RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
C9orf3-211ENST00000463372 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.43□□□□□ -1.54
C9orf3-211ENST00000463372 LCA10Q71F78 164 aa5.42□□□□□ -1.54
C9orf3-211ENST00000463372 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.42□□□□□ -1.54
C9orf3-211ENST00000463372 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.41□□□□□ -1.54
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C9orf3-211ENST00000463372 CRIPTQ9P021 101 aa5.41□□□□□ -1.54
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C9orf3-211ENST00000463372 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.35□□□□□ -1.55
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C9orf3-211ENST00000463372 C12orf57Q99622 126 aa5.32□□□□□ -1.56
C9orf3-211ENST00000463372 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.31□□□□□ -1.56
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C9orf3-211ENST00000463372 LINC01545Q5VT33 79 aa5.27□□□□□ -1.57
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C9orf3-211ENST00000463372 C4orf26Q17RF5 130 aa5.23□□□□□ -1.57
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C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.22□□□□□ -1.57
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C9orf3-211ENST00000463372 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.18□□□□□ -1.58
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C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-211ENST00000463372 K7EQZ3 153 aa5.1□□□□□ -1.59
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C9orf3-211ENST00000463372 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.99□□□□□ -1.61
C9orf3-211ENST00000463372 C14orf144Q96I85 54 aa4.99□□□□□ -1.61
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C9orf3-211ENST00000463372 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.97□□□□□ -1.61
C9orf3-211ENST00000463372 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.97□□□□□ -1.61
C9orf3-211ENST00000463372 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
C9orf3-211ENST00000463372 DLEU1O43261 78 aa4.96□□□□□ -1.62
C9orf3-211ENST00000463372 MT1EP04732 61 aa4.96□□□□□ -1.62
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.96□□□□□ -1.62
C9orf3-211ENST00000463372 SPATA45Q537H7 98 aa4.96□□□□□ -1.62
C9orf3-211ENST00000463372 Q5W150 140 aa4.95□□□□□ -1.62
C9orf3-211ENST00000463372 VAMP8Q9BV40 100 aa4.94□□□□□ -1.62
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