RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 LINC00313P59037 77 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-210ENST00000477529 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-210ENST00000477529 MTURNQ8N3F0 131 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-210ENST00000477529 H3BT86 120 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-210ENST00000477529 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.34□□□□□ -1.23
SRRT-210ENST00000477529 PDE6GP18545 87 aa7.34□□□□□ -1.23
SRRT-210ENST00000477529 A0A1B0GVX0 72 aa7.33□□□□□ -1.24
SRRT-210ENST00000477529 A0A1B0GW54 56 aa7.33□□□□□ -1.24
SRRT-210ENST00000477529 MT1HP80294 61 aa7.33□□□□□ -1.24
SRRT-210ENST00000477529 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SRRT-210ENST00000477529 J3KT08 172 aa7.31□□□□□ -1.24
SRRT-210ENST00000477529 C8orf87E5RJ46 101 aa7.3□□□□□ -1.24
SRRT-210ENST00000477529 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.3□□□□□ -1.24
SRRT-210ENST00000477529 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.28□□□□□ -1.24
SRRT-210ENST00000477529 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.27□□□□□ -1.25
SRRT-210ENST00000477529 A8MWP4 228 aa7.25□□□□□ -1.25
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.25□□□□□ -1.25
SRRT-210ENST00000477529 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SRRT-210ENST00000477529 NDUFB1O75438 58 aa7.23□□□□□ -1.25
SRRT-210ENST00000477529 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.22□□□□□ -1.25
SRRT-210ENST00000477529 K7EP34 96 aa7.21□□□□□ -1.26
SRRT-210ENST00000477529 NREPQ16612 68 aa7.21□□□□□ -1.26
SRRT-210ENST00000477529 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.21□□□□□ -1.26
SRRT-210ENST00000477529 PRO0461Q9UI25 63 aa7.21□□□□□ -1.26
SRRT-210ENST00000477529 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.19□□□□□ -1.26
SRRT-210ENST00000477529 PRR15Q8IV56 129 aa7.18□□□□□ -1.26
SRRT-210ENST00000477529 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SRRT-210ENST00000477529 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SRRT-210ENST00000477529 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SRRT-210ENST00000477529 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-210ENST00000477529 K7EQZ3 153 aa7.15□□□□□ -1.26
SRRT-210ENST00000477529 M0R2T5 61 aa7.14□□□□□ -1.27
SRRT-210ENST00000477529 HRES1P13985 223 aa7.14□□□□□ -1.27
SRRT-210ENST00000477529 Q6ZVQ6 151 aa7.14□□□□□ -1.27
SRRT-210ENST00000477529 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-210ENST00000477529 BPY2O14599 106 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-210ENST00000477529 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-210ENST00000477529 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-210ENST00000477529 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SRRT-210ENST00000477529 hDV103S1A0JD37 113 aa7.07□□□□□ -1.28
SRRT-210ENST00000477529 LINC00846Q9NV44 126 aa7.07□□□□□ -1.28
SRRT-210ENST00000477529 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.06□□□□□ -1.28
SRRT-210ENST00000477529 FAM236CP0DP71 79 aa7.06□□□□□ -1.28
SRRT-210ENST00000477529 SPINK7P58062 85 aa7.06□□□□□ -1.28
SRRT-210ENST00000477529 Q8N9L7 120 aa7.06□□□□□ -1.28
SRRT-210ENST00000477529 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.06□□□□□ -1.28
SRRT-210ENST00000477529 F8W1H4 67 aa7.04□□□□□ -1.28
SRRT-210ENST00000477529 ETDBQ3ZM63 59 aa7.03□□□□□ -1.28
SRRT-210ENST00000477529 UBL5Q9BZL1 73 aa7.03□□□□□ -1.28
SRRT-210ENST00000477529 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.02□□□□□ -1.29
SRRT-210ENST00000477529 NDUFS5O43920 106 aa7.01□□□□□ -1.29
SRRT-210ENST00000477529 CASC2Q6XLA1 102 aa6.99□□□□□ -1.29
SRRT-210ENST00000477529 Q5W150 140 aa6.96□□□□□ -1.3
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.95□□□□□ -1.3
SRRT-210ENST00000477529 HCG22E2RYF7 251 aa6.95□□□□□ -1.3
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.95□□□□□ -1.3
SRRT-210ENST00000477529 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.93□□□□□ -1.3
SRRT-210ENST00000477529 CXCL6P80162 114 aa6.92□□□□□ -1.3
SRRT-210ENST00000477529 LCE2BO14633 110 aa6.91□□□□□ -1.3
SRRT-210ENST00000477529 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.89□□□□□ -1.31
SRRT-210ENST00000477529 IGKV2-30P06310 120 aa6.89□□□□□ -1.31
SRRT-210ENST00000477529 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.89□□□□□ -1.31
SRRT-210ENST00000477529 MT2AP02795 61 aa6.87□□□□□ -1.31
SRRT-210ENST00000477529 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.86□□□□□ -1.31
SRRT-210ENST00000477529 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.86□□□□□ -1.31
SRRT-210ENST00000477529 ACYP1P07311 99 aa6.84□□□□□ -1.31
SRRT-210ENST00000477529 A0A1B0GV90 55 aa6.83□□□□□ -1.32
SRRT-210ENST00000477529 MT1FP04733 61 aa6.83□□□□□ -1.32
SRRT-210ENST00000477529 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.79□□□□□ -1.32
SRRT-210ENST00000477529 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.78□□□□□ -1.32
SRRT-210ENST00000477529 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.78□□□□□ -1.32
SRRT-210ENST00000477529 C4orf26Q17RF5 130 aa6.76□□□□□ -1.33
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP10-10P60014 251 aa6.74□□□□□ -1.33
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.73□□□□□ -1.33
SRRT-210ENST00000477529 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SRRT-210ENST00000477529 USH2AO75445 5202 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-210ENST00000477529 LINC00643Q86TS7 51 aa6.69□□□□□ -1.34
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.69□□□□□ -1.34
SRRT-210ENST00000477529 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.68□□□□□ -1.34
SRRT-210ENST00000477529 A0A087WVE0 104 aa6.67□□□□□ -1.34
SRRT-210ENST00000477529 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.65□□□□□ -1.34
SRRT-210ENST00000477529 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.64□□□□□ -1.35
SRRT-210ENST00000477529 SSPOA2VEC9 5147 aa6.64□□□□□ -1.35
SRRT-210ENST00000477529 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.61□□□□□ -1.35
SRRT-210ENST00000477529 UQCRQO14949 82 aa6.6□□□□□ -1.35
SRRT-210ENST00000477529 S4R3F8 94 aa6.6□□□□□ -1.35
SRRT-210ENST00000477529 H0Y9P7 68 aa6.59□□□□□ -1.35
SRRT-210ENST00000477529 J3QR89 54 aa6.58□□□□□ -1.36
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SRRT-210ENST00000477529 ATOX1O00244 68 aa6.56□□□□□ -1.36
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SRRT-210ENST00000477529 CSAG1Q6PB30 78 aa6.5□□□□□ -1.37
SRRT-210ENST00000477529 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.5□□□□□ -1.37
SRRT-210ENST00000477529 LINC00208Q96KT6 92 aa6.48□□□□□ -1.37
SRRT-210ENST00000477529 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.45□□□□□ -1.38
SRRT-210ENST00000477529 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.45□□□□□ -1.38
SRRT-210ENST00000477529 KLKP1Q107X0 134 aa6.45□□□□□ -1.38
SRRT-210ENST00000477529 MP68P56378 58 aa6.44□□□□□ -1.38
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