SMIM29Q86T20 159 aa3.81□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 TMEM258P61165 79 aa3.8□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 IGKV4-1P06312 121 aa3.79□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 IGFL1Q6UW32 110 aa3.78□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.78□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 LPAP08519 4548 aa3.78□□□□□ -1.8
MITF-215ENST00000478490 A0A0U1RQV1 116 aa3.77□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 NDUFC1O43677 76 aa3.77□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.77□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 KLKP1Q107X0 134 aa3.77□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.77□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.77□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.75□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 FAM236CP0DP71 79 aa3.75□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 KRTAP10-8P60410 259 aa3.75□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 PMAIP1Q13794 54 aa3.75□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 C20orf197Q8N268 126 aa3.75□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 A0A087WSZ3 146 aa3.74□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 J3KT08 172 aa3.74□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 LINC00483Q53H64 154 aa3.74□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 RNF213Q63HN8 5207 aa3.74□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.73□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 DSCR10P59022 87 aa3.73□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 OCR1Q9BZK8 76 aa3.73□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 HCG22E2RYF7 251 aa3.73□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 ZNF861PO60384 105 aa3.73□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 IGLV7-43P04211 117 aa3.73□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 Q8N9L7 120 aa3.73□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.72□□□□□ -1.81
MITF-215ENST00000478490 K7EQZ3 153 aa3.71□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 A8MWP4 228 aa3.7□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 H7BZZ5 65 aa3.7□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 NDUFB1O75438 58 aa3.7□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.7□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 C8orf87E5RJ46 101 aa3.7□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 PRR15Q8IV56 129 aa3.7□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.7□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 H3BPC8 53 aa3.68□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.68□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 SNURFQ9Y675 71 aa3.68□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 A0A0G2JQZ4 141 aa3.67□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 MP68P56378 58 aa3.67□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.67□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 CASC2Q6XLA1 102 aa3.66□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.66□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 NDUFS5O43920 106 aa3.66□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 MOBPQ13875 183 aa3.66□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.66□□□□□ -1.82
MITF-215ENST00000478490 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.65□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.65□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 PRR4Q16378 134 aa3.64□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.64□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 A0A087X002 238 aa3.63□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.63□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 Q96NJ1 140 aa3.63□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.62□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 hDV103S1A0JD37 113 aa3.62□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.62□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.62□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.62□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 A0A1B0GVX0 72 aa3.62□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.62□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.62□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.61□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 Q5XG85 94 aa3.61□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.61□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.6□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.6□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 H0Y9P7 68 aa3.6□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 MUC17Q685J3 4493 aa3.6□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.59□□□□□ -1.83
MITF-215ENST00000478490 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms