RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.3□□□□□ -0.92
SUCLG2-202ENST00000460567 DNAH2Q9P225 4427 aa9.29□□□□□ -0.92
SUCLG2-202ENST00000460567 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.27□□□□□ -0.93
SUCLG2-202ENST00000460567 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.27□□□□□ -0.93
SUCLG2-202ENST00000460567 NDUFS5O43920 106 aa9.24□□□□□ -0.93
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP10-2P60368 255 aa9.24□□□□□ -0.93
SUCLG2-202ENST00000460567 C1orf195Q5TG92 126 aa9.24□□□□□ -0.93
SUCLG2-202ENST00000460567 MPLKIPQ8TAP9 179 aa9.24□□□□□ -0.93
SUCLG2-202ENST00000460567 PRO0628Q9UI54 55 aa9.23□□□□□ -0.93
SUCLG2-202ENST00000460567 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.21□□□□□ -0.93
SUCLG2-202ENST00000460567 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
SUCLG2-202ENST00000460567 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.21□□□□□ -0.93
SUCLG2-202ENST00000460567 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.2□□□□□ -0.94
SUCLG2-202ENST00000460567 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.2□□□□□ -0.94
SUCLG2-202ENST00000460567 LIMD2Q9BT23 127 aa9.2□□□□□ -0.94
SUCLG2-202ENST00000460567 PRR4Q16378 134 aa9.19□□□□□ -0.94
SUCLG2-202ENST00000460567 KMT2AQ03164 3969 aa9.18□□□□□ -0.94
SUCLG2-202ENST00000460567 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.18□□□□□ -0.94
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP10-1P60331 282 aa9.17□□□□□ -0.94
SUCLG2-202ENST00000460567 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.16□□□□□ -0.94
SUCLG2-202ENST00000460567 LINC00313P59037 77 aa9.13□□□□□ -0.95
SUCLG2-202ENST00000460567 FBN3Q75N90 2809 aa9.12□□□□□ -0.95
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A087X002 238 aa9.11□□□□□ -0.95
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.11□□□□□ -0.95
SUCLG2-202ENST00000460567 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.11□□□□□ -0.95
SUCLG2-202ENST00000460567 PCOTHQ58A44 107 aa9.1□□□□□ -0.95
SUCLG2-202ENST00000460567 COA5Q86WW8 74 aa9.1□□□□□ -0.95
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.08□□□□□ -0.96
SUCLG2-202ENST00000460567 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
SUCLG2-202ENST00000460567 BRK1Q8WUW1 75 aa9.07□□□□□ -0.96
SUCLG2-202ENST00000460567 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.06□□□□□ -0.96
SUCLG2-202ENST00000460567 SPINK1P00995 79 aa9.06□□□□□ -0.96
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.06□□□□□ -0.96
SUCLG2-202ENST00000460567 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.06□□□□□ -0.96
SUCLG2-202ENST00000460567 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.05□□□□□ -0.96
SUCLG2-202ENST00000460567 RPS29P62273 56 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SUCLG2-202ENST00000460567 TGP01266 2768 aa9.03□□□□□ -0.96
SUCLG2-202ENST00000460567 DNHD1Q96M86 4753 aa9.02□□□□□ -0.96
SUCLG2-202ENST00000460567 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.02□□□□□ -0.97
SUCLG2-202ENST00000460567 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SUCLG2-202ENST00000460567 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.01□□□□□ -0.97
SUCLG2-202ENST00000460567 Q5W150 140 aa9□□□□□ -0.97
SUCLG2-202ENST00000460567 PSPHP1O15172 72 aa8.99□□□□□ -0.97
SUCLG2-202ENST00000460567 ACYP2P14621 99 aa8.98□□□□□ -0.97
SUCLG2-202ENST00000460567 PKD1P98161 4303 aa8.97□□□□□ -0.97
SUCLG2-202ENST00000460567 A8MUN3 132 aa8.96□□□□□ -0.97
SUCLG2-202ENST00000460567 HRES1P13985 223 aa8.95□□□□□ -0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 XP32Q5T750 250 aa8.95□□□□□ -0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.95□□□□□ -0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.95□□□□□ -0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 Q5VV11 94 aa8.95□□□□□ -0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 Q75L30 129 aa8.95□□□□□ -0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 IGKV2-30P06310 120 aa8.94□□□□□ -0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.94□□□□□ -0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 PRR15LQ9BU68 103 aa8.93□□□□□ -0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.92□□□□□ -0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 DMAC1Q96GE9 116 aa8.91□□□□□ -0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.9□□□□□ -0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.89□□□□□ -0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.86□□□□□ -0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.86□□□□□ -0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A1B0GVY2 172 aa8.82□□□□□ -1
SUCLG2-202ENST00000460567 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.79□□□□□ -1
SUCLG2-202ENST00000460567 A6NED7 52 aa8.78□□□□□ -1
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.76□□□□□ -1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.76□□□□□ -1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.75□□□□□ -1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.75□□□□□ -1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.75□□□□□ -1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.74□□□□□ -1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.74□□□□□ -1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.73□□□□□ -1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.7□□□□□ -1.02
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SUCLG2-202ENST00000460567 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SUCLG2-202ENST00000460567 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.69□□□□□ -1.02
SUCLG2-202ENST00000460567 A8MUU9 505 aa8.67□□□□□ -1.02
SUCLG2-202ENST00000460567 LCA10Q71F78 164 aa8.65□□□□□ -1.02
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A1B0GU69 56 aa8.64□□□□□ -1.03
SUCLG2-202ENST00000460567 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.64□□□□□ -1.03
SUCLG2-202ENST00000460567 PMAIP1Q13794 54 aa8.62□□□□□ -1.03
SUCLG2-202ENST00000460567 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SUCLG2-202ENST00000460567 SPINK7P58062 85 aa8.57□□□□□ -1.04
SUCLG2-202ENST00000460567 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SUCLG2-202ENST00000460567 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.54□□□□□ -1.04
SUCLG2-202ENST00000460567 PKHD1P08F94 4074 aa8.52□□□□□ -1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 C9orf92A6NGG3 77 aa8.52□□□□□ -1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 A8MU10 97 aa8.52□□□□□ -1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 UQCR11O14957 56 aa8.51□□□□□ -1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 SEC61GP60059 68 aa8.51□□□□□ -1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.48□□□□□ -1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 A6NN06 94 aa8.48□□□□□ -1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 H3BS24 57 aa8.48□□□□□ -1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.47□□□□□ -1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP10-8P60410 259 aa8.46□□□□□ -1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 LCE3BQ5TA77 95 aa8.46□□□□□ -1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 Q8N1X5 172 aa8.45□□□□□ -1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.42□□□□□ -1.06
SUCLG2-202ENST00000460567 RYR2Q92736 4967 aa8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms