RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462351.5

PTPRN-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 5,099 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-211ENST00000462351 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRN-211ENST00000462351 ZANQ9Y493 2812 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRN-211ENST00000462351 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRN-211ENST00000462351 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRN-211ENST00000462351 PLAC4Q8WY50 150 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRN-211ENST00000462351 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRN-211ENST00000462351 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRN-211ENST00000462351 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRN-211ENST00000462351 COL6A5A8TX70 2615 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRN-211ENST00000462351 PANO1I0J062 215 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRN-211ENST00000462351 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRN-211ENST00000462351 APCP25054 2843 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRN-211ENST00000462351 A0A087X002 238 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRN-211ENST00000462351 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRN-211ENST00000462351 LCE6AA0A183 80 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRN-211ENST00000462351 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRN-211ENST00000462351 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRN-211ENST00000462351 A8MU10 97 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRN-211ENST00000462351 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRN-211ENST00000462351 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRN-211ENST00000462351 ITPR2Q14571 2701 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRN-211ENST00000462351 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRN-211ENST00000462351 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRN-211ENST00000462351 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRN-211ENST00000462351 FBN2P35556 2912 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRN-211ENST00000462351 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRN-211ENST00000462351 A8MUU9 505 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRN-211ENST00000462351 NF1P21359 2839 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRN-211ENST00000462351 BSNQ9UPA5 3926 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP10-2P60368 255 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRN-211ENST00000462351 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP10-1P60331 282 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRN-211ENST00000462351 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRN-211ENST00000462351 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRN-211ENST00000462351 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRN-211ENST00000462351 HIVEP1P15822 2718 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRN-211ENST00000462351 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRN-211ENST00000462351 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.15□□□□□ -1.1
PTPRN-211ENST00000462351 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRN-211ENST00000462351 TNP1P09430 55 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRN-211ENST00000462351 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRN-211ENST00000462351 Q5VSD8 79 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRN-211ENST00000462351 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRN-211ENST00000462351 PP632Q6XCG6 107 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRN-211ENST00000462351 PDZD2O15018 2839 aa8□□□□□ -1.13
PTPRN-211ENST00000462351 P0C880 135 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRN-211ENST00000462351 TENM4Q6N022 2769 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRN-211ENST00000462351 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRN-211ENST00000462351 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRN-211ENST00000462351 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRN-211ENST00000462351 H0YAA0 97 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRN-211ENST00000462351 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRN-211ENST00000462351 TENM3Q9P273 2699 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRN-211ENST00000462351 VWFP04275 2813 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRN-211ENST00000462351 VPS13CQ709C8 3753 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP10-8P60410 259 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRN-211ENST00000462351 CUBNO60494 3623 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRN-211ENST00000462351 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRN-211ENST00000462351 ZFHX3Q15911 3703 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-211ENST00000462351 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-211ENST00000462351 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-211ENST00000462351 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRN-211ENST00000462351 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRN-211ENST00000462351 AKAP9Q99996 3911 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRN-211ENST00000462351 XP32Q5T750 250 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRN-211ENST00000462351 TENM2Q9NT68 2774 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRN-211ENST00000462351 TGP01266 2768 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRN-211ENST00000462351 A0A1B0GVY2 172 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRN-211ENST00000462351 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRN-211ENST00000462351 TPRXLQ17RH7 258 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP12-2P59991 146 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP10-10P60014 251 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRN-211ENST00000462351 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP12-1P59990 96 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRN-211ENST00000462351 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRN-211ENST00000462351 INE1O15225 51 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRN-211ENST00000462351 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRN-211ENST00000462351 FBN3Q75N90 2809 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRN-211ENST00000462351 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRN-211ENST00000462351 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRN-211ENST00000462351 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRN-211ENST00000462351 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRN-211ENST00000462351 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRN-211ENST00000462351 COL7A1Q02388 2944 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRN-211ENST00000462351 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRN-211ENST00000462351 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN-211ENST00000462351 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.7□□□□□ -1.34
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