RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.42□□□□□ -1.22
NISCH-203ENST00000460759 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.42□□□□□ -1.22
NISCH-203ENST00000460759 A0A087WVE0 104 aa7.41□□□□□ -1.22
NISCH-203ENST00000460759 K7EQZ3 153 aa7.41□□□□□ -1.22
NISCH-203ENST00000460759 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.41□□□□□ -1.22
NISCH-203ENST00000460759 PRR15Q8IV56 129 aa7.41□□□□□ -1.22
NISCH-203ENST00000460759 Q8N9L7 120 aa7.4□□□□□ -1.22
NISCH-203ENST00000460759 ATOX1O00244 68 aa7.39□□□□□ -1.23
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP10-8P60410 259 aa7.39□□□□□ -1.23
NISCH-203ENST00000460759 OXTP01178 125 aa7.38□□□□□ -1.23
NISCH-203ENST00000460759 A0A1B0GVX0 72 aa7.37□□□□□ -1.23
NISCH-203ENST00000460759 C1orf195Q5TG92 126 aa7.37□□□□□ -1.23
NISCH-203ENST00000460759 HCG22E2RYF7 251 aa7.36□□□□□ -1.23
NISCH-203ENST00000460759 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.35□□□□□ -1.23
NISCH-203ENST00000460759 C8orf87E5RJ46 101 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-203ENST00000460759 TNXBP22105 4242 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-203ENST00000460759 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.34□□□□□ -1.24
NISCH-203ENST00000460759 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-203ENST00000460759 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-203ENST00000460759 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-203ENST00000460759 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-203ENST00000460759 CASC2Q6XLA1 102 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-203ENST00000460759 hDV103S1A0JD37 113 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NISCH-203ENST00000460759 MT1HL1P0DM35 61 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-203ENST00000460759 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NISCH-203ENST00000460759 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-203ENST00000460759 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-203ENST00000460759 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-203ENST00000460759 PCP4P48539 62 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-203ENST00000460759 SERP2Q8N6R1 65 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-203ENST00000460759 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-203ENST00000460759 LINC00313P59037 77 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-203ENST00000460759 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NISCH-203ENST00000460759 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NISCH-203ENST00000460759 OCR1Q9BZK8 76 aa7.23□□□□□ -1.25
NISCH-203ENST00000460759 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-203ENST00000460759 UQCRQO14949 82 aa7.21□□□□□ -1.26
NISCH-203ENST00000460759 COX7CP15954 63 aa7.21□□□□□ -1.26
NISCH-203ENST00000460759 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.21□□□□□ -1.26
NISCH-203ENST00000460759 H3BS24 57 aa7.19□□□□□ -1.26
NISCH-203ENST00000460759 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.18□□□□□ -1.26
NISCH-203ENST00000460759 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.17□□□□□ -1.26
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-203ENST00000460759 NDUFS5O43920 106 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-203ENST00000460759 C5orf47Q569G3 176 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-203ENST00000460759 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NISCH-203ENST00000460759 H3BPC8 53 aa7.12□□□□□ -1.27
NISCH-203ENST00000460759 MP68P56378 58 aa7.12□□□□□ -1.27
NISCH-203ENST00000460759 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.11□□□□□ -1.27
NISCH-203ENST00000460759 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.11□□□□□ -1.27
NISCH-203ENST00000460759 CCDC179H3BU77 68 aa7.09□□□□□ -1.27
NISCH-203ENST00000460759 KLKP1Q107X0 134 aa7.08□□□□□ -1.28
NISCH-203ENST00000460759 C20orf197Q8N268 126 aa7.08□□□□□ -1.28
NISCH-203ENST00000460759 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.08□□□□□ -1.28
NISCH-203ENST00000460759 C9orf92A6NGG3 77 aa7.07□□□□□ -1.28
NISCH-203ENST00000460759 H0Y9P7 68 aa7.07□□□□□ -1.28
NISCH-203ENST00000460759 A8MUU9 505 aa7.06□□□□□ -1.28
NISCH-203ENST00000460759 A0A0U1RQV1 116 aa7.05□□□□□ -1.28
NISCH-203ENST00000460759 NDUFC1O43677 76 aa7.05□□□□□ -1.28
NISCH-203ENST00000460759 PRR4Q16378 134 aa7.05□□□□□ -1.28
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.04□□□□□ -1.28
NISCH-203ENST00000460759 Q75L30 129 aa7.04□□□□□ -1.28
NISCH-203ENST00000460759 TPRXLQ17RH7 258 aa7.03□□□□□ -1.28
NISCH-203ENST00000460759 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
NISCH-203ENST00000460759 LINC00208Q96KT6 92 aa7.01□□□□□ -1.29
NISCH-203ENST00000460759 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7□□□□□ -1.29
NISCH-203ENST00000460759 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7□□□□□ -1.29
NISCH-203ENST00000460759 SNURFQ9Y675 71 aa7□□□□□ -1.29
NISCH-203ENST00000460759 LRP2P98164 4655 aa7□□□□□ -1.29
NISCH-203ENST00000460759 Q5W150 140 aa6.98□□□□□ -1.29
NISCH-203ENST00000460759 XP32Q5T750 250 aa6.97□□□□□ -1.29
NISCH-203ENST00000460759 RNF213Q63HN8 5207 aa6.97□□□□□ -1.29
NISCH-203ENST00000460759 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
NISCH-203ENST00000460759 H7BZZ5 65 aa6.94□□□□□ -1.3
NISCH-203ENST00000460759 TMEM258P61165 79 aa6.94□□□□□ -1.3
NISCH-203ENST00000460759 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.93□□□□□ -1.3
NISCH-203ENST00000460759 IGKV2-30P06310 120 aa6.92□□□□□ -1.3
NISCH-203ENST00000460759 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.92□□□□□ -1.3
NISCH-203ENST00000460759 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
NISCH-203ENST00000460759 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.9□□□□□ -1.3
NISCH-203ENST00000460759 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.9□□□□□ -1.3
NISCH-203ENST00000460759 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.88□□□□□ -1.31
NISCH-203ENST00000460759 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.86□□□□□ -1.31
NISCH-203ENST00000460759 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.85□□□□□ -1.31
NISCH-203ENST00000460759 FAM236CP0DP71 79 aa6.85□□□□□ -1.31
NISCH-203ENST00000460759 PCOTHQ58A44 107 aa6.83□□□□□ -1.32
NISCH-203ENST00000460759 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
NISCH-203ENST00000460759 SPINK7P58062 85 aa6.8□□□□□ -1.32
NISCH-203ENST00000460759 HRES1P13985 223 aa6.78□□□□□ -1.32
NISCH-203ENST00000460759 LPAP08519 4548 aa6.77□□□□□ -1.33
NISCH-203ENST00000460759 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.75□□□□□ -1.33
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.75□□□□□ -1.33
NISCH-203ENST00000460759 A8MUN3 132 aa6.72□□□□□ -1.33
NISCH-203ENST00000460759 DMAC1Q96GE9 116 aa6.71□□□□□ -1.34
NISCH-203ENST00000460759 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.71□□□□□ -1.34
NISCH-203ENST00000460759 MUC17Q685J3 4493 aa6.71□□□□□ -1.34
NISCH-203ENST00000460759 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NISCH-203ENST00000460759 ACYP2P14621 99 aa6.68□□□□□ -1.34
NISCH-203ENST00000460759 C4orf26Q17RF5 130 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms